这场战争进行了100多年，对大陆文明造成的伤害却远远超过了第一次人魔大战：由于魔族开始便动用了空中部队加之竟然将庞大的两栖魔兽黑暗象龟和龟族带到了以恒大陆，大陆中轴线——黑崖城堡一直到埃尔特尔山脉一线很快便被魔族贯穿。通过控制河流将不善水战的克旗族和兽人族联军切割成无数个独立的碎片，先用魔兽肆虐完后，主力军队再跟上给予毁灭性打击，大陆联军一度陷入绝境。战争波及了大陆中轴线两端近一半的土地，由克旗族和兽人为主建立的文明几乎被毁灭一空。大精灵族内部分裂，少数族人叛变成为魔族爪牙，成为魔族短程远攻的主力。
战争后半段，生活在大陆东西两侧的人族主要聚集区不可避免地受到了波及，小规模短兵相接后，人类发现仅适合人类和部分半兽人修炼的光明魔法对魔族气息有强大的压制和腐蚀作用，而由人类自己创新出来的斗气体系对魔族和魔兽的身体也能够产生致命性破坏。
逐水而居的人类早在几千年前便通过航运相互交流，为了更好生存、躲避来自陆地的侵扰，人族之间频繁利用水运进行通联，甚至远到哈维族也有海运船只常年保持相连。克旗族统治的四千多年，刻意扶持体质脆弱的人族发展，船只制造更是逐渐趋于大型化和精细化，危难之际由商船改装的中小型战船应时而生。人类强大的生产能力让各型战船短时间内就布满大江大河，精灵族射手对只能缓慢低空飞行的魔蝠进行了精准拦截和毁灭性打击，以人族为主力的大陆联军用了不到十年的时间就在水上战场征服了温顺的黑暗象龟和龟族人，从而夺回了水域的控制权，反过来将侵入大陆的魔族联军主力困在了原地。
由于最初魔族军队采取坚壁清野的政策，杀光、抢光、吃光了一切可以移动的生物，所以魔族被困以后物资匮乏，补充艰难。中部南部潮湿的气候，不但锈蚀了他们手中粗糙的兵器，也侵蚀了他们的身体，不久后瘟疫开始滋生，当他们开始相互攻击并以彼此作为食物的时候，瘟疫彻底爆发。等克旗族、兽人族恢复一些元气率领联军开始总攻的时候，大陆中南部广袤地区的魔族主力能够拿起武器战斗的已不足三万人。
尽管如此，克旗族带领的大陆联军对北方魔族的反击也进行了20年，期间因身体素质原因在打扫中部战场过程中大量人类被传染了瘟疫，并在人类聚集区域流行，所以除人类强者带领的少数部队，并没有太多人类参与后期的反攻。待大陆联军将最后一批魔军主力赶回空间裂隙的时候，已经打出火来的克旗族时任族长带领克旗族军队所有强者和仅剩的10万百战精兵冲进了魔族大陆。
一个月后，大陆联军统帅部中的兽人族、大精灵族和人类精英，绕过统帅部中的克旗族成员，私自开会决定轰碎空间裂隙，断绝魔族再次进攻的通路。各族最强者和人类空间魔法师在付出了巨大的代价后，击碎了黑崖城堡前所有中小空间裂隙，并让最大的空间裂隙塌陷。
这就是《大陆通史》中记载的第二次人魔大战。
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轰碎空间裂隙之时，大量克旗族老少妇孺闻讯赶到裂隙入口哀求联军救出族长，但是兽人族大统领指挥部队将数万平民赶进了裂隙后，毅然决然地轰向时空裂隙。此后近300年时间，骄傲而愤怒的克旗族发动了全面内战，讨伐背信弃义又残害平民的其他种族，但是在第二次人魔大战中损失惨重的克旗族再也无力撼动大陆所有种族联合的力量， 4600多年前，克旗族被大陆联军包围于现在的银狼及半兽人帝国月亮河流域的三角平原，全军覆没。
大陆自此进入兽人帝国时代。
战争全面结束后，支持克旗族的各种族从原种族彻底分化出来，一部分精灵族逃往现在的精灵草原，成为草原精灵，由于失去了生命之树和月亮井的祝福，人数虽然在增加，但是能力却逐渐削弱。之前叛变魔族的精灵逃往黑暗森林和卡尔比罗山脉，成为了现在的黑暗精灵，被大陆各种族世代讨伐和唾弃。而部分追随克旗族的矮人则逃往冰霜森林，成为冰霜矮人，但是由于他们在当时不是主战兵种，主要负责冶炼、锻造，而且他们冷锻技术是火山矮人无法替代的，所以战后地位倒没有太大降低。
幸存的黑暗象龟被兽人大贵族驯服后圈养起来，当成了玩物；因随后的内战广泛而惨烈，大陆各种族都无力清剿残存的低级魔族和各类魔兽，跟随魔族来到大路的弱小种族龟族、蛇族等各自找到栖息地低调生活并与大陆种族开始融合。大量魔兽则躲进各个森林、沼泽、草原、沙漠等偏远区域，与以恒大陆的魔兽们或战争或和平共处。
内战结束后两百年间，兽人帝国对克旗族施行了残酷而血腥的统治，大陆上工作最艰苦的地方：矿山、荒原、基建、森林以及冰海等等，全部成为克旗奴族血泪史的见证者。两次大规模反抗都被灭绝性镇压以后，大陆上彻底没有了克旗族的身影。
利用内战的机会，人类牧师治好了大多数瘟疫感染者，光明教会借机以科罗族最著名的大智者宣启的话作为口号：执光而行，守之以恒，解释为只有信任光明教会，才能永远守卫大陆。而战后，各种族需要寄托以平复精神上的巨大创伤，一时间光明教徒作为神的使者行走世间，开始迅猛崛起。（宣启哭晕在厕所，他所接受的传承里根本没有光明教义，他一生都奉献给了科罗族的民生、科技发展和此后的大陆抵抗外族侵略的战争中，哪有时间研究那些神神道道的东西。）
为避免双线作战，兽人被迫与人族谈判，人类得以在狼牙山脉南麓、科莫尔河与瓦尔杜纳河形成的三角形冲击平原（现在的辉煌帝国全境），菲力加罗山脉南段、湾流河流域（现在的蓝水帝国和斯维卡帝国部分区域），科莫尔河东段、齐河流域（现在丰阳帝国正中部）成立了辉煌、蓝水以及丰阳三个公国，并大力发展航运，三条横亘东西的大河让三个公国首位呼应，商业、科技以及军事交流畅通无阻，人族文明得到了飞速的发展。
而大精灵族因为经历了黑暗精灵和草原精灵的两次分裂，元气大伤，退回了灵异森林继续安之若素；矮人族也在经历了火山矮人和冰霜矮人的分割后，无力抗衡兽人强权，火山矮人在大陆东部的丹尼半岛以及火焰群岛建立了矮人王国，与冰霜矮人隔着晨风海峡遥遥相望。
兽人帝国立足于狼牙山脉、艾和拉玛山脉一线南北两侧，拥有瓦尔杜纳江以北所有的土地，广袤的草原和平原，军事力量空前强大，数十万骑兵可以顷刻间将人类任何一个公国踏平。但其管理国家的能力比克旗族尚远远不如，更落后于当时人类的公国。没多少年就走上了克旗族的老路——没有可抗衡的力量加之慵懒的性格，穷兵黩武、横征暴敛日盛，导致大陆其他种族的王国和公国苦不堪言。社会生产力增长极其缓慢，文明出现了倒退，成为大陆历史上唯一没有辉煌成就的一段岁月。
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这种情况维持了1000多年，3000年前，再一次双月浮空的时候，大空间裂隙再次被撕开，魔族军队这一次露面，保持冷血残酷之外体现出了极度的正规性和执行力——有了文化的强盗无疑更加强大。这时候以恒大陆政治、经济、军事经历了兽人族长达千年的恐怖统治，停滞不前，战争开始仅仅一个月，兽人帝国狼牙山脉、艾和拉玛山脉一线以北的所有领土便全部沦陷，强大的兽人骑兵部队于广袤的草原上被分割成数块苦苦支撑，逐渐失去作战空间的骑兵将比步兵覆灭得更快。
随后，闻讯赶到的大精灵族、人族、矮人族军队配合北部撤下来的兽人军队主力，在狼艾峡谷与魔族军队展开了近一年的血腥争夺战。魔族军队大多于夜间发起攻击，大陆联军在夜间就利用地形建筑层层工事严防死守，白天用半兽人奴族部队进攻魔族阵地，骑兵跟进反复冲击。不需要俘虏的战争进行得机械而残忍，那一年狼艾峡谷的每一寸土地、崖边都被鲜血、腐肉浸泡过，直到今天，狼艾峡谷每到雷雨时节，还能从空气中隐隐闻到血腥的味道。
一年后，另一支魔族军队竟然在大陆西侧夕阳之海登陆，从灵异森林北部边缘也就是现在的铁岩城堡西侧紫霞山一线进入大陆。人类率先得知这份情报，主动请缨，由当时人类领袖吉宁.谢克曼和光明教会教皇带领迎敌，经过数月苦战，在现在的英雄峡谷附近把这支魔族军队牢牢钉死。
而随着魔皇族带着黑暗龙族出现，驻守在狼艾峡谷的大陆联军彻底崩溃，大量身经百战的精英部队覆灭在峡谷之中。奇怪的是，此后近三年的历史与当初科罗族缺失的500年一样断绝了，所有大陆史书都没有记载这段时间究竟发生过什么。倒是三年后的历史被各种版本记录得非常详细，首先是大陆龙族开始参战，以恒大陆各种族也是第一次知道在大陆的另一端生存着龙族这种强大的生物，大陆龙族几乎第一时间就赶跑了大多数黑暗龙族，并留下一头冰霜巨龙在漠北森林驻守。其次是兽人帝国在付出了巨大代价之后，联合人族、精灵族以及矮人族，完全击退了北部魔族，在这期间人类竟然使用了科罗族之前用神降金属打造的7把神兵以及5000副重铠（顾岩子奇的龙斩就是其中一件），这些武器装备在战争中发挥了巨大的作用。最后于黑崖城堡之下，彻底消灭了北方魔族主力，追杀月余，斩尽残余魔族后再次封印了时空裂隙，而后大陆联军转而集中兵力将西部魔族赶回了大海。
这就是大陆通史中记载的第三次人魔战争。
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此次大战历时50余年，与第一次人魔战争一样，战争主要集中在瓦尔杜纳江以北。兽人族失去了60%的人口以及80%的军事力量；魔皇族和黑暗魔龙的第一波进攻就让大精灵族和矮人族历史级的酱油主力几乎全军覆没；而人族聚集地全部在瓦尔杜纳江以南，战争中除了战斗人员损失严重外，农业、社会稳定、经济、科技以及基础建设等几乎没有受到任何伤害，战争前后种人口总数量竟然增加了10%。于是，在战后的大陆联盟会议上，兽人族和人族因为利益分配问题产生了巨大分歧，最终不欢而散。
战后一个月，人族军队主力在得到了大量后勤补给后，由吉宁.谢克曼率领全线渡过瓦尔杜纳江，汇同留守在英雄峡谷和谢巴尔河流域的人族军队向千疮百孔的兽人帝国进行了猛烈攻击，两个月后，兽人帝国首都沦陷，兽人全部退到现在的兽人大草原和乌拉格大草原。
正当吉宁.谢克曼准备北进狼艾峡谷，对兽人族发动最后一击的时候，人族内部出现了分歧，久历战争的三大公国民众厌战、反战浪潮高涨，迫使三大公国大公撤出了大部分军队。同时精灵族和矮人族也联合发出了停止大陆内战，各种族需要繁衍生息的倡议，吉宁.谢克曼的军队止步狼艾峡谷。
虽然此次战役兽人族没有像科罗族、克旗族一样被灭族，但是巨大的人员损失让他们短时间内彻底失去了翻身的机会，大陆成为了人族统治的大陆。
