机制是指系统内各子系统、各要素之间相互作用、相互联系、相互制约的形式和运动原理，以及内在的工作方式。它通过微观层次运动的控制、引导和激励来使系统微观层次的相互作用转化为宏观的定向运动。产学研合作的发展机制就是指从企业、高校与科研院所产生组建意愿开始，到合作利益分配结束过程涉及各环节的运行原理、相关制度及作用方式。在良好的政策、法律环境下，企业、高校与科研院所为实现自身利益，产生组建意愿，通过对各种因素的权衡，选定合作伙伴，基于各自优势，建立合作关系。而合作组织成立后的首要任务就是要尽快建立和完善运行机制，以便提高组织运行动力、学习效果、诚信度、运行效率与效果，保证组织利益分配的公正性与客观性，从而进一步提高成员合作的积极性。产学研合作创新作为一种制度创新，其合作的动力来源以及运转机制是什么？许多学者运用系统论、管理学、组织学的方法和原理进行了分析，本章我们借鉴各类研究成果，重点对产学研合作创新的发展机制，诸如选择结合机制、分工协调机制、合作学习机制、动力机制和利益分配机制等体系进行分析和探讨。
一、选择结合机制
选择就是按照能力相容、优势互补、交易费用较小的原则，考虑选择对象的优势资源，从组织综合优势角度，科学确定合作伙伴的规则和程序。选择企业作为合作对象时，主要考虑内容包括企业的核心能力及特色的优势资源，企业的诚信，研发能力，市场营销能力，企业财务状况，企业文化，对产学研合作的态度等。选择高校作为合作伙伴时，主要考虑高校、科研院所的科技优势资源和技术特色，创新团队，科研成果积累与研发现状，产学研合作经历和效果，以及对产学研合作的技术支持程度等。对合作伙伴有关因素的充分分析，有助于选择到合适的伙伴和提高合作的成功率。由此看来，产学研选择结合机制就是指教学、科研、生产三方以人才、技术、效益为结合点，遵循市场经济规律、教育规律和科技发展规律，逐步形成互利互补、良性循环、共同发展的合作关系的制度。主要表现为：教学、科研与生产的三结合；理论与实践的结合，即理论原理与生产实际的结合、理论研究与应用研究的结合、学习书本知识与投身社会实践的结合；教育与生产劳动的结合，包括学校教育与社会教育的结合，传授知识与培养实践能力、创新精神的结合，互动教育与自我教育的结合，德、智、体、美教育的相互渗透、相互促进和全面发展。产学研选择结合机制以教学、科研、生产三方寻求生存、发展的共同愿望为基础，以充分发挥各自优势为条件，以利益共同体的方式把三方紧密地联系在一起，使实践从盲目走向自觉，使理论从含混趋于清晰，形成产学研联合的循环加速机制。产、学、研三方在选择结合机制的作用下逐渐走上良性发展轨道，在实施科教兴国、可持续发展战略，推进国家创新体系建设中发挥着越来越重要的作用。
需要明确的是，在激烈的市场竞争中取胜，不断发展壮大，是产、学、研三方追求的共同目标。长期以来，我国教育与科技、经济相脱节的状况比较严重，科研与生产、学校与企业相脱离的现象比较普遍。高校、科研院所的经费来源于国家拨款，教师、科研人员对科研成就的关心主要在于能否多出论文、多出著作，能否有利于职称评定、利益兑现，不太关注成果的应用、转化和研究成本的回收、循环利用，从而导致科研成果转化率较低。随着市场经济体制的建立和逐步完善，国有企业改制、高等教育产业化发展和科研院所“断奶”、走企业化发展道路等改革措施的实施，高校同样面临着激烈的市场竞争，必须转变过去那种重论文轻成果的做法，树立服务意识和效益观念，积极投身于经济建设主战场，多出成果，多出效益。除了保持少数科研人员从事基础性研究之外，大部分科研力量将面向经济建设、社会发展的需要，积极地与企业开展合作，开展应用性研究。在合作过程中注重经济效益，遵循“效益最大化”的企业运作原则，与企业共担风险，共享效益，共同发展。
同时，以科技创新为主要内容，注重在技术上的结合。创新是一个民族进步的灵魂，是国家兴旺发达不竭的动力。知识经济时代，创新对国家经济持续发展起着决定性作用，是国家经济竞争力的重要标志。“科技进步和创新，是增强综合国力的决定性因素。”高等教育应当与科技、经济紧密结合起来，人力增强科技创新能力，努力推进经济发展。20世纪80年代开展的产学研联合普遍比较单纯，属单向主动型，包括高校、科研院所向企业转让科技成果，为企业培养人才和将企业作为高校师生的实习基地等形式。20世纪90年代的产学研联合属双向互动型，在诸方面多层次进行了合作，以科技合作为主要形式，包括联合科研、技术转让、技术开发、共建产学研联合体等形式。迈向21世纪，教育、科技、经济呈现一体化发展趋势，加入wTo给国内企业带来的将是激烈的国际竞争，只有增强自身技术创新能力，不断加强新产品、新技术开发，努力提高产品技术含量，国内企业才能在平等竞争中市于不败之地。高校拥有明显的科技优势和人才优势，在我国目前的条件下，仍然是技术创新条件较好的主体，企业只有与高校联合，携手合作，优势互补，共同攻关才能取得发展。因此，当前的产学研联合必须以科技创新为主要内容，努力开发高新技术。
二、分工协调机制
产学研合作中的分工是指按照权责利与义务统一的原则，对产学研合作各方进行科学、合理分工的规则与具体方式。企业的优势在于对市场的洞察力和反应能力。其对市场需求变化信息的及时捕捉，利于提高组织研发的针对性，利于研发成果经济价值的实现。高校及科研院所掌握大量项目研究信息以及先进、前沿技术的研究动态，拥有图书室、研究室、先进实验仪器和高素质的科研人员，为缩短组织技术创新时间，提高创新成果水平奠定了基础。因此，在具体分工时，企业应重点从事日常管理、市场信息研究、产品生产、销售等偏向于合作经营方面的事务，而高校和科研院所应重点从事合作中的研究开发、试生产、技术改进、研发队伍培养等偏向于研发方面的事务。企业在集中主要精力，致力于市场业务的同时，也要在技术研发中积极学习，以提高企业自身的研发能力。
在分工的同时我们更强调协调，就是遵循以较小的协调费用保持组织高效运行的原则，制定合作规划，协调合作各方工作进度，协调各方的责、权、利以及工作方式，加快文化整合，寻找各方的最佳契合点和提高产学研合作的经营效率的方式与方法。按照协同论的观点，只要系统内部各要素相互配合，各尽其职，协同工作，就会使系统整体效应大于各要素单独效应之和。良好的分工协调机制要有明确的规章制度和有力的执行措施。一是要建立规范的信息披露制度，及时准确地披露合作相关信息，提高各方的信任度；二是要建立合作各方沟通与协商渠道，完善工作协调方式，以提高组织的运行效率；三是建立共同参与合作规划与调整的制度，保证组织战略制定和规划调整的科学性与客观性；四是建立良好的约束与激励机制，以进一步规范合作成员及其全体员工的行为，同时对做出贡献的人员给予奖励，以调动组织员工的积极性。
由此可见，分工协调机制是指根据产学研联合的结合过程应遵循的教育和生产劳动的基本规律进行的自我调节和管理调节。这种调节是以实现国家的宏观导向意图和企业的同倍激励目标为目的，使产、学、研合作得好的宏观与微观调控手段，借以解决合作过程中所产生的矛盾，在三方获益的前提下，互相沟通，缩小矛盾，维护联合的大局，比如上级管理部门根据教育和生产劳动的规律，在联合内容、联合过程、联合利益上进行的调整、协调工作。产学研调节机制使合作三方的利益关系实现均衡调整成为可能，从而实现反馈、调整，互利互惠，共同发展的良好运作态势，使产学研联合走向良性发展的轨道。
三、合作学习机制
产学研合作中的合作学习机制是指针对合作各阶段，明确共同学习规则，构建学习型组织，加强内部学习的有关制度、规则与方式。企业、高校及科研院所应根据合作现状和发展的不同阶段，科学地选择相应的学习内容和方式。要对产学研合作成员设定明确的学习任务，并列入工作计划之中，对有关人员进行必要的知识和技能培训。明确学习规则，选择合适的知识管理模式并建立合作组织学习的知识内化通道，促进产学研合作的共同学习机制的形成与完善。明确产学研合作的学习内容，在学习各方显性知识的同时，加强隐性知识的学习，包括组织成员的动机、目标、文化、技能、经验等方面。由于产学研合作各方原有知识储备状况不同、努力程度不同，使各方呈现的学习能力存在差异，同时组织信息的披露也存在不透明的问题，这些成为构建良好产学研合作学习机制的主要障碍。
在合作学习中，高校必须重视根据市场需求，调整专业，突出特色。为办好教育，在强化校内实习基地的建设中，强调建立产、学、研的机制。尤其要根据高等教育人才培养目标，在以就业为导向，强化职业能力教育中，紧密地把产、学、研结合起来，把学生的实践学习过程，由过去单纯消耗转变为创造生产产品。这种产、学、研相结合不仅使学生真正进行实际操作，提高了动手能力，同时也节省了人力，降低了消耗，创造了效益，真正实现了产、学、研有机结合，培养锻炼了学生。同时，产学研合作组织必须重视对成员学习的激励，也就是在产学研合作学习过程中实行的奖勤罚懒、优胜劣汰、鼓励发展的制度。在产学研联合体中，建立健全技术、生产、营销、人事、劳动、财务诸方面的合同管理、结算管理、单证管理等一整套科学的管理制度；引入合理的竞争机制，在人员、分配、管理职位等方面建立一系列考核、评估、监督和约束的保障制度，做到考核准确，评估合理，形成监督有效和约束有力的管理格局，真正实现有才有位。对投身产学研合作学习创新的科技人员和生产人员，由政府提供失业、医疗和养老等社会保险服务，以解除他们的后顾之忧，充分发挥他们的聪明才智。政府及有关部门根据产学研联合的现实情况，在利益分配、知识产权、税收信贷、职称评定等方面，结合已经出台的有关政策，制定更加具体的可操作的实施细则，以调节合作各方的利益关系，调动他们参与产学研合作学习创新的积极性。
四、动力机制
分析产学研合作的动力及影响因素，把握动力机制的形成及本质特征，是构建产学研合作有效的激励机制，促进产学研合作健康发展的核心内容。
产学研合作的动力是在外部宏观经济制度和市场供需的变化中出现的，更源于合作各方对潜在利益（物质和非物质）的追求。合作成功与否，在于内外要素有机结合和合作各方的利益协调，尤其是在产权让渡时，基于产权对规模效益中剩余价值索取权的追求，形成了作为利益主体的合作各方在交互活动中的博弈规则，保持着合作动力的可持续性。
产学研合作的动力机制，是指产学研合作各方以追求共同的潜在利润为基本动力，为实现收益（物质和非物质）最大化，在外生变量制度环境和市场因素影响下，围绕产权让渡、降低交易费用、争取剩余索取权所进行的一系列合作博弈中形成的激励、约束、监督等规则的作用过程和行为总和。
（一）产学研合作创新的动力来源
1．外部动力来源
当前，我国正处在由计划经济向市场经济体制的转型过程中，产学研各方在原有的计划制度体系中形成各自的优势，拥有一定的资源禀赋，但也存在相对封闭而独立的状态，生产、教学、科研被割裂开来，这种状态至今并没有大的改变。当主流制度发生变化时，产学研各方被推向市场经济环境中，他们的目标、功能随之发生变化。企业的目标市场、产品供给、竞争力等出现了新的不均衡；科研单位（需转制的）不仅讲究学术水平，也要注重经济效益；高校在搞好教学、科研的同时，也要服务社会，并在服务中获得经济收益。经济利益成为产学研各方共同追求的共同利益。面对经济社会制度的变迁和共同的利益目标，产学研各方出现了合作与不合作的预期选择和合作的可行性。作为市场经济主体的企业，首先必须进行技术创新和制度创新。同时，为了提高企业在市场竞争中的优势地位和实现经济社会资源的合理配置，寻求利润的最大化目标，促进经济发展，政府也通过政策、法令鼓励产学研合作。1992年国家教委、科学院、经贸委等联合启动了产学研合作工程，1998年国家颁布的《面向21世纪教育振兴行动计划》以及后来的十五大报告等，都对产学研合作提出了明确要求。各级地方政府也通过税收、财政补贴、贷款贴息等宏观调控手段引导产学研各方沿政府的要求方向发展。因此，市场因素的诱导、制度环境的强制，成为产学研合作的外部动力。
2．内部动力来源
