主线
第二次崩坏结束后，岳母牺牲。齐格飞带着琪亚娜的复制体k423跑了，然后k423在一次事故中觉醒，打伤了老爸，老爸跑了。k423长大后遇到布洛妮娅和芽衣。第三次崩坏爆发（温蒂登场），琪亚娜为芽衣挡刀导致芽衣体内雷律觉醒。姬子（登场）前来交战。事后御三家来到圣芙蕾雅学园。并在后来前去深海寻找轩辕剑（编年史轩辕篇）天命和逆熵得知后，逆熵放出月光王座，奥拓则启动复活空律的计划。（此处开始与游戏剧情接轨）之后遇到了逆熵故意放出的月光王座，布洛妮娅芯片被侵蚀。在一行人遇到了温蒂时可可利亚控制布洛妮娅，把芽衣温蒂抓走。之后琪亚娜去ME社救人，可惜温蒂已经死了，渴望宝石也被带走，布洛妮娅也烧毁了芯片。之后德莉莎来到地下库寻找解救布洛妮娅方法，琪亚娜也溜了进去。琪亚娜在虚数空间被自己体内的律者意思蛊惑，然后符华来把他抓走了，幽兰戴尔也打伤了德莉莎。之后德莉莎（已与逆熵合作）召集部队打天命（这个时候布洛妮娅已经被符华治好了）。来到天命，空律觉醒，抓走芽衣，取走雷电核心（征服宝石）。之后符华意识到奥拓的阴谋，决定站在德莉莎这边，却被奥拓放阴枪（赤鸢仙人我没有说谎！）。然后姬子被符华的幻像（羽渡尘）救出，换上月蚀，把血清打到了空律身上，至此德莉莎和逆熵战败，姬子符华和琪亚娜不知去向，众人来到天穹市寻找琪亚娜下落。世界蛇势力出现，丽塔刺杀了灰蛇（然而灰蛇并没有死），拿到了琪亚娜的下落。这个时候德莉莎又收到了可可利亚的求救，于是兵分两路，一路去逆熵总部搬救兵，一路去海渊城拿取渴望宝石（温蒂身上的）。来到海渊城可可利亚却和灰蛇有勾结，爱因斯坦被抓走，量子之海被开启，布洛尼亚不顾死活跳了进去。就到这里。
┈┈┈开放世界┈┈┈
八重村：以小八的记忆为基础。讲述了第三次崩坏之前琪亚娜，布洛妮娅，芽衣三人在圣痕的空间里与小八相遇的故事。在第三次崩坏发生后，八重樱的力量使得自己出现了“肉体”，并用自己的律者核心拯救了被毒侵蚀的德莉莎（樱火轮舞）
天命总部：德莉莎攻打天命
就是这些了
