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第10章 基因工程载体(4)

在双子叶植物中,TGMV的衣壳蛋白基因被Npt Ⅱ和Cat取代,并得到复制和表达,进一步说明GeNV是一种很有前景的转化载体。

烟草脆裂病毒(TRV)是一种单链RNA病毒,TRV基因组由两段独立的RNA组成,每一段都包装成棒状的病毒颗粒。其中较长的一段RNA因为不含有衣壳蛋白的编码序列,所以单独存在时只能产生不包装RNA分子。较短的RNA编码衣壳蛋白,但其复制必须有较长RNA的存在才能进行。利用这两种病毒颗粒共同感染植物,可以使病毒基因组得到正常的复制和表达。一般认为,利用RNA病毒作为转化载体首先单链的病毒RNA在反转录酶的作用下反转录成一条单链的CDNA,然后单链CDNA在DNA聚合酶的作用下形成双链CDNA,通过重组技术CDNA双链插入到克隆质粒中,使在克隆质粒中的病毒CDNA连同外源基因先转录成RNA转录体,再用此来感染植物。

3.8动物基因工程载体

将外源基因转入动物细胞,通常应用由动物病毒构建的一类载体。病毒具备异常有效的入侵细胞的能力,因此它是功能强大的基因转移载体。例如SV40病毒载体、杆状病毒载体在动物基因工程中已愈来愈普遍地应用。但是在构建病毒载体时,因为病毒本身的致病性,所以往往利用致病力弱的动物病毒或某些病毒的弱毒株进行改造,构建成基因载体。

动物病毒侵入动物细胞后,呈现裂解感染和整合性感染两种生长状态。裂解感染是依靠宿主细胞的酶和调控系统合成病毒核酸和结构蛋白,病毒DNA大量复制,在感染的细胞内有着大量的病毒DNA拷贝,病毒在细胞内装配成完整的子代病毒颗粒,释放到细胞外,扩大感染,感染细胞则大多数因代谢障碍而死亡。整合性感染是病毒核酸整合到细胞染色体中,随着细胞DNA的复制而扩增。病毒DNA的序列中往往具有几个很强的启动子,它可使排列在其后方的基因高效表达。如果将外源基因插入在病毒DNA强启动子的后方,那么随病毒DNA在细胞内大量复制的同时,也将得到外源基因的高效表达。

3.8.1SV40病毒载体

SV40是一种猿猴空泡病毒,环状双链DNA分子,全长5241bp。根据基因组内转录的时间顺序和方向,分为两个转录区域,即早期转录区和晚期转录区。当它感染猿猴细胞时,其DNA进入细胞核后,开始依次进行早期转录、DNA复制、晚期转录。在早期转录中产生T抗原和t抗原。当细胞内T抗原和t抗原积累到足够时,T抗原启动DNA复制,并启动顺时针方向的转录。在晚期转录中,产生病毒外壳蛋白VP1、VP2、VP3,并与新复制的病毒DNA装配成病毒颗粒,细胞内病毒颗粒达到105个时,细胞破裂,释放出病毒颗粒。此过程称为裂解感染,这种敏感细胞称为受纳细胞。当SV40感染啮齿动物细胞(如仓鼠、小鼠细胞)时,DNA整合到宿主细胞的染色体DNA上,随染色体DNA复制而复制,不会使细胞破裂,最终导致细胞癌变,不产生病毒颗粒,这个过程称为非裂解感染,这类细胞是非受纳细胞。SV40致瘤的原因主要是其基因组整合入宿主基因组,可以整合病毒基因组的某些片段,也可以整合10拷贝以上的病毒基因组;但至今人们对整合机制还不清楚。

SV40病毒基因组中,早期区域和晚期区域是相对独立的转录单元,因此可以有晚期区被取代和早期区被取代两种类型的取代型载体。SV40颗粒包装对分子大小有严格限制,构建载体只能是取代型的,被取代的DNA不能超过基因组全长的30%。

对于晚期区取代型载体,由于缺失晚期区域,不能将重组DNA包装成新的病毒颗粒,因此这样的克隆载体必须与辅助病毒一起感染受体细胞。辅助病毒是一种不产生T 抗原,但能产生外壳蛋白的突变体。在受体细胞内,依赖辅助病毒产生的外壳蛋白,重组DNA包装进新的病毒颗粒。

对于早期转录区取代型载体,由于缺失早期区域,不能产生T 抗原,缺失复制功能,必须具有T 抗原互补功能的辅助病毒,或者建立含SV40早期转录区的辅助细胞系(如COS、HFS细胞系)。一般用后者把SV40早期转录区DNA序列整合到敏感动物细胞基因组中,使其有效表达T 抗原。当早期区DNA序列被外源DNA取代的重组SV40DNA导入这种细胞时,T抗原得到互补,重组SV40DNA能进行有效复制。

3.8.2反转录病毒载体

反转录病毒又称逆转录病毒,是一类RNA病毒。该类病毒大多数具有致瘤性,故又称为RNA肿瘤病毒。其基因组RNA进入宿主细胞后通过自身编码的反转录酶合成双链DNA,这种DNA能随机整合到宿主细胞基因组中,随宿主细胞基因组一起复制或转录,转录产生的正链RNA可以装配成病毒颗粒,也可以不发生装配,成为病毒蛋白合成的模板。

反转录病毒的基因组为两条相同的单链RNA组成的二聚体,通常长为8~10kb,其两端含有相同的结构,即长末端重复序列(long terminal repeat,LTR),其长度为几百个碱基。逆转录病毒能在宿主细胞中永久性地表达外源基因,具有构建载体的良好特性。此外,它能感染几乎所有类型的细胞,受体细胞的范围广泛。

反转录病毒载体的类型,早期构建的多为单基因载体,是以单个外源基因取代反转录病毒的反式作用序列。由于这种载体的外源基因表达只受LTR 中病毒的唯一启动子调控,因而应用受到局限。后来构建的并被广泛应用的是多基因载体,例如双表达载体、自灭活载体、自分解载体等。双表达载体保留了大部分的病毒顺式作用序列。病毒载体携带2个外源基因,均处于5′端LTR 中启动子的控制下,这种载体的特点是提供了病毒基因转移、表达的顺式作用序列,即5′端LTR 中的启动子、增强子、3′端LTR 中的多聚A 信号和内含子剪切位点。但是转移的基因只在病毒启动子有活性的细胞中才能表达。自灭活载体通过缺失LTR中的部分启动子和增强子,产生的自灭活载体在感染宿主细胞后形成的前病毒DNA不能进行转录,外源基因由自身融合的启动子控制表达,因而不会发生插入激活作用。此类载体的特点是比较安全,但不足之处是大多数载体产生病毒感染的滴度较低,不能进行有效的基因转移。自分解载体含有反转录病毒的内部附着序列,病毒基因组的结构不完整,病毒复制两次后前病毒DNA整合到宿主基因组中,外源基因的内部启动子控制进行特异的表达。此种载体不能产生复制性病毒粒子,因而也是一种安全的反转录病毒载体。

以反转录病毒作载体进行基因转移具有基因转移效率高、病毒感染力强等优点,而且反转录病毒有广泛的宿主范围,不仅适用于单层细胞,也适用于悬浮培养的淋巴细胞、前髓细胞及造血干细胞等多种骨髓来源的细胞;经特殊构建的反转录病毒载体是缺陷型,不易产生感染性病毒粒子,比较安全。不过,有的反转录病毒载体可能具有潜在激活癌基因的作用。

3.8.3痘苗病毒载体

痘苗病毒的基因组是一个线性双链DNA,长约185kb,其中有一个28kb 的区域是病毒复制的非必需区,可以被外源基因取代。痘苗病毒能在宿主的细胞质中独立地复制和转录,高度稳定,宿主范围广,因此,可以作为良好的载体。痘苗病毒载体的构建需要采用同源重组的方法。重组痘苗病毒表达外源基因,需要在基因两端组装上胸腺嘧啶核苷激酶的tk 基因或ha基因同源重组,将外源基因整合到痘苗病毒基因组上。痘苗病毒载体通常具有三个主要成分:痘苗病毒的调控序列、胸腺嘧啶核苷激酶基因(tk 基因)以及位于tk 基因中供外源基因插入的克隆位点,利用tk 基因插入失活作为选择标记。

痘苗病毒载体的主要用途是构建痘苗病毒活疫苗。迄今为止,用痘苗病毒载体表达的外源基因有:乙型肝炎表面抗原基因、流感病毒血凝素基因、狂犬病毒表面糖蛋白基因,以及单纯疱疹病毒、EB 病毒、水泡性口炎病毒、伪狂犬病毒和疟原虫等的抗原基因。

3.8.4腺病毒载体

腺病毒是一种二十面体的颗粒线状双链DNA病毒,其基因组大小为32~36kb,分为哺乳动物和禽类两个属。在线性DNA两端各存在1个含103~162bp 的反向末端重复序列(inverted terminal repeat,ITR),因此变性后的两条链可能分开成单链,彼此形成一个茎环结构。ITR为病毒DNA复制的起始位点。

野生型腺病毒容纳外源DNA的最大容量为2kb。如果将病毒的非必要区域删去,用外源DNA取代,可以增加病毒接受外源DNA的容量,又不影响重组病毒的复制和包装。理论上,基因组除了两端各约500bp 的序列结构是复制和包装所必需的,其他部分均可以被外源DNA取代。人腺病毒具有易感染性,宿主范围广,而且外源DNA不会整合到宿主染色体上,具有较高的安全性,已成为较有前途的基因转移载体之一。

腺病毒载体在转移和表达外源基因方面具有许多优点:①其基因组较小,易于操作;②有多个外源基因插入位点;③腺病毒DNA不整合到宿主染色体上,不会引起插入突变;④腺病毒致病性小,重组腺病毒结构稳定;⑤重组病毒滴度高。

本章小结

基因工程载体是指基因工程中携带外源基因进入受体细胞的“运载工具”,它的本质是DNA复制子。作为基因工程载体必须具备3个基本条件:①能在宿主细胞内进行独立和稳定的自我复制。②具有合适的限制性核酸内切酶位点。③具有合适的选择标记基因。使用最多的基因工程载体是质粒载体和噬菌体载体。

质粒载体主要有克隆质粒载体、表达质粒载体、穿梭质粒载体等。常用的克隆质粒载体是pBR322及pUC 系列。噬菌体载体主要有λ噬菌体载体和M13噬菌体载体。它们的克隆容量大于质粒载体,用于基因文库的构建。插入型λ噬菌体载体的克隆容量小于取代型λ噬菌体载体,前者只能克隆10kb 以下的外源DNA片段,后者可克隆20kb 左右的外源DNA片段。M13噬菌体载体在制备单链DNA中有重要用途。黏粒载体是一类含有λ噬菌体的cos 序列的质粒载体,它的克隆容量较大,一般为35~45kb,主要用于真核基因文库的构建。但上述载体的克隆容量有限,不能满足基因组计划的大片段DNA的克隆,因此,构建了一系列的人工染色体。YAC 的克隆容量为100~2000kb。BAC 的克隆容量可达300kb。利用植物病毒构建了病毒转化载体,但转移的外源基因不能整合到植物基因组上,以游离拷贝的形式存在。动物基因工程载体主要来自于动物病毒,用于基因高效表达和基因治疗的研究。相对于植物病毒转化载体来说,动物病毒载体大多数都能将外源基因整合到宿主基因组上,随宿主染色体的复制而遗传给后代,主要有SV40病毒载体、反转录病毒载体、痘苗病毒载体、腺病毒载体等。

思考题

1.构建基因工程载体的基本原则是什么?

2.构建λ噬菌体载体的主要内容是什么?

3.M13噬菌体载体的主要用途是什么?

4.黏粒载体具有哪些优缺点?

(邹克琴)

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