消灭南燕之后，刘裕想要继续扩大战果，可惜后院起火了。
就在刘裕北伐中原的时候，一个叫卢循的小子跳了出来，准备虎口拔牙，试试刘裕的胃口。
前面说过卢循是孙恩的妹夫。
卢循跟刘裕算是老相识了，卢循原来跟着孙恩作乱，孙恩败亡之后，众人推举卢循为主。卢循前前后后与刘裕交手三四次，都被刘裕击败。
卢循倒也命好，从海路进攻广东番禺，赶走刺史吴隐之，自己主持事务，自称平南将军。
当时桓玄已经有了不臣之心，随时都有可能造反。东晋朝廷的注意力都在桓玄身上，根本没有时间消灭卢循这伙叛军。
桓玄篡位之后，自己当了皇帝，后来又被刘裕跟何无忌等人打败了。
刘裕掌控了东晋朝廷后，放眼所及，也就剩下卢循这伙人了。
本来刘裕就想要消灭卢循，只是没有找到合适机会。
正好这时候，卢循有个姐夫叫徐道覆。此人野心不小，在广州待腻歪了，开始胡思乱想，徐道覆忽悠自己的小舅子。
具体怎么忽悠的我不清楚，但是卢循心动了。
卢循听从了徐道覆的建议，走上了一条不归路。
天欲使其灭亡，必先使其疯狂！
卢循刚开始走的很顺利，战败并杀死了刘裕的好兄弟，合作伙伴何无忌。
刘裕得知何无忌被杀，担心京师危险。于是甩开人马，单船过江。
公元410年4月，也就是平定南燕两个月之后，刘裕回到京城。自皇帝至普通百姓都松了口气。刘公在，天下安。
这里要说一个人，那就是刘毅。
此时的刘毅为抚军将军，刘毅此时对刘裕很是不忿，抗表南征卢循。
虽然刘裕再三劝阻，刘毅还是出征。其实，此时刘裕越是劝阻刘毅越是得出征。因为刘毅觉得这是刘裕担心自己抢功劳。结果一个月之后，刘毅的两万人马被击败。
刘裕击败卢循用了三招。
第一招：集中兵力击其要害，由于刘裕将京师主要兵力都带到了北方，因此京师的兵力只有千余人。
面对十万之众的卢循叛军，实力悬殊。刘裕紧急募兵。集中兵力，绝不分兵。这个战法是不是经常听到。
集中优势兵力，各个击破。
第二招：安排孙季高从海路端了卢循广州的老窝。失去了老巢的卢循，也就没了根据地，也就成了过街老鼠。
第三招：拒绝了诸葛长民和孟昶送晋帝到江北的建议。摆出必死之心，奖励将士殊死一战。
跟刘裕交手之后，卢循就像耗子见了猫，就再也没胜利过。
同年十二月，卢循战败。与刘裕生在同一个时代，真是命苦啊。
义熙七年，在收拾完卢循和徐道覆的残余之后，刘裕获封太尉，中书监。
不要问卢循和徐道覆最后有没有死，刘裕从来不接受投降。
灭刘毅，朝中最后一个敢叫板的人
刘毅，与刘裕同姓，沛国沛县人，至于是不是刘裕的远房亲戚，史书没说明。不过，刘毅是与刘裕最初谋划讨伐桓玄的人之一。
刘裕灭刘毅，实在没什么可讲述的。
从义熙八年四月刘毅为荆州刺史开始，到同年九月刘裕杀死刘毅的堂弟刘藩撕破脸皮，再到同年十月击败刘毅。
总共只用了半年时间，真正打仗也就一个月。而且这次刘裕自己只是谋划了一下，几乎没有上阵，王镇恶一个人就全部搞定了。
王镇恶乃前秦名相王猛的亲孙子。
王猛是谁，功盖诸葛第一人，帮助前秦天王苻坚，统一北方。遗憾的是，王猛跟诸葛亮一样，出师未捷身先死。
由于王猛英年早逝，才有了前秦百万雄狮惨败淝水。
如果王猛还活着，绝对不会发生淝水之战的惨剧，一代雄主苻坚也不会被姚苌干掉。
王镇恶是王猛的孙子，跟随父母逃难到了东晋，后来加入北府军，成为刘裕手下第一猛将。
王镇恶有勇有谋，消灭刘毅叛乱，易如反掌。
消灭刘毅后，刘裕又图伐蜀。
义熙八年十二月，因赏识朱龄石的军事才干和丰富经验，刘裕不顾他人反对，提拔他为益州刺史，命其率领臧熹，蒯恩，刘钟和朱林等将领，领兵二万人伐蜀。
刘裕曾与朱龄石讨论作战策略，认为谯蜀鉴于上一次刘敬宣伐蜀是从内水攻蜀，必会猜度晋军这次想由外水进攻，然而因想出其不意，仍然从内水进攻。
故此认为谯蜀应当会置重兵在涪城，于是决定晋军主力这次要从外水进军成都，以疑兵出内水。
为免军情外泄，刘裕特别将一封密函交给龄石，示意到白帝城时才能打开，故此大军自江陵出发后一直都不知循何道进军，谯蜀亦无从以晋军势态察知刘裕的图谋。
至白帝城时，朱龄石公布密函：“大军一律经外水攻向成都，臧熹、朱林在中水攻取广汉，命弱兵搭乘十多艘高舰由内水兵向黄虎。”
此后朱龄石就率大军加快速度行军。而谯蜀果如刘裕所想，设主力防备内水，命谯道福在涪城驻以重兵，别遣侯晖及谯诜领万余屯彭模，依水两岸建城垒作防御。
义熙九年，晋军成功灭谯蜀，巴蜀地区再入南方版图。刘裕加授羽葆，鼓吹及班剑二十人。刘裕灭蜀后，下令精简各地劳役，让人民得到休息。
早在义熙元年，仇池国氐王杨盛趁谯纵叛晋之机，发兵占据了无主的汉中。后遭后秦攻击，仇池又以地请降后秦。
义熙三年四月，仇池趁后秦西面战事受挫，便又统兵占据了汉中。
义熙九年，刘裕征蜀时，就图谋收复汉中。
当刘裕的西征大军攻占益州，灭掉西蜀政权后，便趁胜出击汉中反攻仇池守军，仇池一溃千里，被迫撤出汉中，献上降表，向刘裕称臣。
刘裕像自从东晋建立以来，朝廷的纲纪松弛紊乱，权贵之门互相兼并，老百姓流离失所，不能保持自己的产业。
刘裕掌握朝政以后，大力宣传规章制度，施行土断，禁止兼并。
会稽余姚的世族虞亮藐视国法，藏匿逃亡人员一千多人，对抗刘裕的改革。
刘裕铁腕诛灭了虞亮，罢免了包庇他的会稽内史，法办了大批涉事的士族及官员，一时士族豪强肃然，谨慎规矩，远近遵法守纪，再也不敢像以前一样胡作非为。
在这以前，各州所送的秀才，孝廉大多名不符实。
刘裕于是上表申明从前的规定，严整法纪，对地方选拔上来的人才专门进行考试，如有不实，一律严查，保证官员的选拔公正，唯才是举。
义熙十年，刘裕上表减轻徭役，让民休养生息。
以前，山湖川泽都被豪强士族所夺取，百姓打柴、采摘、打鱼、垂钓，都要强迫交税，刘裕上表下令一律禁绝，免征，还山于民，还地于民。
当时人们的居住很不统一，刘裕上表制定了条例，于是都依划分的土地为准，施行土断，只有徐、兖、青三州居住在晋陵的人不在划分的范围。
各个流民聚集的郡县，有许多进行了合并。
义熙八年刘裕征讨刘毅时，晋宗室司马休之占据荆州。他拥兵自重，由于先前就经营过荆州，颇得当地人心。
东晋荆、扬二州，地广兵强，又是建康门户，对中央形成巨大威胁，这不得不让刘裕有吞并荆、扬的雄心。
义熙十年，司马休之之子司马文思在建康招集轻侠，令刘裕十分厌恶。
后司马文思欲谋杀刘裕，被刘裕发觉，刘裕将司马文思交给司马休之，让他处置，实质就是要司马休之将其处死。
然而，司马休之并没有杀司马文思，只是上表废除其谯王爵位，并写信向刘裕道歉。这举动令刘裕对其大感不满，立刻就命江州刺史孟怀玉戒备。
义熙十一年，刘裕杀司马休之在建康的次子司马文宝及侄儿司马文祖，并出兵讨伐司马休之，自加黄钺，领荆州刺史。
司马休之则上表刘裕罪状，派兵抵抗。
当时雍州刺史鲁宗之自感不被刘裕所容，故与司马休之联结，合兵反击刘裕。
刘裕前锋徐逵之初战败于鲁轨，众将除蒯恩外皆战死，刘裕大怒。
然而当他到时，鲁轨及司马文思率军在悬岸峭壁上列阵，令刘裕难以登岸，刘裕与部将胡藩率兵冒险攀登。
司马文思等竟不能抵挡，刘裕就乘对方后撤的机会登岸进攻，终击溃司马休之的军队。
四月，刘裕击败司马休之军四万人，攻克江陵，直捣襄阳，荆、扬二州尽被刘裕吞并，司马休之及鲁宗之北投后秦。
自桓玄作乱以来，南方各大割据势力，全部灭亡，南方归为一统。东晋境内，全由刘裕势力统治。
刘裕在消灭司马休之后获剑履上殿，入朝不趋，赞拜不名的崇礼。
次年正月，更获加领平北将军、兖州刺史、都督南秦州诸军事。
刘裕一统南方，占领了徐州、南徐、豫、南豫、兖、南兖、青、冀、幽、并、司、郢、荆、江、湘、雍、梁、益、宁、交、广、南秦共二十二州。
