李茂贞恃勋恣横，擅兵窥伺，颇干朝政，萌问鼎之志。既而逐泾原节度使张球、洋州节度使杨守忠、凤州刺史满存，皆夺据其地，奏请子弟为牧伯，朝廷不能制。大臣奏议言其过者，茂贞即上章论列，辞旨不逊，奸邪者因之附丽，遂成朋党，朝政于是隳焉。昭宗性英俊，不任其逼，欲加讨伐。乃命宰臣杜让能调发军旅，讨伐李茂贞。杜让能对昭宗说“茂贞地大兵强，而唐力未可以致讨；凤翔又近京师，易以自危而难于后悔，佗日虽欲诛晁错以谢诸侯，恐不能也。”昭宗不听，杜让能率禁军三万人，直逼凤翔。李茂贞以六万兵马截击，禁军大败，师未越境，为茂贞所灭。李茂贞乘胜进屯三桥，京师大震，士庶奔散，昭宗乃诛中尉西门君遂、李周潼等谢之。李茂贞严兵不解，势将指阙，抗言：“杜让能挑拨军辰关系，诛之方罢”。让能自知必死，对昭宗说：“臣请归死以平国难。”昭宗流泪说：“朕与卿决矣！”随即将杜让能贬为雷州司户。李茂贞率军入京师，再向昭宗施压，昭宗不得已乃赐死杜让能及杜弘徽兄弟。及韦昭度、李谿为相，李茂贞表昭度等无相业，不可置之台司，恐乱天下。昭宗诏报说：“军旅之事，吾则与籓臣图之，朝廷命相，出自朕怀。”李茂贞于是心怀不满。
王重荣性悍酷，多杀戮，少纵舍。尝植大木河上，内设机轴，有忤意者，辄置其上，机发皆溺。尝辱部将常行儒，行儒怨之。光启三年，常行儒引兵夜攻府，重荣亡出外，诘旦被杀。常行儒拥立王重盈，朝廷于是任命王重荣弟王重盈为护国节度使，王重盈的儿子王珙为权知陕虢留后。王重盈死后，王珙和王珂争留后，护****拥立王重荣的儿子王珂继任，王珙兵强，并且向李茂贞求助。王珂也向朱温和李克用求援。王珙写书对朱温说：“珂非吾兄弟，家之苍头也。小字虫儿，安得继嗣？”时，朱温正在和杨行密撕杀，无心西顾，王珂遣使求援于太原，上章说：“亡父与陇西郡王有兴复之功，请求郡王相助。”李克用保荐王珂于朝，李茂贞却请授王珙为河中节度使，昭宗诏报说：“太原表先至，已许王珂，不可追改。”李茂贞大怒。
时，邠宁节度使王行瑜求取尚书令之职。中书门下平章事韦昭度奏道：“太宗皇帝曾任尚书令，此后臣子无人得授此职。郭子仪建有大功，尚且不肯接受，何况王行瑜。”昭宗乃止之，只加封王行瑜为尚父，以作安慰。户部侍郎同中书门下平章事崔昭纬内结宦官，外通藩镇，李磎拜相，崔昭纬暗中挑拨，对王行瑜道：“韦昭度前番不让您担任尚书令，现在又引荐李磎为相，这是要蛊惑圣听，恐怕对您不利。”王行瑜便联合凤翔节度使李茂贞，多次上表皇帝，要求罢免李磎、韦昭度。昭宗不批。李茂贞于是联合王行瑜、韩建称兵入觐，京师震恐，昭宗御楼待之，李茂贞等抗表请杀宰相韦昭度、李谿以谢天下，移王珙于河中。昭宗无奈把韦昭度、李谿贬到外地，两人在出任时被王行瑜所杀。昭宗大惧，答应王珙为河中节度使，李茂贞乃引兵还，既还，留其假子李继鹏宿卫，实为控制昭宗。时李克用上表，请讨三镇以宁关辅。昭宗许之，太原之师至河中，李继鹏与中尉景宣之子继晟迫车驾幸凤翔，昭宗说：“太原军未至，銮舆不可辄动，朕与诸王固守大内，卿等安辑京师，如太原实至，吾可以方略制之。”李继鹏与景宣、中尉骆全权因燔烧东市，中夜大噪。昭宗登承天门楼避乱，令捧日都将李云守楼下，李继鹏率众攻云。昭宗凭轩慰谕，继鹏弯弧大呼，用弓弩射昭宗，矢拂御衣，中楼桷。侍臣护昭宗下楼还宫，继鹏即纵火攻宫门。左军指挥使王行实，王行瑜之弟，与刘景宣欲劫天子幸邠州。两军相攻，纵火烧内门，烟火蔽天。天子急诏盐州六都兵士，令追杀乱兵，左右军退走。昭宗诏诸王谋其所向，李云奏说：“事急矣，请且幸臣营。”云乃与扈跸都将李君庆卫昭宗出启夏门，驻华严寺，次石门。王行瑜、李茂贞声言自来迎驾，天子惧，车驾幸渭桥。
李克用听闻长安大乱，于是起兵，大军来到河中，王珙和其弟晋州刺史王瑶和兵抵抗，李克用拔绛州，斩瑶，王珙乃退守保义城。李克用和王珂合兵，进收同州，同州节度使王行约乃王行瑜之弟，弃城奔京师投靠王行瑜。李克用探知昭宗幸石门，遣判官王瑰奉表奔问，昭宗以李克用为行营都统，令与王珂同讨邠、凤。时李克用方攻华州，俄闻李茂贞领兵士三万至盩啡，王行瑜领兵至兴平，欲往石门迎驾，乃解华州之围，进营渭桥。李克用至渭北，泾帅张铛已领步骑三万于京西北，扼邠、岐之路。李茂贞惧，斩继鹏、继晟，上表待罪，昭宗原谅之，李克用说：“不诛李茂贞，关辅无由宁谧。”时附茂贞者奏云：“若太原尽殄邠、岐，李克用必入关辅，京师忧未安全也。”昭宗乃诏李克用与茂贞和。李克用遣史俨将三千骑往石门扈驾，遣李存信、李存审会鄜延之兵攻行瑜之梨园寨。昭宗削夺行瑜官爵，以李克用为天下兵马都招讨使，以鄜州李思孝为北面招讨使，以泾州张铛为西南面招讨使。又遣延王、丹王赐李克用御衣及大将茶酒、弓矢，命二王兄事李克用。延王传昭宗密旨：“日昨非卿至此，已为贼庭行酒之人矣。所虑者二凶缔合，卒难翦除，且欲姑息茂贞，令与卿修好，俟枭斩行瑜，更与卿商量。”李克用上表，请驾还京。令李存节领二千骑于京西北，以防邠贼奔突。辛亥，昭宗还宫，加李克用守太师、中书令、邠宁四面行营都统。册拜韩建为太傅，进封许国公，并赐铁券，以牵制李克用。
王行瑜弟兄固守梨园寨，李克用攻之甚急，李茂贞遣兵万余来援行瑜，营于龙泉镇，茂贞自率兵三万迫咸阳。李克用奉请诏茂贞罢兵，兼请削夺茂贞官爵。昭宗下诏说：“茂贞勒兵，盖备非常，寻已发遣归镇。”又言：“李茂贞已诛李继鹏、李继晸，卿可切戒兵甲，无犯土疆。”李克用请赐河中王珂旌节，三表昭宗许之。又表李罕之为副都统。
十月丙戌，李存信于梨园寨北遇王行瑜军，斩首千余级，自是贼闭壁不出。王行瑜闭壁自固，李克用令李罕之昼夜急攻，贼军乏食，拔营而去。李存信与罕之等先伏军于厄路，俟贼军之至，纵兵击之，杀戮万计。是日，收梨园等三寨，生擒行瑜之子知进，并母丘氏、大将李元福等二百人，送赴阙庭。王行约、王行实见王家不保，烧劫宁州遁走，宁州守将徐景乞降。李克用表苏文建为邠州节度使，且于宁州为治所。王行瑜以精甲五千守龙泉寨，李茂贞出兵来援，为李罕之所败，邠兵遂弃龙泉寨而去。王行瑜复入邠州，李克用大军进逼其城，行瑜登城号哭说：“行瑜无罪，昨杀南北司大臣，是岐帅将兵胁制主上，请治岐州，行瑜乞束身归朝。”李克用报说：“王尚父何恭之甚耶！仆受命讨三贼臣，公其一也。如能束身归阙，老夫未敢专命，为公奏取进止。”行瑜惧，弃城而遁。李克用收其城，封府库，遽以捷闻。王行瑜将家属五百人逃到到庆州界，为部下所杀，传首阙下。李克用既平行瑜，还军渭北。
王行瑜被诛，李克用班师后，李茂贞怨望骄横如故。昭宗想把李茂贞调离其老巢，制授其为东川节度使，命通王、覃王治禁军于阙下，如茂贞违诏，即讨之。李茂贞惧，将赴镇。王师至兴平，夜自惊溃，李茂贞因出乘之，官军大败。昭宗听闻禁军大败，车驾仓猝幸渭桥。韩建的谋士李巨川听闻韩全诲逼迫昭宗皇帝移驾凤翔，乃对韩建说：“天子乃天下之主，夹天子令诸侯，五霸之业也。”韩建大喜，探知昭宗车驾次富平，将幸河中，韩建奉表迎驾，俄自至渭北，恳乞车驾东幸，昭宗许之。昭宗至华下，百官士庶相继而至。昭宗寻加王建兼中书令，充京畿安抚制置等使，又兼京兆尹、京城把截使。昭宗久在华州，思还宫掖，每花朝月夕，游宴西溪，与群臣属咏歌诗，歔欷流涕。韩建每从容奏说：“臣为陛下修营大内，结信诸侯，一二年间，必期兴复。”昭宗信之，乃以建兼领修创京城使，建自华督役辇运工作，复治大明宫。
昭宗身边八个王爷见韩建有意扣留昭宗，于是乃谋杀建。没想到韩建已在八王中安插了奸细，奸细告八王谋叛，韩建乃囚八王于别宅，放散随驾殿后军二万人，杀捧日都头李筠。自是昭宗益微，宿卫之士尽矣。韩建以兵围十六宅，把通王以下十一王全部杀害于石堤谷，以谋逆之罪上报昭宗。韩建又杀昭宗亲信太子詹事马道殷、将作监许岩士，贬宰相硃朴。昭宗惧怕，乃令韩建寻兼同州节度使，升华州为兴德府，以韩建为尹。
李茂贞之众因犯京师，焚烧宫阙，大掠坊市而去，自此长安大内尽为丘墟矣。昭宗复命宰臣孙偓统军进讨，韩建谏止，昭宗令茂贞上章请雪。李茂贞鉴于韩建阻挡和惧怕李克用，乃上书请罪，昭宗赦免之，加其为尚书令、岐王，以平衡关中各诸侯。昭宗车驾回京，册拜韩建为太傅，进封许国公，并赐铁券。韩建对李茂贞说：“天子是我们两人的天子，河东李克用和河南朱温强大，我们想永保富贵就要携手合作。”李茂贞于是和韩建联合控制京师，要求昭宗封王珙为河中节度使，昭宗许之，李茂贞令其子李继筠以兵宿卫京师，乃还兵。
昭宗铲除刘季述的势力后，以宦官韩全诲调典禁军，唐昭宗因为宦官专权，骄横跋扈难以驾驭，常常怀有诛灭剪除他们的想法。宰相崔胤更是忌恨这些专权的宦官。唐昭宗对崔胤：“凡是有机密的奏章，一定装入囊袋中并且密封好，呈送给朕，一定不要在便殿面奏。”宦官韩全诲等得知这一事情后，在京城访求到几十个美女进献给昭宗，以作为自己的耳目。韩全诲通过这些美女暗中掌握昭宗和大臣密谋的事情，昭宗却没有觉察韩全诲等人的阴谋。韩全诲于是和众宦官谋，说：“崔胤得势我等死无葬身之地。”于是把奸细寇同华安排在崔胤身边，并用重金和甜言蜜语贿赂在朝外的藩镇节度使们作为自己的靠山，准备把宰相崔胤这个眼中钉拔除，当时正值伏腊祭祀聚宴，崔胤对昭宗痛哭流涕，说：“宦官专权，祸害朝廷，皇上如不立即处理，危在旦夕”。恰巧汴人寇同华得知崔胤的谋划，并密告给韩全诲。韩全诲于是调动宫中禁军，联合李继筠，摆开阵势，逼迫昭宗皇帝移驾凤翔，以投靠李茂贞。宰相崔胤于是联络朱温，请其起兵入关，协助诛灭宦官。
