为了能够团结抗战，全力办学，唐生智在办学之初就定下一条：禁止一切党派帮会在校内活动。对前来应聘的教师和来校读书的学生，都事先做了声明。然而，国民党当局已明令中等学校的训育主任和训导员，均须由国民党员担任。而且规定各中学要建立三青团分部。对此，唐生智采取了拖延应付的办法。一开始，他吩咐办事人员佯装不知。刚好湖南地方长官多属唐的旧部，看在唐的面子上，也未为难。后来，有关部门硬要向耀祥中学委派军训教官、训导主任、公民课教师。唐生智以校规相搪塞，仍不奏效，便坦率声明，党务组织要么参加县党部活动，要么在校外小茶馆聚会，不得拉学生参加。至于纪念周会、公民课、军训课之类的活动，他对来者声称：我乃国民党中央执行委员，什么叫三民主义，该如何纪念总理，我比你们更清楚，体会得更深刻。我本人在校的话，就由我来主持、讲授。如果我不在校，则按我安排的内容、要点讲授。唐生智力图我行我素。
国民政府教育部长亲自签署意见，派黄人少将任耀祥中学军训教官，美其名曰校长为一级上将，必须派一名军衔较高的教官才能与之相配。弄得唐生智哭笑不得。唐生智也是“当仁不让”，没给这位教官好颜色看。在一次校会上，有人提到“蒋委员长”，黄人立即发令，要求师生“立正”，当即遭到唐生智的训斥。唐质问黄有谁规定学校里提到蒋某人要立正？并指出军队里搞这一套情有可原，但是学校里不准搞。黄自讨没趣。不久，黄人在一次军训课上体罚学生。唐生智得知后，身穿一级上将戎装步入操场，黄人觉得情况不妙，立即停止体罚，并要求全体学生向唐行立正礼。唐生智走上去后，只让学生“稍息”，仍让黄立正站着。黄深知难取悦于唐，便提出辞职，唐亦未加挽留。以后官方派来的军训教官大都能按耀祥中学的校规办事，而不敢妄为。
唐生智身边有一同姓副官，与他沾亲带故，暗地里当上了当地青帮的头目，他竟然在耀祥中学吸收四名学生为徒。唐生智知道后，召集全校师生开会，把他的副官召去训斥一番，然后以严重违反校规为由，公开宣布将副官和那四名学生开除出校，并禁止再踏进校门。
唐生智对于国民党当局派来监视他的走卒欲拒之门外，对于青红帮势力更深恶痛绝，但是，对于真心支持和帮助他的进步人士则表示欢迎并给予保护。他聘请共产党员严正为耀祥中学生物教师。1940年初，中共党员刘国安到该校发展党员，并建立了党支部，开展抗日救亡工作。严正在师生中组织“格杜文学社”，指导他们读进步书刊，出油印小册子，以诗歌、散文、随感录等文学形式，评论现实，针砭时弊，宣传抗日主张，宣扬共产党救国救民的事迹，给师生以极大的鼓舞。严正还要国文教员罗仲农以《原盗》为作文题，启发学生，借题发挥，痛斥蒋介石祸国殃民、投降卖国的罪行。这些活动，引起了国民党特务的注意，军训教官公开叫嚣：“学校有异党活动，大家要警惕！”并指使亲信趁黑夜撕毁进步师生刊出的墙报，偷走油印书刊，于是群情激愤，纷纷抗议。在这种情况下，唐生智出来发话了，他说：当学生的要好好读书，不要搞越轨行动。当然，出些刊物，谈谈对形势的看法，也未尝不可。以此来搪塞特务。其实，他对蒋介石消极攘外，积极安内的态度是比较清楚的，对共产党积极抗日的主张和举动是颇为赞赏的，他在一定程度上对进步师生采取了同情和保护的态度。也正是因为这一点，耀祥中学的抗日救亡活动才有了较好的基础，当东安沦陷的时候，耀祥师生仍能高举抗日救国的旗帜。
