公元5074年，一支包含各国成员的探险队以现有的科技力量探索了始皇墓，他们经过一路艰难险阻，损失惨重，但也来到了始皇馆的面前。正当人类以为可以揭开秦始皇真容时，意外发生了。打开始皇馆的一瞬间，无数的红色粒子从始皇馆冲了出来，瞬间便从地下蔓延到了全世界，有的人因此而陷入昏迷，有的人却毫无反应，但只要是昏迷的人，都有一个共同的特点，他们都是16，17岁的青少年。在红色粒子散失期间，昏迷的人无任何病状，却迟迟不醒，各国皆陷入恐慌当中。
公元5075年，随着红色粒子的消散，昏迷的人逐渐醒来，但无一例外的是他们的身体素质有了极大的提高，有的甚至拥有了超能力，各大国连忙研究，发现红色粒子可以帮助人类突破基因，而16，17岁是最容易开启的，当人类叹息红色粒子的消散时，意外发生了，随着红色粒子的消散，始皇墓却也一并消失了，取而代之的是一场红色粒子形成的大雾，人类身体素质有了普遍的提高，这次没有人昏迷，当各大国庆幸时，意外再次发生，除人类外的其他生物发生了变异，他们被称为变异兽，好在人类中已有强大的超能力者，没有损失惨重，但随着时间的推移，人类一方越来越弱。
公元5165年，因五十年前红色大雾的散失，人类的超能力者越来越少，所有的人类跑到了人类最后的生存地——华夏大陆，建立了人类最后的联盟——华夏。当人类即将失去希望时，基因方程被发现了，人类可以通过基因方程改变基因，从而获得超能力。
公元5284年，经过一百多年的时间，越来越多的基因方程被发现，人类也一步步重新回到了地球霸主的位置，但变异兽数量众多，杀不完，于是将他们驱赶到了其他荒芜的地方。自此，人类又分裂成了七大帝国，但地球因为华夏语使用人数最多的原因而通用华夏语，人类根据最佳突破时间而建立了基因中学，许多强大的超能力者还建立了家族，世界改用新历法“基因历”。而在荒芜的地带，变异兽们正在密谋着阴谋......
故事主线：
基因历1049年，人类已建立了从4岁开始练体，12年基本教育（三年初级教育，六年中级教育，三年高级教育）的基本教育体系，七大帝国（华夏帝国，日月帝国，落日帝国，星辰帝国，乱世帝国，龙鸣帝国，生命帝国）共建了八所至高学院，其余各国内还有众多高校与超能家族。故事从这里开始了，而变异兽的阴谋也浮出水面......
