当大家从周忱煜表演带来的狂热中清醒过来后，墨菲斯的训练就要继续进行下去了。
三人再一次进入了跳跃训练程序，这次训练没什么好说的，尼奥虽然开始尝试突破物理界限，但他初次跳跃还是失败了，感受了一下不带绳的蹦极是什么感觉。
至于周忱煜，虽然本人有一些恐高，但在矩阵的高楼中间，他怕是一句“键来！”都能起飞了。跳跃程序对他来说实在是没有难度。
晚上。
周忱煜看到赛弗靠在尼奥的门边，盯着崔妮蒂远去的背影。从崔妮蒂手中的餐盘来看，她刚刚给尼奥送过餐。
“她还是选择了尼奥，是吗？”
“啊！”赛弗吓得一阵激灵，要不是他靠在墙上，恐怕都会摔倒在地。赛弗回过头来，注意到是周忱煜，松了一口气，说道：“吓死我了，你走路都不带声么？”
“是你看的太入迷了。怎么样？我注意到你刚和崔妮蒂聊过，她还是选择了尼奥，对吗？”周忱煜也走到赛弗的旁边，学着他靠在墙边，追问道。
赛弗勉强的笑笑，回答道：“尼奥那小子是很特别，但比起你来说差远了，我不明白，她为什么还是对他那么特别。”
“人类的感情是很复杂的，我们谁也说不好。对吧，赛弗？”
周忱煜说的饶有深意，但他没有在意赛弗的回应，转身向赛弗招招手，“我困了，回去睡了。再见，赛弗。”
说完，周忱煜就回到了房间，留赛弗在原地。
接下来的几天内，尼奥和周忱煜每天仍是接受训练，不过随着在程序之外的时间的增加，周忱煜和船员们的关系渐渐的好了起来。
因为周忱煜的惊人表现，船员们对他都很热情，尤其是耗子，耗子简直成了周忱煜的粉丝，每天围着周忱煜转。
周忱煜和多泽、坦克两兄弟的关系也很好，这两兄弟是锡安的自然人类，不能进入矩阵，因此一直从事后勤工作，赛弗背叛后，杀得头两个人就是多泽和坦克兄弟。
虽然他们兄弟遭到了赛弗的背刺，除了最后的同归于尽，没有发挥更多的作用。但是当兄弟两个有了防备，他们其实可以是防止背叛的最坚实的防备。
正因为他们是自然人类，这就意味着，任何人都可能背叛，即使墨菲斯都不会不存在背叛的可能性，只有他们兄弟不会背叛。毕竟墨菲斯也是出生于矩阵，硬件设施在那呢，而自然人类在矩阵中没有生存的空间。
为了防备赛弗，周忱煜不停在三人独处时对坦克和多泽旁敲侧引，不停询问是否有人背叛过锡安，暗示尼布甲尼撒号上的几次行动不顺利是有内部人员泄露了消息。
“想一想尼奥的事，你们前一天晚上才刚刚接触他，第二天特工们就找上门来，你们就不觉得奇怪吗？”周忱煜近乎明示的劝说兄弟俩。
“可是，如果，我是说如果，我们中间真的有内鬼，会是谁呢？我们应该去告诉墨菲斯，让他来判断。”
“不行，首先这是我们的猜想，再说了如果真有内鬼，我们告诉墨菲斯容易打草惊蛇，在这艘船上能够完全相信的人，只有你们兄弟、墨菲斯、尼奥和我。你们一定要保守好秘密。再给我些时间，我一定想出些验证的方法。”
“好的，我们相信你，在你允许之前，我们谁也不告诉。”
“即使是墨菲斯？”
“即使是墨菲斯。”多泽和坦克斩钉截铁的说。
“多泽，坦克，你们在这里。正好，约翰你也在。”三人回头望去，是墨菲斯和尼奥，“来吧，约翰，你和尼奥现在要和我进入矩阵。坦克，去安排一下。”
在坦克准备好之后，三人又躺在了椅子上，就像以前几次训练一样。当周忱煜再次睁开双眼后，发现三人正站在人来人往的大街上，周围高楼林立，车水马龙，往来的人群行色匆匆，白领，工人，警察，每个人都各行其是。
墨菲斯走在前方，边走边偶尔回头为两人讲解。
“矩阵是一个系统，那个系统是我们的敌人。”
刚一听到这个开场白，周忱煜就知道，这是对他和尼奥警惕性与决心的训练，这里还不是矩阵，是又一个训练程序。这次训练的难点在于，管住自己的眼睛，别到处乱看美女，尤其是穿红衣服的。
墨菲斯继续讲解：“当你们身在其中，你看到了什么？商人、教师、律师、木匠。我们要拯救的正是这些人的意识，但在我们成功之前，他们仍是系统的一部分，这就是说他们是我们的敌人。”
“你们必须明白，他们大多数并不想被拔掉插头。”
你才应该明白这个道理，周忱煜听着墨菲斯的讲解，心中默默的想着，你的船上就有一不想被拔掉插头的人。
墨菲斯并不知道周忱煜的想法，继续为二人解说：“许多人已经习惯了，不可救药的依赖这个系统以至于他们会为了保护它而奋起反抗。”
这时，红衣女郎出现了，周忱煜早有准备，只是瞄了几眼就移开了目光。尼奥则表现的异常真实，眼睛都快长红衣女郎的身上了，馋人家身子，下贱！
“尼奥，你是在听我说话，还是在看那个红衣女郎？”尼奥遭到了点名批评。
尼奥收回了目光，试图解释。
墨菲斯打断了他，“回头再看一次。”
这次周忱煜和尼奥一起回的头，注意到一个黑衣人持枪指着尼奥的脑袋。尼奥正想躲闪，只听见墨菲斯一声“定格！”整个世界就完全静止了。
这是周忱煜第一次见到特工史密斯长什么样，上次接应尼奥时，周忱煜早早就在窗边守株待兔了，没有看到特工史密斯抓捕尼奥的过程。这下总算是见面了。
“这里不是矩阵？”尼奥懵懂的问。
“不，这是另一个训练程序，目的是为了让你们明白一件事。如果你不是我们中的一员，那你就是我们的敌人。”
“他们是谁？”
“有知觉的程序，他们能够进出任何仍与系统连接的软件。”墨菲斯解释了特工的本质和能力。“也就是说任何未被拔去插头的人，都可能是特工。”
“在矩阵中，他们无处不在，却又遥不可及。我们只有躲开他们才能生存，即便是你，约翰。即使你可能会击败特工，但他们会随时连接到周围的人上，你是耗不过他们的。”
周忱煜点头，这个道理他还是懂的。
“我们在矩阵中，无论如何都会碰到他们，与他们争斗。他们可以一击击碎混凝土，我们打光子弹特无法伤害到他们。所有与特工战斗的人都输了，但你们会成功的。你们两人中，有一位是救世主，就目前为止我还不知道是谁，当你们准备好了，我会带你们去见先知，交给她来判断。”
