周末，上午5：40
真嗣一如既往早早的起来为美里和明日香做早餐，真嗣下了床，打了个哈欠伸了个懒腰便去洗漱。
洗漱完后直接走向了厨房准备早餐。准备完后把早餐放在了桌子上，又去烧开水，想在烧开之前再眯一会的真嗣躺在了沙发上。
过了一会，水烧开了，但是真嗣没醒。又过了一会，明日香被烧开水声给吵醒了。
明日香：吵死了，烧完水不关煤气很危险的。喂，真嗣？
明日香看见了躺在沙发上的真嗣。
明日香：真是的，在就回应一下嘛，真嗣，喂！真嗣！
真嗣任然没有反应，明日香上前一看，真嗣满脸通红，呼吸声大又紧凑。明日香把手伸向了真嗣的额头，刚放上去就被烫的立刻收了手。
明日香：好烫。
明日香把煤气关闭后把美里叫醒了。
美里：干嘛啊，大清早的，啊~（哈欠）
明日香：真嗣他发烧了。
美里：什么！
美里急忙把真嗣送去医院，一套检查下来后说发烧情况还好，多加休息就行了。
回到家后，美里让真嗣好好休息，但是真嗣并不想休息。
真嗣：不行，现在我还不能休息，如果使徒来了的话就麻烦了。
在美里的百般劝阻下真嗣还是拒绝，最后美里只好偷偷的把真嗣要吃的药里放两粒了安眠药。
真嗣吃下药后便睡着了。
明日香：在药里面放安眠药不会出事吧。
美里：不用怕，我查了一下，那些药不会和安眠药产生什么化学反应的。
明日香：那就好。
美里：时间也差不多了，你快去上学吧。
明日香去了学校后美里也回到了NERV里。
而为了维持MAGI的高效率工作所要定期更换电路线和部分零件，工作人员忙的不可开交。
另一边零号机也在替换着零件。
过了许久，MAGI的零件替换完毕，正在重启。重启后伊吹和赤木检查着系统有无BUG。在检查时发生了系统的互相排斥。
赤木：互相矛盾了，还真是符合制造者的性格啊。
美里：什么啊，制造出MAGI的不就是你吗？
赤木：对了，我好像没有跟你说过，我只是负责更新了MAGI的系统，而创造基础理论和本体的是我的母亲。
而在这时，一位更换MAGI零件的工作人员拿着一块像被侵蚀过的零件交给了赤木。
经过检测后的确是被侵蚀了，并且零号机的替换零件也有同样的问题。
全部检查过后没有发现异常，所以以为是因为最近的温度和导电率发生了一些变化所导致的。
青叶：该不会因为工期被压缩掉了60天不小心让气泡渗进去了吧，B栋的工程也太粗糙了吧。
冬月：毕竟他们是使徒出现后才开始的。
日向：真是难为他们了，大家都累了。
冬月：要在明天之前弄好，不然碇司令他有要啰嗦了。
过了一会后，一切都以为搞定了，但是零号机突然自己动了起来，并且在运输台上挣扎着，企图摆脱锁住它的枷锁。MAGI也有一些系统故障，仿佛系统内部遭到了侵蚀。
紧急情况下NERV发布了避难通知，全员避难完成后NERV把零号机发射到了地面，而明日香也赶到了总部。
明日香：发生什么了？
美里：不知道，这是突然发生的。
赤木：美里！快看！
美里：什么啊？
赤木：已经检查完毕了，这一切的原因是因为使徒。
美里看了看电脑上的检测报告，图样为蓝色，的确是使徒。
美里：真的耶，没想到使徒居然藏在了替换零件上。
赤木：不止如此，看，这是MAGI现在的内部系统代码。
美里：这和原代码完全不同，难道使徒要占领MAGI和零号机。
赤木：很有可能。
另一边收到避难通知的真嗣也不顾自己身体赶往了NERV。
真嗣：突然的避难通知，难道是使徒来了吗。
真嗣往周围看去，发现了零号机被发射了出来。
真嗣：零号机？果然是使徒。不行，得赶紧赶过去。
真嗣加快了速度，不断的抄近道赶往NERV。
到了通往地下都市的通道后真嗣依然没有怠慢，直接冲了下去。
进入总部后真嗣往作战指挥部赶去，但是跑到一半真嗣突然倒地。
真嗣：哈，哈（喘气）不行，不能停下，使徒来了，我还不能在这倒下。
真嗣再次站了起来，继续前往作战指挥部。
另一边明日香坐上了二号机与使徒战斗，但是一举一动全部被看穿了。
明日香：怎么会这样，全部都被看穿了，难道MAGI已经大部分被占领了吗。
二号机再次与被使徒侵蚀的零号机展开战斗，但是全程处于下风，二号机被打到了，当使徒准备给二号机最后一击时，真嗣驾驶着初号机踹了使徒一脚并将其打退了几步。
明日香：真嗣？你怎么会在这？
真嗣：使徒来袭，我，怎能放任不管呢，还有，你没事吧？
明日香：当然，我怎么可能会有事啊。
真嗣：没事就好，还能站起来吗。
明日香：可以。
真嗣：好，那，来吧，来次久违的双人合作吧。
明日香：嗯。
真嗣和明日香一起向使徒展开了进攻，但即使面对两人的合力进攻，使徒依然占有优势。
真嗣：这怎么可能，攻击路数全看穿了。
明日香：还没好吗，美里。
在NERV里，所有的科技技术部人员都在全力阻止使徒侵入MAGI的系统，可是也快不过使徒的侵蚀速度，但是经过人类无限的可能性最终成功阻止使徒的侵蚀，但是另一边真嗣和明日香任然在战斗。
在战斗中，真嗣和明日香拼尽全力的打着，但是长时间的战斗给真嗣现在的身体带来了负担，真嗣的同步率不断下降，明日香也快撑不下去了。
在极端的情况下真嗣准备用尽全力给使徒最后一击，但是因为身体原因没能击倒使徒，真嗣准备在来一击是却感到十分的疼痛感，一看，原来是胸口上的伤痕裂开了。
真嗣：真是的，怎么偏偏在这个时候。
明日香：怎么了真嗣。
真嗣：没事，伤口裂开了而已，不碍事。
明日香：什么叫不碍事，你快撤退吧，不然会更麻烦的。
真嗣：但是，小心！
使徒趁他们分心时想偷袭明日香，真嗣推开了明日香，但因为身体原因真嗣没能及时闪开使徒的攻击，初号机的身体直接被使徒的手穿过。
真嗣抓住的使徒，明日香趁此机会将使徒的核心破坏，使徒最终被消灭，零号机也恢复了正常。
而初号机倒下了，明日香急忙把真嗣的插入栓拔出，明日香走出了插入栓，真嗣也走出了插入栓，本以为结束了，但是一个类似人形的怪物出现在他们面前，并与他们对话。
使徒：你们好啊，不要以为这样就结束了，我还没死呢！
真嗣：你是，使徒。
使徒：没错，我侵入过那你们所说的MAGI，在侵入过程中我也学到了你们人类的语言和你们人的形态结构。
真嗣：没想到你们使徒还有点脑的嘛。
使徒：不说废话了，开打吧。
当真嗣准备在和使徒展开战斗时明日香拦住了他。
明日香：不行，你不能再打了。
真嗣：没事的，我还能打。啊。（倒下）
明日香：你在这里好好休息，剩下的交给我吧。
真嗣：不行，但靠你一人还不能，它侵入过MAGI，其中肯定学习了不少资料，而且我们是人类，不论是战斗能力和体力都不及它，一个人肯定很吃亏，所以。
明日香：我知道，但是我不想让现在的你再受伤了，所以，让我自己来吧，拜托了。
真嗣：......好吧。
最后真嗣只好让明日香一个人去和使徒打。
使徒：就你一人？
明日香：对，一人，足矣。
使徒：有趣，那来吧，让我见识一下你的实力！
明日香：好，EVA装甲，启动！
两人互相冲向对方，战斗开始了，明日香快速的出拳，不断的给予使徒攻击，试图使用速度将使徒打到，但是对于学习过MAGI里绝大多数资料的使徒来说依然不慌。
使徒把明日香的攻击一一接下，没有对使徒造成半点伤害，使徒找准时机用力一击将明日香击倒，真嗣见状，立刻上前接住了明日香。
但是明日香并没有就此退下，依然上前继续和使徒打，使徒也开始变得不耐烦了，每一击都给予重创，真嗣也不顾身体启动装甲上前帮忙。可是现在的真嗣远不及受伤之前，现在的真嗣变得十分虚弱。
在不断的战斗中两人的体力也快达到了极限，但使徒并没有露出一点累的表现，并且每一击的重创要比上一击更加的重，明显已经不想浪费时间打了。
使徒加快了攻击速度，体力达到极限的真嗣和明日香只能一直躲避攻击，但是使徒的手突然变长，抓住了明日香并且对其一击重创，明日香被打到在地，使徒准备再来一击杀死明日香，真嗣连忙上前阻止，并用身体裆下了这致命一击。
真嗣的身体被使徒击穿，腹部大量的出血，真嗣趁此机会抓住使徒并对使徒的头部展开猛兽一般的攻击。
真嗣：给我去死！啊~！
真嗣将使徒打出几米远，明日香站起扶着真嗣。
明日香：你快别打了，出这么大的血，在这样下去你会死的！
真嗣：我的命不重要，如果能用我一人的命换这个城市所有人的命，我将会不顾一切的去战斗！并且我不会后悔自己的选择。
使徒：聊完了吗？我已经不想玩了，一击定胜负吧！
真嗣：好啊，我也不想浪费时间了！
使徒冲向了真嗣，真嗣也不顾明日香的劝阻冲向使徒，两人同时跳起，都选择了威力更大的踢来绝胜负，两人互踢一击，中间隔开了一定距离背对的站着。
最后，使徒被击败了，原地爆炸，明日香跑向真嗣，但跑到一半时真嗣昏倒了，明日香连忙看了看情况，发现真嗣还有一点呼吸。胸口撕裂的伤口和腹部被击穿的伤口不断的在流血。
明日香：真嗣！真嗣！振作一点啊真嗣！不行，得赶紧送去急救。
明日香通知了美里赶紧准备好接他们的医护人员，明日香背起真嗣往NERV总部跑去。
明日香：腿部装甲能力调至极限，能量全集中到腿部。
到达NERV后明日香把真嗣交给了医护人员，自己也倒在地上。
明日香：脚已经不行了吗？
明日香：也是，全部能量集中在腿部，现在还有知觉已经算好的了。真嗣，你可不能死啊，你答应过我要帮我完成梦想的，你可千万不能出事啊，真嗣。
几天后，医院病房。
真嗣：嗯？这是在哪？
真嗣望了望四周，发现是原来的那间病房。
真嗣：我这是，来这里第几次了啊。
此时，外面有人推开了门，是明日香和美里，但是此时的明日香却坐着轮椅。
真嗣：明日香，你的脚。
明日香：没事的，装甲的副作用，只是暂时性瘫痪而已，不要紧。
真嗣：这样啊，没事就好。
然后赤木也进来了，并且手里拿着之前真嗣穿过的二号机男式作战服。
真嗣：为什么要那着这个？
赤木：因为你原本的作战服已经烂了，毕竟被开了那么大的一个口，完全用不了了。
真嗣：那为什么要把这个给我？
之后赤木给真嗣说明了原因，因为每台EVA都是不一样的，所以作为辅助同步的作战服也要符合那台EVA的性质，所以作战服的制造也很难，经过了测试，二号机的作战服的辅助同步率略高于零号机的，所以才要把二号机的作战服交给真嗣。
真嗣：原来如此，明白了。
美里：这次的作战真是辛苦你们了，真嗣，明日香。
明日香：其实我没帮到多少啦，都是真嗣的功劳。
赤木：就算这样，我们还是付出了如同血一般的代价。零号机和MAGI被侵蚀，MAGI倒还好，可是零号机却大部分零件都不能用了。初号机和二号机也受到了一定的损伤，驾驶员也身负重伤，这些加起来已经是前所未有的巨大代价。
到了晚上，他们谈论完后也都回了家，真嗣一人躺在病床上看着这从陌生变成熟悉的天花板睡着了。
另一边，无人的小巷子里，那使徒还没有死，身负重伤的它走在这无人的巷子里，突然，在它面前那到黑暗中走出来一个黑衣女子挡在它的前面。
使徒：你是谁？居然敢挡在我面前！
黑衣女：不是谁，而是要杀你的人。
使徒：你说什么？啊！
使徒低下了头，看见自己的核心被掏了出来，扭头一看，是另一位黑衣人，但是是男的。
巧：怎么样，被穿过胸膛的感觉。
使徒：你们到底是谁！
巧：要死之徒，多说无益。
随后将使徒的核心捏爆，使徒也完全死亡。
巧：好了，让我看看你下一步的选择吧，碇真嗣。
第四章第三集-完
预告：迷之机器人的出现，迷之少女的到来，不断的接近真嗣是想利用还是真心？
第五章，钢铁女友-第一集-少女的到来。
