（1）容易造成残膜污染。残留地膜的污染问题是覆膜栽培技术存在的重要问题。残膜能在土壤中存在很长时间而不降解，将对作物根系发育造成严重的影响。随着对残膜回收机具的研制与改进，可降解薄膜成本的进一步降低，残膜污染问题将逐步得到解决，不至于成为阻碍覆膜灌溉推广的主要因素。
（2）覆膜以后不便施肥。因为有地膜覆盖，所以作物追肥存在一定的困难。近年来研究的缓释肥料可以实现一次大量施肥，之后缓慢释放，因此其研制与推广为解决覆膜灌溉施肥不便的问题提供了途径。
（3）覆膜灌溉的推广前景。据统计，我国现有耕地面积约1.2亿公顷。到1995年，我国灌溉面积达0.5亿公顷，中低产田占0.13亿公顷，地面灌溉面积占总灌溉面积的95%以上。因此，发展覆膜灌溉不仅能增加单产，而且可通过节水来扩大灌溉面积。覆膜灌溉有着广阔的推广前景。
