收买人心，获得更加广泛的支持和拥护，是政变之后的当务之急。这一点，慈禧和奕訢彼此不谋而合。
奕訢深谙政权建立之初，平反前朝冤狱、整顿本朝吏治是一项行之已久且屡试不爽的统治方略。前朝肃顺专权时，“屡兴大狱，以示权威”，积压了很多冤案。但由于肃顺权大势大，当时没有人敢站出来申诉。新政权建立，人人急切地渴望有沉冤昭雪、释放冤囚、告慰冤魂的一天。
政变的第二天，少詹事许彭寿即上密折，请求将“五宇钞票案”尽早结案，并给无辜株连者昭雪。由于慈禧对该案了解不多，全权交予奕訢督促刑部办理。这个案子发生在咸丰九年，即1859年，是肃顺为排挤主管财政的大学士翁心存和户部尚书周祖培而兴的，它积压在奕訢的心头已经有数年了。
打击对象之一的周祖培虽然有借奕訢的力量扳倒肃顺出口恶气之嫌，但他积极参与政变，忙里忙外，确实为这次政变出了不少力，也该是给他点回报的时候了。另一打击对象翁心存，三代帝师，其门人、学生遍布朝野，可谓学界泰斗，士林的一面旗帜。三个儿子也深受瞩目，长子和次子为地方巡抚、布政，三子为咸丰六年（1846年）的状元。挽救了他，那可是收拢了天下士子的心。肃顺当时为了给奕訢一点颜色看看，也将奕訢的家人数百人牵涉进了这个案子，当时的小妾、现在的侧福晋桂儿的父兄，均受到牵连，这更不能说无关痛痒了。
“五宇钞票案”，也称“五宇官钱铺案”。咸丰年间，农民起义风起云涌，朝廷不断地派兵前往镇压，耗费了大量的银两。为解决军费开支的困难，政府决定由户部设立宝钞处和官钱总局，铸造劣质大钱，发行钞票。当时有“乾”字编号的钱局共四处，“宇”字编号五处。肃顺奉旨查检财政时，发现“宇”字五号局欠款和官钱总局的账面不符，追查出一个贪污总额高达数千两白银的巨额贪污集团。这可给了肃顺一个显示自己权威和打击政敌的绝好机会。肃顺大动干戈，抄查家产数十家，拘捕数百人，南北两监狱关满了因与此案有关联的犯人。至今已两年有余，未能结案，弄得朝野上下人心不安。
奕訢积极推动此案的顺利解决。许彭寿上密折后的十月十一日，刑部即收到上谕，着令迅速结案，省释法不当罪的人，以缓解民众内心的疾苦。并特别指出：查处惩办污吏固然重要，但肃顺、载垣等人排斥异己、罗织罪名、作威作福的办案思想和出发点是错误的。刑部按照慈禧和奕訢的意思，不出数日，便查清案情，凡株连之人，不能查实的，一律释放。十一月初三日，两宫太后又再次下诏指出，此案株连太甚，打击面太宽，令迅即发还被株连者的全部家产。
曾经哄动全国的大案，在奕訢的主持之下，迅速结案。奕訢借此又赢得了朝野的欢呼和拥护。
大家看“五宇钞票案”很快就被平反了，以御史任兆坚为首纷纷有人上奏恳请为因戊午科场案被斩决的大学士柏葰洗刷罪名。
一日早朝，未等大家开口，幕帘后传来声音，西太后首先开口道：
“众卿，今日屡屡有人呈奏，请求为戊午科场案被诛的柏葰昭雪，大家看该如何处置？”
柏葰，蒙古人，素与肃顺不和，被肃顺怀恨在心。咸丰八年（1858年），奉命任主考官，因家人参与舞弊失察而被肃顺抓住把柄。次年二月，柏葰被正法。同时被判死刑的还有房官翰林、兵部主事，及有关举人和副主考官之子等多人。另外副主考官程庭桂、朱凤标以下十几名考试大员也被革职流放。表面上看是为了严整考规考纪，实际上是公报私仇。尤其是两年后的科考，肃顺带头舞弊，人们开始对他打着正义的名号处理柏葰等人一案产生怀疑。
这个案子虽说已经很久远了，但影响很大。奕訢沉思了片刻，答道：
“柏葰对家人舞弊失察，致使我朝廷取士不公，贻误人才，理应严惩；然而此案处理过严，弄得士人满狱，有失本意，朝野微辞颇多。臣恳请降旨，交礼部、刑部会同复审。”
奕訢的一番话正说到众人的心坎儿上了，听了这话，大家均点头称是，并恳请能迅速办理此案。同治元年正月二十四日，根据复审结果发布上谕宣告，此案主犯柏葰确属听受家人嘱托，取中试卷，罪无可辞。但载垣等人拟定“斩立决”却为罚不当罪，实乃公报私仇。并决定法外施恩，将柏葰之子录为正式官员。
圣旨一下，朝野内外欢呼雀跃，均称颂当今朝廷，称赞奕訢为一代贤王。肃顺在他执政的两三年内，执法过猛，屡兴大狱，排斥异己，导致人怨沸腾，即使是支持者也得处处小心，时时提防，天下人人自危，无心治理国政。现如今，太后垂帘，亲王佐理，重用人才，平反冤案，人心思进，社会政治环境日益开明宽松，人人脸上都露出了欣喜的笑容。
刚过而立之年的奕訢，前额宽阔，眉目清秀。他没有肃顺那样咄咄逼人的气势，而是“举止安详，仪表清超”，给人以天潢贵胄所特有的超凡脱俗的精干印象。他言语甚少，似乎总在对大清朝的前途甚或是自己的前途作着冷静的思考。
一个人静静地坐在军机处偌大的房间里，他需要整理一下自己的思绪。万事开头难，面对这堆乱摊子，当务之急应从何处着手？万事皆由人为，治国必先治人，治人必先治吏，应该从人、人心这个环节入手。按照祖宗家法：治天下之道在亲亲。只有把自家人治理好了，大家劲往一处使，方能形成团结对外的力量。否则祸起萧墙，自顾不暇，更不用说政令的有效贯彻和执行了，这是古训。
在亲族之中，惠王已经老朽无用了，七弟醇郡王奕譞已长大成人，办事也还甚为成熟稳重，可委以重任。五兄惇亲王奕誴能力不强，也不谙外事，因生来相貌粗拙，举止粗略，一直不为父皇所喜；四哥在位时，自己晋升为亲王时，他一直都是个郡王。但怎么说都是亲兄弟，仍可委以要职。此外还有肃亲王、豫亲王及其他诸八旗子弟。
为此，奕訢奏请任命其七弟奕譞为御前大臣、后扈大臣、正黄旗领侍卫内大臣，并管理神机营事务。神机营是在第二次鸦片战争结束后，为整顿京城武备，训练京旗各营官兵而建立起来的，其官兵是由八旗骁骑营、前锋营、护军营、步军营、火器营、健锐营等营中挑选出来的，是旗营中最精锐的军队。
另外，奏请将其五兄奕誴晋为亲王，并任其为阅兵大臣、正黄旗满洲都统，管理武备院事；任肃亲王华丰为宗人府右宗正、镶黄旗领侍卫内大臣，任豫亲王义道为阅兵大臣；同时对八旗都统、副都统都进行了大幅度的调整，上三旗领侍卫内大臣均由亲、郡王兼领。通过此番人事大调整，既团结了近支宗室，又加强了对京中八旗的控制，从而极大地提高了奕訢在满族亲贵中的地位和威望。
接着，在平反冤狱的基础上，奕訢进一步着手起复那些被肃顺陷害和排挤的、在朝野素有影响的官员。新皇已有七岁，是该开馆启蒙的时候了，奕訢决定利用遴选帝师的机会来达到这个目的。他首先想到了前大学士祁嶲藻、翁心存和前太常寺卿李棠阶等人。
翁心存曾经做过奕訢的启蒙老师，也曾为惠亲王绵愉和钟郡王奕詥授读，德高望重。只因在户部尚书任内，反对鸦片以洋药名义征税进口，与肃顺等人意见相违，遭到肃顺的仇恨和排挤。后因“五宇钞票案”，差点被肃顺置于死地，经咸丰帝力保，才得以获革职留任处分。现“五宇”案平反，冤情得以昭雪，翁心存及其门生弟子早已对奕訢感激不尽了。若能在平反冤狱的基础上，重新起用翁老，必将大大宽慰天下士子之心。
祁嶲藻，精通经学，曾位至军机首揆，不仅有学问，而且有丰富的政治经验，因与载垣、端华等人意见不合而退休。李棠阶，道光二年进士，学养深厚，迁太常寺卿，官台谏时，曾多次上书言事，侃侃而谈，是一时名士。咸丰年间，肃顺专权时，认为其迂腐之至，不足为用，遂遭打击而被弃不用。
这三人其实并没有什么新思想，也没有多大的经世本领。奕訢看重他们，主要是考虑到他们均是耆硕旧勋，很有影响，起用他们能够达到收揽人心的目的。当时名士李慈铭就赞扬此举说：“此三人者，皆人望也，新政以此举最为可观，雍容表率，众正盈朝，中兴之业在斯矣。”
此外，奕訢还进一步请旨要求各省各军荐举贤才、真才，要求内外臣工力荐擅长屠杀起义人民、愿意为清廷效命疆场的将才，且对荐举有功之臣实行表彰和奖赏。他对清朝吏治废弛、官场阿谀逢迎的现象非常痛心，于是又要求各地选拔人才时，要破除积习，不论身份，唯才是举。同治元年十二月，再次谕令各省选举“孝廉方正”，不论“绅士布衣”，有真才实学，即应予以荐举。奕訢深知，人才是政权实力的核心，于是打破积习，不拘一格，广招人才。同治初年，他多次举行这类恩拔、特科，以期增强政权的实力。
在奕訢的倡导下，各地要员纷纷荐举人才，如曾国藩和胡林翼保举罗泽南、李续宜、李续宾、刘长佑；骆秉璋推荐左宗棠、田兴恕；劳崇光保举张国樑等等。
通过任用亲贵，平反冤狱，选拔人才，奕訢不仅极大地提高了自己在朝野内外的声望和地位，而且空前增强了大清王朝的凝聚力，为同治中兴打下了坚实的基础。
