回到留城，部队带回营地，由赵云统率训练龙骑营，由张辽带高顺亲自训练的三十人统率训练陷阵营。而刘琦则得到短暂的安宁。陪貂蝉张宁一起读书，与郑玄一起研究《算术》，同左伯毛弦讨论书法改进造纸……生活轻松而充实。
公元187年，中平四年。
二月，荥阳农民起义。斩杀中牟令落皓及主薄潘业。三月，河南尹何苗带兵平叛，义军败。
韩遂杀边章及北宫玉伯、李文侯，进攻陇西。陇西太守李相如反叛，与韩遂结盟。
八月，原中山太守张纯纠结原泰山大守张举反叛。与乌桓大山丘力居结盟，杀护乌桓校尉公綦稠、右北平太守刘政、辽东太守阳众。汉灵帝命南匈奴单于羌渠率兵随幽州刺史刘虞进讨张纯，休屠各胡反。又令骑都尉公孙瓒率兵平叛，公孙赞大胜于石门。
同时，长沙区星率众造反。朝庭任命孙坚为长沙太守，剿灭区星。孙坚因平叛有功被封乌程侯。
而留城的刘琦则与郑玄一同完成《算术》的编注，与左伯毛弦改进的“左伯纸”初成。
赵云多次率龙骑营突进草原腹部驱逐鲜卑部落，步度根不堪受扰，下令西部各部落纷纷北迁。“大汉龙骑”响彻大草原，赵云也赢得“龙胆将军”称号。
十一月，郑玄的学生大儒管宁携东莱人太史慈到留城。刘琦大喜，任太史慈为龙骑营副统领，随赵云训练骑兵。管宁则随郑玄专心治学教书。
同年，大儒陈寔病逝，终年84岁。海内学士三万余众前往吊孝。
公元188年，中平五年。
二月，郭太等黄巾余众在西河郡白波谷再度起事，联合反叛的南匈奴休屠各部，攻略太原河东等地。西河郡守刑纪被休屠胡人杀死，南匈奴单于羌渠被杀，刺使张懿战死。并州大乱。
三月，太常刘焉以天下兵寇不息，刺史手中无兵权难以安定天下为由，上书灵帝，改刺史为州牧，加重其职权。灵帝为镇压此起彼伏的农民起义，采纳刘蔫见议，改刺史为州牧，并选派列卿、尚书出任州牧。宗正刘虞改任幽州牧，太常刘蔫任益州牧，太仆黄琬为豫州牧。于是州牧成为居于郡守之上的行政长官，拥有一州的行政大权，位高权重。从此州牧各据一方，形同割据，也加剧了汉末诸候纷争局面的形成。
六月，益州马相、赵祗起兵叛乱，杀刺史却俭。益州从事贾龙聚州郡兵讨代，迎刘蔫入川。
八月，灵帝见外威何进拥兵过重，为了制衡权势熏天的何进、何苗兄弟，在西园置统帅部，组建新军。新军没八校尉：上军校尉宦官蹇硕、中军校尉袁绍、下军校尉鲍鸿、典军校尉曹操、助军左校尉赵融、助军右校尉冯芳、左校尉夏牟、右军校尉淳于琼。上军校尉蹇硕成为全国最高军事统帅，外戚大将军何进与宦官“十常侍”势同水火。
同年，太行山一带黄巾余众在张燕带领下，居山立寨，北扰并州，南袭冀州，称“黑山军”。
十一月，王国叛乱，兵围陈仓，灵帝拜皇甫嵩为左将军，督前将军董卓，引兵四万，前往围剿。
丁原上任并州刺使后，招各郡兵马于太原聚集，说是要剿灭白波军及南匈奴叛军。张杨引河西郡兵，吕布引五原郡兵，郭缊引雁门郡兵响应。
郭缊出兵后，引刘琦至阴馆，代行太守职务，又向刘琦借走私兵一千。刘琦为了练兵，让高顺、张辽亲率陷阵营一千随郭缊讨敌。
由于何庆、高顺被郭缊带走，刘琦表平城县尉关羽统兵戍边，郭缊应允，暂封关羽为东部都尉，领军司马典韦镇守北关。
刘琦引赵云太史慈领“龙骑营”一千将士护着田丰南下阴馆，周仓相随。国渊总领留城事务，裴元绍夏侯兰重招两营士兵进行训练。在田丰的协助下，刘琦迅速掌控了雁门各县，并下令招募郡兵，以防黑山军北上。
突然间要治理一郡之地，刘琦才发现人手严重不够用。开始想念颖川的诸位大贤了。
谁知丁原招集了部队后却不肯作为，并未对白波军进行有效的打击，也未平息南匈奴的叛乱。郭缊不满，罢官回家，并上表朝庭，荐刘琦为雁门太守。
丁原是个武人，本就看不惯文人统兵，郭缊罢官后，重用张扬，升吕布为主簿，并收为义子。可怜了高顺张辽，撤又撤不走，反又不敢反，还好吕布与刘琦有旧，多方照应，并向丁原举荐高顺张辽二人。高顺只想护住刘琦家底，只领兵不受高官；张辽怕引丁原不满，接受了丁原的安排。
刘琦得到消息心急如焚，接下来丁原就要率军进京对抗董卓了，那一千陷阵营可是刘琦的心头肉啊，要是吕布抵不住诱惑降了董卓，那这一千将士该如何是好？最重要的是还有两员良将啊！千军易得，一将难求啊！
刘琦连忙给吕布去了书信，要吕布对陷阵营将士多加照拂。而吕布也正在担忧若五原有失，九原的妻女如何是好，便回信请刘琦帮他将妻女接来送至太原。刘琦马上安排赵云领三百龙骑营将士前往九原。
公元189年，中平六年。
二月，皇甫嵩大败王国，董卓与皇甫嵩交恶。
赵云将吕布家眷刚接到雁门，定襄、云中、五原、朔方、上郡都相继失守。朝庭见丁原无所作为，便罢了丁原并州刺史，降为武猛都尉。病重的灵帝升董卓为并州牧。
丁原弃了太原引并州军士人马，屯兵河内。
而董卓因并州实在太乱，也不去上任，引五千凉州兵马，屯于河东。
刘琦无奈，只好暂时将吕布家眷留在阴馆，悉心照料。
三月，刘虞到任幽州，丘力居率乌桓主动归降。张举、张纯逃往塞外，余部或降或逃。张纯的门客王政刺杀了张纯，提其首级献于刘虞。至此，张举张纯叛乱平息。
四月，灵帝刘宏驾崩，皇子刘辩即位，是为少帝。少帝生母何皇后被尊为太后，临朝听政。大将军何进和太傅袁隗共参录尚书事，执撑朝政。外戚何氏专权。
同时，何进为培养朝内外党羽，奏请朝堂起用刘琦。刘琦以十五岁之龄接任雁门太守兼护北鲜卑校尉。
刘琦初始势力范围形成！
