见唐军围在城下，薛仁果虽然凶残，但是与薛举不同的是，是个胆小怕死的人。整夜整夜的睡不着觉，唯恐唐军攻上城来，他一烦躁，便拼命灌酒，喝醉了就殴打士卒，城上士卒多有怨恨者。
于是趁他酒醉之时，城内各个小将带着士卒偷潜出城，投降唐军。
一连几天，薛仁果身边的士卒十去六七。
叛逃的军士如同潮水一样一发不可收拾，见拦不住了，薛仁果索性也就不拦了，整日在城中饮酒买醉。
坚守在一座孤城，没有粮食，没有外援，城内仅存的那点粮食也只够三五天，此时薛仁果身边能用的人几乎都跑光了，就剩下宗罗睺和他的本部兵马三千余人。
“从前父皇在世之日，那些将士对其无不言听计从，父皇一死，那些将士作鸟兽散，只有公真心助我”薛仁果见人走茶凉，不由得感慨道。
“臣从前只是一个草寇，幸得先皇慧眼识珠，蒙受先皇和皇上大恩，万死难报！今城虽破，有死而已！”宗罗睺知道投降也是一死，毕竟自己杀了那么多唐军，李世民进城肯定不会放过自己，左右都是一死，还不如跟薛仁果一起。
“真忠勇之士也”此时薛仁果知道自己快大祸临头，对以前打骂将士的行为后悔不已，可已然晚了。
三天以后，城内粮草断绝，薛仁果只得率众将献城投降，之前被薛举捕获的刘弘基等人也被放了出来。
打败薛仁果后，李世民押解薛仁果班师回朝，此时整个西北已经平定。留下散骑常侍姜募做秦州刺史。见姜募做的很好，安抚市民，令市民安居，李世民才放心班师。
李密奉皇帝命令，到幽州迎接李世民大军凯旋归来。
李密以前的将领程知节，秦琼等人已经归顺了长安，这些人本来就不满王世充的为人，这几个人接到李密的信后，听说李密在唐公账下为将，便投奔李密而来。
此时他们跟随李密到幽州迎接李世民，李密在瓦岗的旧部非常多，比较有名的裴仁基，罗士信，王伯当，秦琼，程知节，徐世绩，有几位是后来李世民亲封的凌烟阁二十四功臣。
“臣等参见秦王”见到李世民后，这些人跪下道。
李世民见到这些猛将，心中喜不自胜，下马奔到他们面前一一扶起道“将军快快请起”
“臣等在瓦岗落草之时，便听闻山西有一支仁义之师，军纪严明，爱民如子，今日一见，才知所言不虚，前几日旧主李密写信来欲让我等归顺唐公，我等早有此意，只恨无人引荐，幸得李密写信，我等才能得遇明主”徐世绩道。
李密也是初次见到李世民，见李世民不怒自威的气势，不觉心悦诚服。
“臣等奔走四方，飘零半世，不得已在瓦岗落草，未曾遇见如秦王者，今幸得明主，愿誓死相随”徐世绩上前道。
“臣等愿誓死相随秦王”秦琼程知节等人一起喊道。
“各位快快请起”李世民一激动不知道说什么好了。
此时的李密见自己的旧属对李世民这般臣服，脸色已经变了，不过一会儿就被他很好的掩饰了起来，这变化，还是没逃过李天河的眼睛，李密心中肯定不服气，虽然自己可以对李世民心悦诚服，但是部下哪怕是旧部对别人跟自己一样也不行，心胸狭窄。
李密在瓦岗时，就与秦琼等人不和，这会儿秦琼等人遇见李世民，便在也没人搭理李密了。
这时候，皇帝传旨的太监也赶到了幽州。
“李世民接旨，奉天承运，皇帝诏曰，李世民平叛西凉贼寇薛举薛仁果父子有功，论功行赏，逆贼薛仁果杀我中原将士，可搜其同党一一问罪，然后杀之！”
“吾皇万岁万岁万万岁！”
“皇上看来这是要把薛仁果西凉军赶尽杀绝啊！如此一来，西凉百姓必然动荡人心惶惶，对姜募的工作大为不利！”李世民接过圣旨，送走传旨的太监后对李天河道。
“薛举薛仁果滥杀无辜，这是他兵败最重要的原因，皇上没出过城坐井观天，难道秦王您不知道吗？在者皇帝下诏书，丞相还在朝中，为何这时候一言不发，您不解其意吗？”
“可这是抗旨啊”经过李天河这么一提醒，李世民顿时明白了，但是犹豫不决。
“自古便有将在外君命有所不受的道理！”李天河提醒道。
“好，但是薛举同党还是要处置的，不然会留下祸患”李世民随即命令手下将士，将薛举同党处置，剩下的人全部放掉。
代王早晚要废，西北这块地方必须保持安定，西北民风彪悍，若是不满，又得引起动荡。这时候，李渊仅仅控制了西北地区，西北地区有一个好处，就是可以自守，不怕外来侵略，除非自己内部先乱，隋朝就是个例子，不过李渊得到了西北贵族阶级的支持，不搞什么天怒人怨的事儿就不会乱。
李世民率领众将，押解薛仁果回到长安，将薛仁果关押在大牢中，于次日午时三刻上街游行后斩首！代王亲自率领百官观看薛仁果斩首仪式。
西北的百姓对薛仁果恨之入骨，次日游行于市街时，百姓怒骂薛仁果，并往其囚车里扔烂菜叶子等物品。
午时三刻一到，行刑官磨刀霍霍，听见自己上司发号施令，一刀将薛仁果人头砍了下来。
看到薛仁果人头落地，李密不仅想到如今自己的处境，他自打归降朝廷后，凭着自己招降秦琼程知节等旧部的功劳，就一直想和李渊平起平坐，本来李密就看不起代王，对朝廷给自己的待遇也不满。
又逢自己的诸多瓦岗旧部对李世民马首是瞻，李密心中多嫉妒有怨气，于是每日饮酒买醉，郁郁寡欢。
本来李密就是个心向天下的枭雄，如今岂能甘心久居人下，被他的部下王伯当发现，这王伯当也对朝廷不是很满意，认为朝廷任人唯亲，没给他一个他想要的官职。
于是这俩人密谋一翻决定叛逃，私自叛逃被捉回来就是死罪，得想一个能让皇上同意的办法。
经过这二人一番计划，想出了一个主意。
