通常主根对侧根的生长有一定的抑制作用，特别是在根端附近更为明显。假若将主根的根端除去，则侧根迅速长出。在园艺和蔬菜栽培上，常采用幼苗移栽的办法，就是将伸展到耕作层以下的主根切断，促使大量侧根的发生，以便在土壤表层吸收更多的水分和养料。
不定根的外形、结构与功能同其他的根没有差别，只是它们的发生部位不是在正常形成侧根的部位，而是从植物体的其他部位，如茎、叶、地下茎及较老的根部产生。另外也可从人工离体培养的组织器官中发生。
不定根一般由靠近维管组织周围的束间薄壁组织发生。在老的木本茎中，不定根原基则起源于靠近形成层的射线细胞，甚至有的直接从形成层产生。在插条、植物受伤部位或离体组织、器官培养中，不定根通常从愈伤组织中发生。
在林业和园艺上，对柳树、杨树、葡萄、月季和秋海棠等植物的枝条扦插、叶插或压条等无性繁殖中，均能产生大量不定根。但也有些植物在同样条件下不易形成不定根，如用赤霉素等植物激素处理后，仍可诱导出不定根来。在植物细胞，组织或器官的离体培养中，应用吲哚乙酸、萘乙酸和2，4-D等植物生长调节物可诱导不定根的发生，以获得完整的再生植株。
五、变态
有些植物的根，在形态、结构和生理功能上，都出现了很大的变化，这种变化称为变态。变态是长期适应环境的结果，这种特性形成后，相继遗传，成为稳定的遗传性状。常见的变态根有肉质根、块根、气生根和支柱根。
1.肉质根
如萝卜、胡萝卜、甜菜的变态根。它们是由主根以及胚轴的上端等部分膨大形成，在肥大的主根中，薄壁组织细胞内贮存大量养料，可供植物越冬后和次年生长之用。这部分也是食用的部分。这些肉质根虽然外表相似，但内部结构是不同的。在萝卜的肉质根中，大部分为次生木质部，其中具发达的木薄壁组织，储藏着大量的营养物质。胡萝卜肉质根的大部分，属于次生韧皮部，丰富的营养物质储藏在发达的韧皮薄壁组织中。甜菜根除了具正常的次生结构以外，在维管组织的中心外面，由同心圆状排列的形成层产生，它们是从中柱鞘和韧皮部衍生的，形成层能产生出几层维管组织细胞，以及在木质部束和韧皮部束之间，还有大量径向排列的薄壁组织，其发达程度，与甜菜的含糖量有着密切的关系。
2.块根
植物侧根或不定根膨大而成。这种变态根不像萝卜等，每株只形成一个肉质根，而是一株可以形成许多膨大的块根。常见的如甘薯的块根。它是由茎节间上的不定根所形成，这些不定根先是正常的次生生长，其中次生木质部由大量的木薄壁组织和分散排列的导管所组成，然后在导管周围的一些薄壁组织细胞，恢复分生能力，发育为形成层。形成层活动产生导管、筛管、乳汁管和大量的薄壁组织细胞。
3.气生根
气生根是是生长在空气中的一种变态根，如榕树的枝干上长出许多不定根，可以一直垂入到土壤。此种气生根没有根毛和根冠，不能吸收养分，但能吸收空气中的水分，也有呼吸的功能。由于气生根扎入土内，起了支持作用，使榕树树冠得以发展，故有“独木成林”之感。热带森林中的许多兰科植物也有发达的气生根，它们附生在树的枝干上，靠气生根吸收空气中的水分。气生根因作用不同，又可分为呼吸根、支柱根、攀缘根和吸器。
一些生活在沼泽、海滩的植物，其地下部分生活在缺氧环境中，如落羽杉和海桑树等，在树的主干附近，从土壤或水中伸出许多根来，这些根的结构特殊，内部有许多气道，这种根主要是行呼吸和通气作用，故有呼吸根或通气根之称。
4.支柱根
最典型的例子是玉米，从茎基部的几个节上长出许多不定根，并向下伸入土中，不仅能吸收水分和无机盐，而且此种根的机械组织发达，能起到稳固茎干的支持作用。
常春藤和凌霄花等植物的细长茎上，生有无数不定根，以其将自身固定在墙壁或其他植物茎干上，这类变态根叫做攀缘根。
营寄生生活的被子植物，如菟丝子，它的茎缠绕在寄主的茎上，并生出许多吸器，吸器伸入寄主茎的内部组织，它们的维管组织与寄主的维管组织相连接，以此可吸收寄主的水分和养料。
六、菌根和根瘤
许多植物的根系与土壤中的微生物建立了共生关系，在植物体上形成菌根或根瘤。某些种子植物的根与土壤真菌共生所形成的共生体，称为菌根。根据真菌对寄主皮层细胞侵染的情况，又分为两种类型：①外生菌根，真菌形成一鞘层，即菌丝罩，整个包裹着幼根的外部，只有少数菌丝侵入到根皮层的胞间隙中，如松树、栎树等。②内生菌根，真菌形成不明显的罩子，而大部分菌丝均侵入到根部皮层的细胞内部，如兰属、草莓等。菌根真菌的菌丝如同根毛一样，起吸收水分与矿质营养的作用。还能将土壤中的矿质盐和有机物质，转变为易于寄主吸收的营养物质，以及可制造维生素等，供给根系。而寄主植物分泌的糖类、氨基酸及其他有机物质又可供真菌生活，因此两者为共生关系。
豆科植物与根瘤细菌的共生体，即为根瘤。根瘤的维管束与根的维管柱连接，两者可互通营养，一方面豆科植物将水分及营养物质供给根瘤细菌的生长；另一方面根瘤细菌也将固定合成的铵态氮，通过输导组织运送给寄主植物。此外，在植物界中还有一些非豆科植物，如早熟禾属、看麦娘属和胡颓子属等十几个属一百多种植物也能结瘤固氮。
七、生理功能
根不仅是一个吸收水分与矿质盐的主要器官，而且也是一个转化和合成营养的地方，代谢活动异常活跃。
1.根对水分的吸收
根系从土壤中吸收水分的最活跃部位，是根端的根毛区（即成熟区）。通常仅由根系的活动而引起的吸水现象，称为主动吸水，而把由地上部分的蒸腾作用所产生的吸水过程，称被动吸水。当植物在蒸腾作用微弱的情况下，主动吸水才是植物吸水的主要原因。土壤水分经根毛和表皮向内扩散的时候，首先从皮层的细胞壁或胞间隙等质外体途径，即“自由空间”通过，到了内皮层，因其细胞的径向壁与横向壁上具栓质的凯氏带，水分不能通过，这时水分只能经由内皮层细胞中的质膜和液泡，即共质体的途径。水分经内皮层细胞进了维管柱以后，则又属质外体的途径，直至木质部的导管。
2.根对矿质营养的吸收
根系从土壤中吸收矿物质是一个主动的生理过程，它与水分的吸收之间，各自保持着相对的独立性。根部吸收矿质元素最活跃的区域是根冠与顶端分生组织，以及根毛发生区。土壤中的各种离子先吸附在根表面，然后经能量转换与酶的作用，通过细胞质膜进入细胞中，再由细胞间的离子交换、进入维管柱的木质部导管。
3.根对地上部分生长发育的影响
根系不仅将植物的地上部分牢固地固着在土壤中，从土壤吸收大量水分和矿质营养，供给地上部分生长发育的需要，而且根部还能进行一系列有机化合物的合成转化。其中包括有组成蛋白质的氨基酸，如谷氨酸、天门冬氨酸和脯氨酸等；各类植物激素，如吲哚乙酸、细胞分裂素类，以及少量的乙烯等。根还能从土壤中吸收二氧化碳并固定，借助于特种酶和丙酮酸的作用，转变为苹果酸，然后转运到地上部分，参加叶子的光合作用。
根在其生命活动中，不断向周围环境分泌出许多物质，如氨基酸、磷脂、维生素、有机酸、碳水化合物、单宁、植物碱，以及过氧化物酶、磷酸酯酶、转化酶、淀粉酶、纤维素酶、蛋白酶与脂肪酶等多种胞外酶。此外，根还能分泌二氧化碳、磷、钙、钾、硫等无机物。这些根的分泌物不仅对植物本身具有重要的生理作用，而且对根周围的微生物也有明显的影响。
八、根的经济用途
在人类生活中，许多植物的根部已被广泛利用，如甘薯、豆薯、葛藤、木薯等肥大的块根，内含丰富的淀粉，可供人们食用或工业用。萝卜和胡萝卜的根部，是人们常食的蔬菜。甜菜的块根是制糖工业的原料。人参、乌头、甘草、地黄和麦冬等根部是著名的中药材。雷公藤、百部和鱼藤等根部富含生物碱或鱼藤酮，对植物病虫有毒效，可作为防治作物病虫害良好的植物性农药。茜草的根能提取鲜红色的染料，可用于染动植物性纤维及食用色素。
