内战结束后，旧势力全部灭亡，新的中意志第二帝国统一人类。在统一和金盘的影响下，人类正式成为了3级文明（仅限于科技方面，领土并未达到全银河系）。
帝国元首墨痕重新启动了创世纪计划，在这期间，利用金盘中的3级文明技术，改造了上万颗宜居星球并制造了数百颗戴森球。注意，这里的戴森球并不是一个巨大的太阳能板，而是恒星汲取器，可在短期内吸收恒星能量，一般这种恒星大多是红巨星。而长期戴森球则是吸收红矮星能量。
尽管进展快速，但墨痕并不高兴，因为金盘似乎有自我意识，它虽然分享关于行星改造、戴森球、反物质等3级文明产物，但他却不愿意分享关于5级，也就是神级文明的任何情况。
一天夜里，金盘的意识突然入侵了墨痕的电脑后又告诉他去实验室聊一聊神级文明的事。
到了实验室，金盘却先说起了创世纪计划。说道：“创世纪计划的细则是不是先摧毁星球原生命，比如爬行类动物？”墨痕吃惊地看着金盘意识，想到创世纪计划本来就是机密，它怎么会知道。但联想到电脑被入侵，原来帝国的系统已经完全被金盘入侵。这虽然很可怕，但墨痕仍强作镇定，答道：“没错。”金盘接下去的话更令人奇怪：“那你想知道地球恐龙是怎么灭绝的吗？”墨痕：“陨石撞击，气候变化，这不是很简单的问题吗？”金盘：“那么陨石怎么来的呢？”墨痕沉默了，他没有回答。金盘：“哦，你们人类可真是一成不变啊！哈哈哈哈哈！你们真的觉得是普通陨石？你们人类从不追寻过去！这或许是你们的优点，正是因此你们还活着，我的文明却毁灭了！”
墨痕很疑惑地问道：“那这颗陨石……？”
金盘：“那只是另一个创世纪计划罢了。也许千万年之后创世纪计划中的智慧生物也会认为是陨石。”这番话打破了墨痕原有的世界观。墨痕继续问起：“所以另一个创世纪计划？”
金盘：“记得我的给予者曾经跟你说过关于5级文明的事，改造其它星球是每个高级文明都会经历的事情过程。而你们人类，正是改造后的产物。你们脱离了控制，只是因为战争的爆发……”“哪场战争？”墨痕问道。“神与神的战争罢了，”金盘：“这没什么好说的，毕竟你们的文明等级太低，他们也不会注意到你们的。”
墨痕：“你的给予者当初不就是想让我们帮他们的文明复仇，而你的命运不是帮助我们人类成为5级文明吗？”
金盘：“我已经做了我计算出最合乎逻辑的决定。我不希望本文明的复仇工具因为个人的错误决定而毁灭。在最后一刻来临前，你们已经没有时间成长为5级文明了，所以我将把你们变成一个4级文明。”
墨痕：“最后一刻，是选择与荣誉同死或投降与耻辱的和平吗？”
金盘：“没错。”
墨痕：“那好吧，帝国将用最响亮的寂静来回应这些所谓的神。”
金盘：“愚蠢的人类，总是不甘成为奴隶。我会告诉你关于他们那些5级文明的信息。”
墨痕：“洗耳恭听。”
金盘：“先说说那些所谓的神的情况。首先，宙斯，作为最好战的一个已知5级文明，也是对你们人类最不好的一个，当初他甚至都不想给你们文明升级的机会。其首都在奥林匹斯星球。其次是奥丁，首都阿斯加德人造永久固定星球。这两个是对你们最有威胁的文明。其余的几个在近几千年之中则不活跃，比如耶和华（上帝）和释迦牟尼（佛祖），因此他们可能已经成了6级文明，所以并没有什么威胁。”
墨痕：“6级文明，比5级文明文明等级更高，怎么威胁小了？”
金盘：“在6级文明眼中，1到5级文明都是低级文明，因为他们都在为了抽象的，比如荣誉进行斗争；同样也为了一些总会耗尽的，比如能源进行斗争。同时他们也末脱离脑电波的寄居体，也就是肉体。但正是因为他们的高傲，所以他们不气介入1到5级文明之间的事务。正因如此，他们是无威胁的。所以最有威胁的还是宙斯，也正是他摧毁了我创造者的文明。他一定要被毁灭。如果说毁灭阿萨神族还可以借助那些战败的5级文明的话，那么宙斯，他无疑是聪明的，他从不给自己留下潜在的敌人，所有曾经与他为敌的文明都被他毁灭了。”
墨痕：“告诉我怎么毁灭他。”
金盘：“为神的力量去摧毁另一个神。”
墨痕看向金盘，若有所思地点了点头。
金盘改变了话题：“作为元首，你应该摈弃感性，脑海中只有理性。”
墨痕不解这句如此突然的话代表了什么。金盘接着说道：“云轩确实是一个很好的将领，但也只是一个将领。他无法对无力反抗敌人下狠手，他的心中仍有怜悯，”“难道所有人类不都是这样吗？”墨痕反问道。“西罗斯，他的内心早已被绝对的理性所占据。想想吧，人类几千年的宇宙扩张最核心的内容，弱肉强食，黑暗森林。他也许是帝国绝对黑暗，绝对扭曲的产物，就像一个从工厂里走出的机器人。但是他，却是人类这个生物中最完美的产物之一，与之相对的，是成堆新生儿尸体。这就是你们人类的疯狂与勇气。许多文明无法生存下去，正是因为没有这种勇气。这种与低级生物虫族一样为了一个胜利而不惜牺牲一切的精神。当这种精神出现在一个高级生物身上时，那么这种生物就能成为一个5级文明！不过这种人，他注定无法成为一个文明的领导者。这个时候就需要你，我的元首，你经历过最后几次世界大战和人类在太阳系资源于最后一次世界大战结束后面临崩溃的局面，担任过第一个人类搜索殖民地的载人飞船船员。几乎人类步入星际时代以来所有最重要的时刻。你是目前唯一一个能够带领人类走向胜利的人，西罗斯太年轻了，与你同时代的有能力的人现在基本上全死了。”
墨痕：“所以你到底什么时候给我4级文明的技术？”
金盘：“成为4级文明就会被5级文明盯上，到时候就会面临选择。当然，我会给予你4级文明的传送技术。但仅此而已。”
墨痕：“我接受你的建议。但当时机成熟，再不交出技术，我马上把你扔进黑洞。还有，请搞清楚谁是元首。”金盘听了后怕了，毕竟4级文明远无法对抗黑洞，于是便答应了。
结束了与金盘的对话，墨痕马上告诉西罗斯如果金盘的利用价值消失，立马就销毁它。
过去已经被揭开，人类文明似乎更加处于一片风雨飘摇。
