政府将东京西区开发较慢的区域一次全部收购后，建立起这座“学园都市”，面积约东京都的三分之一。这个“学校之城”包含了数十所大学与数百所小学、初中及高中，总共有一千个以上的大小“研究机构”[。人口将近230万，八成的居民（超过一百八十万）都是学生。“学园都市”拥有世界上最尖端的科技，比外界先进二三十年，是科学世界的领导者。学园都市的由统括理事长亚雷斯塔·克劳利花了超过五十年打造，由“统括理事会”全权管理。由于技术、研究多数都是高度机密事项，学园都市内的警戒体制非常严格，对人员进出有严格的限制。
学园都市是一个由二十三个学区构成的巨大的教育机构的集合体，以发掘超能力而提供特殊的教育课程，主要靠从外部招收学生。除了教育机构，还有面向学生研究设施，生产、商业设施，国际展示场，国际机场等等在都市内生活的所需要的生活设施都齐备。
学园都市基本上是采取排外政策，不仅被围墙所包围，而且还有专门阻挡入侵者的警卫部队。学园都市的内外周围随时有人造卫星在监视着。
学园都市的学生，大部分居住在学校的宿舍中，并在各个学校中接受能力开发。学园都市的学生大都借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。有各种类型不同能力，以范围和威力分为无能力者（Level0）、低能力者（Level1）、异能力者（Level2）、强能力者（Level3）、大能力者（Level4）、超能力者（Level5）、绝对能力者（Level6），实际绝对能力者只是理论上存在进化为Level6的可能，并没有哪一个角色成功进化为Level6。并每隔一定时间会进行身体检查，重新测定一次，但学生中的六成是无能力者，而学园都市中超能力者也只有八人。
少年名为泷泽，他的故事即将在这所学园都市里展开。
【我是泷泽，一个无可救药的家伙。我记得我的故乡并不在这座城市，在我6岁的时候，突然出现一批穿着得体西装的家伙把我带到了这里。在这座城市挣扎了整整9年，现在我15岁。‘地狱’这个词的意思对当时的我来说定界很模糊，但这所名为‘学园都市’的地方配得上这个词语】
【刚刚接受能力开发的我就被评为Level 5，据说是学园都市最高等级。看着一群穿着白色衣服的家伙说着我听不懂的语言，我心里有点厌烦。那群家伙看着我的眼神是伪善的，尽管他们极力伪装但我依然看穿了。】
【在接下来的一年时间里，我接受实验的次数越来越多，同时我的大脑中似乎出现了另一个声音，烦躁....厌世....没有朋友....没有交流，两种相异的声音在充斥着大脑，终于在我七岁的那一天，身为Level 5的我暴走了，确切的说是能力失控】
暗质掌控，又称为【Dark Control】，创造一种属于我自己的暗物质赋予它们属性，借以进行能力应用，但必须要遵循现有的物理规则。
3月13日，我清晰记得那天，整个研究机构科学家，被试验者....以及一些杂物人员整整378名，全部被我杀死。
尽管我不记得过程。
从那之后，穿白大褂的家伙望着我的眼神中多了一种情绪——恐惧。
【我还因此庆幸，至少不再像之前那样恶心的目光了】
在4月15日，我被送进了[特例能力者多重调整技术研究所]，又称【特力研】。在哪里我第一次有了朋友，那个白色的家伙。虽然性格很恶劣但他确实是我第一个朋友，最重要的一点他跟我一样，我从他那里学会了日语，虽然交流不多，但至少可以在那种看不见未来的日子中找到一丝希望。
直到九岁，特力研被镇压了。我和那个白色的家伙也就分开了，从那之后的6年我与他仅仅见了2次。
这6年间，我一直在各大研究机构之间流转，又恢复了【货物】的感觉。但在一次的实验中，我认识了一个女孩，她叫桃莉，也就是她改变了我，不然现在的我可能早就去找亚雷斯塔算账了。
我不知道那个研究机构叫什么名字，因为呆过的这类机构实在太多了。
在那纯白色的房间中，突然有一天一个茶色短发穿着难看实验服的女孩跑了进来，欢呼雀跃地说道：“你就是我的新朋友吗？”
那脸上洋溢着可以让日月星辰都暗淡无光的笑容，我第一次见到。她跟那群穿着白大褂的伪善者不一样，挺令我费解的，为什么这种笑容可以出现在这里？
“是的。”我答应了她。
从那之后的生活就是陪她玩，虽然看起来很幼稚，但我真的很想看到她的微笑。难得的我又愿意配合实验了，那群伪善者也给出了承诺——‘只要你配合实验，我们保证你每天都可以见到桃莉’。
很简单嘛，只要能看到她，不管什么样的实验我都愿意接受。
慢慢地，她有了新的朋友——一个名叫警策看取的紫发女孩。我就在角落里安静地望着她，在别人面前我不愿有太多的谈话。
可有一天，那个女孩没有来，我使劲浑身解数都无法弥补那个女孩离开给桃莉造成的影响，就在这时有一个人来了。一个叫做‘食蜂操祈’的金发女孩，我还是如往常那样在角落里看着，默默记下了她的梦想——去看海。
但噩梦还是来了，那一天，我的大脑再一次地响起了两个声音，疼痛就如万千蚂蚁在啃食脑髓一般，我再一次暴走了。
但.....这次的暴走被桃莉拦了下来，在我恢复意识的时候，我的右手贯穿了桃莉的胸膛，但里面是机器一样的东西，不是内脏。
愧疚、悔恨、悲痛瞬间充斥了我的脑海。
“...泷君，不要伤心，我的时间原本就不多了....希望以后你能替我好好活下去，去看看这个世界，好吗？”桃莉努力地挤出笑容。
“发生了什么？为什么你的身体里都是机械，那群家伙对你做了什么？”我同时在愤怒着，悔恨着。为什么我没有早点发现？
可桃莉却再也没有机会回答我了。
怒火攻心的我准备毁灭这个机构，但被那个金发女孩阻止了，她也是一名Level 5，不知道她对我干了什么，顷刻间我昏了过去。
然后我又恢复了往常的生活，直到现在。
