虽然说，林清羽取得了卡兰德星的胜利，但是等待他的并不是荣耀和欢呼，而是共和国当局的逮捕和审查。
而那些银河议会的议员们，以林清羽作战不利，导致了卡兰德星遭到邦联的轨道轰炸为契机，指责林清羽指挥不利，将他告上了法庭。
虽然说安纳金请帕德梅给林清羽进行辩护，但是法庭依然判决林清羽对这次的事件负全责。
而为了平息公众的怒火，绝地武士团对林清羽做出了处罚决定。
林清羽被降级为上校，并在武士团里面闭门思过，404军团暂时编入了安纳金的501军团。
当思过结束后，绝地武士团又将林清羽官复原职，为了不在让林清羽过于引人注目，林清羽被编入了欧比旺的第七天空军，但是享有独立行动的权力。
三年的战争锤炼了林清羽，也让他和手底下的克隆人士兵们血浓于水，他们同吃同住，一起出生入死。
有战事的时候，他们是生死与共的战友，没有战事的时候，他们是亲密无间的家人。
林清羽和404军团一起经历了第二次吉奥诺西斯战役、赖洛思战役、卡米诺保卫战、卡米诺保卫战、洛拉塞尤战役、蒙卡拉马里会战、昂巴拉战役、阿纳克斯战役等。
此外经历了很多有趣的冒险故事，曼达洛大战死神卫就是其中林清羽最传奇的一个冒险，林清羽用在星球上找到的珍贵的曼达洛铁，给自己打造了一副特质的盔甲，并且依靠这副盔甲，林清羽躲过了好几次断手断脚。
在这段时间里面，军团的规模不断的壮大，林清羽的手里拥有八万克隆人士兵，以及七艘巡洋舰、三艘登陆舰和五艘轻巡洋舰。
克隆人其中绝大多数都是一二三四代的克隆人老兵，数量有五万八千多人，而之后为了更大限度的补充损失的兵员，共和国的克隆人都是价格更加低廉，寿命只有三到四年的快速生产的克隆人，这种克隆人就是廉价的消耗品，林清羽补充的很少，主要是林清羽的战损是整个共和国大军之中最低的。
如今，随着外环星域保卫战的展开，404军团开始在外环星域作战，作为救火队和预备队支援在外环星域作战的绝地大师们。
不过在这段时间里面，各个战舰上的克隆人都频繁的汇报说，在战舰上出现过了一个蓝色长发的少女，但是找遍了整个战舰也没有找到她的踪迹。
对于这件事情，林清羽理解成宇宙中出现的无法解释的幻象。
……
“还剩下五天的时间了！”林清羽看着自己系统给的提示，心里不禁有些紧张，“希望吴静那丫头发明的针对生物芯片的纳米虫有效果，不然我可就惨了！”
“将军！”就在林清羽思索事情的时候，叶城突然冲进了林清羽的房间里面，“刚刚收到消息后科洛桑遭到了攻击！”
“科洛桑战役开始了吗？”林清羽低声呢喃了一句，然后看向了叶城，“从这里返回科洛桑，超空间航线需要花多少时间？”
“一个半小时！”叶城回答道。
“立刻出发！”林清羽咬了咬牙，这一刻自己已经等了整整三年了，是时候结束了。
舰队立刻计算航线，然后进入了超空间之中。
……
“系统，真的不管安纳金吗？”站在战舰的舰桥上，林清羽最后一次询问系统管不管安纳金的事情。
在三年的战争中，林清羽和安纳金合作过很多次，两人都是相信对方是值得将后背托付的人，两人的关系就如同亲兄弟一样铁！
“安纳金将原力带向平衡是不可避免的，你想阻止也没用，你虽然说在这三年里面，光剑和原力的本事提高了很多，但是你依然无法打败黑化的安纳金！”
“那我黑化……”
“不许你这么胡来！”系统毫不客气的说道，“上次为了把失控的你救回来，你知道我费了多大的劲吗？无论如何，绝对不要踏入黑暗面！”
“我知道了。”林清羽点了点头，“如果我真的救不了他的话，那么至少我得让他少造一些杀孽！”
一个半小时后，舰队终于来到了科洛桑，此时的科洛桑，邦联的舰队和共和国舰队混战成了一团，林清羽立刻命令麦德林带领着战斗机群配合舰队加入了科洛桑保卫战。
科洛桑遭到攻击，其实也不过是帕尔帕庭自导自演的一出戏，同时也是为了淘汰掉自己的老徒弟杜库伯爵而准备的一场战斗。
林清羽指挥着舰队在战场上对抗着邦联的舰队，最后邦联舰队失利撤走了。
“安纳金！”回到绝地圣殿里面，林清羽看见了一脸愤懑的安纳金。
“怎么了？这副表情？”林清羽询问道。
“议长推荐我进入绝地长老会！”安纳金把目光看向了一边，声音非常气愤，“他们同意我进入长老会，但是不给我长老头衔！”
“绝地长老会一直都是以他们的标准选择长老！即使是我师傅的好友，奎刚金大师那么优秀的人，都不曾进入长老会！”林清羽低头说道，“但是以你的战功和实力，你完全有能力进入长老会！”
“所以我才生气！”安纳金说道，“既然进入了长老会，却不给我头衔，实在是太过分了！”
安纳金的悲剧从上帝视角来看完全是可以避免的，但是共和国的腐败和绝地武士团的原因，导致了这位年轻的天选之子一步一步的走向了黑暗之中。
林清羽在这三年里面，目睹了绝地武士的种种行为，他们对安纳金几乎是没有好脸色看的，甚至是阿索卡，这个曾经意气风发的绝地学徒，最后也因为绝地武士的原因而离开了。
而林清羽也经常因为一些比较优秀的思想，而被武士团的长老们斥责和甩脸子。
“而且，他们还派我监视议长！这到底是想干什么！？”安纳金补充的话让林清羽的眉头皱的更紧了，帕尔帕庭和安纳金相处了十几年，两人可以说是老相识，好朋友，这个举动无疑会引起安纳金的不满。
武士团的每一个举动都是在黑化安纳金，林清羽在这三年之中对这句话有了无比深刻的体会。
“别不高兴了。”虽然说知道最后的结局，但是最为安纳金的好哥们儿，林清羽还是安慰道，“至少并不是所有的事情都是坏事！至少你有孩子了，不是吗！？”
“对。”安纳金点了点头，和林清羽道了别，离开了圣殿。
这个时候，几个绝地学徒跑到了林清羽的身边，围着他，林清羽平日里和学徒、幼徒们关系一直不错，只要是林清羽曾经在孤儿院当过义工的缘故，照顾孩子他很有一套，所以学徒们都非常喜欢他。
“林大师，给我们讲一讲外环星域的事情好吗？”一个女性的提列克人学徒睁着她那双水汪汪的大眼睛看着林清羽。
“好的，我来给你们讲一讲吧。”林清羽点了点头，此时他的内心深处已经下定了某种决心。
……
晚上，当夜幕降临的时候，林清羽登上了星鸟号。
“FT4，设置航线到BY-419星域！”林清羽跟自己的好搭档FT4说道。
“去哪里做什么？”FT4问道，“那里可是很危险的，哪里的电磁风暴很可能会让我们船毁人亡的！”
“正是因为这个，我才要去那里！”林清羽启动了星鸟号的引擎，星鸟号飞入了太空之中。
BY-419星域一直被一团巨大的电磁云雾所笼罩着，不稳定的恐怖电磁风暴可以让所有靠近这里的船只毁灭。
“第三个愿望，创造之力，就是为了这一刻而准备的！”林清羽看向了眼前的迷雾。
林清羽站在驾驶舱里面，看着远处的迷雾，接着，他慢慢的闭上了眼睛。
“宿主，说出你想要创造的东西，和你想要赋予的设定！”系统作为林清羽创造之力的保险措施，需要知道林清羽的创造东西的情况，并且进行甄别。
“迷雾之中，有一颗有着原力的美丽星球，有一座古老的绝地圣殿，星球上有着凯博水晶矿，这里的电磁云雾并不是无端存在的，这是为了保护这里，只有光明原力的指引才能进入这里！而黑暗的使徒，只会被风暴所摧毁。”
“你想给孩子们建一个庇护所是吗？”系统明白了，“没有问题，可以创建！”
一个蓝色的光球出现在了林清羽的手心里面，接着从林清羽的手中飞了出去，穿过了飞船的玻璃罩，飞入了云层之中。
“要不要进去看一看？”系统问道。
“不了，我相信系统你能处理好的！”林清羽摇了摇头，然后驾驶着星鸟号返回了科洛桑。
“叶城，这里是林清羽。”最后，林清羽联系了叶城。
“是的将军！”叶城的投影出现在了林清羽的面前，“有什么指示。”
“对战舰进去全面补给，食物、弹药、燃料、装备，所有需要的东西全都进行补充！所有在外的士兵立刻返回战舰，舰队设置坐标在BY-7274号星域，我回头再那里和你们汇合！”
“明白，马上执行！”
“距离一切开始还有12个小时！”此时系统的提示传来。
