依本人之见，这个世界最仁慈的地方，莫过于人类思维无法融会贯通它的全部内容。我们生活在一个名为无知的平静小岛上，被无穷无尽的黑色海洋包围，而我们本就不该扬帆远航。科学——每一种科学——都按照自己的方向勉力前行，因此几乎没有带来什么伤害；但迟早有一天，某些看似不相关的知识拼凑到一起，就会开启有关现实的恐怖景象，揭示人类在其中的可怕处境，而我们或者会发疯，或者会逃离这致命的光芒，躲进新的黑暗时代，享受那里的静谧与安全。
——H.P?洛夫克拉夫特
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游戏在大多数人的眼里不过是智力玩具，但它的起源只是这样吗?最古老的游戏发现在古埃及，那是一种可决定生死的决斗!
在那个奇幻世界的上古魔物向古老人类袭来，人类强者通过对自身能量或某种意志的投影将其可雕刻在石板上来抵御魔物的入侵。
随着不断的理解，发现内心的黑暗是一切魔物的源泉这是可通向异世界大门的钥匙，便与其魔物签订契约化为精灵来控制强化自己，但这又是一场灾难的开始……
力量的不平等与心灵腐蚀导致一又一场战争，那是世界对人类的诅咒。人们为了自身欲望互相的夺取对方的资源这是一切生命不可避免的本能，世界一度濒于毁灭l
这时候伟大的法老人与异世界的神签证平等契约；集合世间一切精灵的力量制定规则约束力量，来平衡世界的力量体系，精灵因其只是被契约者限制力量但又可以获得能量，其契约者会受到一切代价。其内容是一切“神圣的规则”的基本属性：
【一】这个世界禁止一切的杀伤、战争与掠夺。
【二】所有纠纷一律通过在游戏中决一胜负来解决。
【三】游戏中须赌上双方皆认为对等的赌注。
【四】在不违反第三条的情况下，游戏内容、赌注皆不受限制。
【五】受挑战的一方有权决定游戏内容。
【六】“神圣的决斗规则”所打的赌绝对要遵守。
【七】集团纠纷应指定全权代理人。
【八】游戏当中有不正当行为者，一旦败露就视同败北。
【九】以神之名宣布，以上各条皆为不变的规则。
【十】大家一起和平的玩吧!!
这种决斗规则流传下来，便所谓的“黑暗决斗”!其契约者被后人称为“黑暗决斗者”。
古老的约定随着时间的流逝逐渐被人们给遗忘变成了一个古老的传说。
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在近代的一座聚集着众多优秀的研究所，其中最出莫过于海马研究所。二位伟大的科研人员的邂逅，其二人领导的科研团队的努力让「实体影像技术」不断地完善和发展，并逐渐应用于人类的各项生产生活中。
然而，其中一人因预感到过度发展的「实体影像技术」终将让那个古代传说再度出现，从而为世界带来灾难的。毅然决然地放弃了作为「实体影像技术」科研团队的领队工作，并为了实现让「实体影像技术」应用于为世人带来快乐的「娱乐决斗」的领域。这个宏远目标而立志成为首位「娱乐决斗者」并教导后人。
但在步入「娱乐决斗者」的道路之前，他将之后对于「实体影像技术」的研究全权转交给了另一位负责。
体会他到的坚定觉悟的另一位打算并助一臂之力。于是，在二人将合作领导研发的「实体影像技术」的仪器微型化来应用于「娱乐决斗」之后，其2人进一步创造出了「娱乐决斗」的象征——「灵摆召唤」！
而始料未及的是：「灵摆召唤」，这象征着二者之间的友谊的召唤法，却带来了世界毁灭的前兆......
由于「实体影像技术」带给「决斗怪兽」的真实触感，人类开始痴迷于「决斗怪兽」之间的对战，触发了对于『「决斗怪兽」带来的真实破坏性』的追捧热潮，且对这种真实破坏性的追求与日俱增。
在他离开的岁月里另一位发现惊人的秘密。原本「实体影像技术」的基础理论是：在真实世界人工创造出名为「虚拟次元」的空间，在「虚拟次元」中存在着的大量的「质量粒子」由和「实体影像技术」相关的仪器构建出的影像对应地引导出来，并通过「质量粒子」和「实体影像技术」的结合来构建出「带有质量的实体化物质」。其最早起源于亚当和夏娃的合作科研项目，并在那之后的时光里被其二人创造的科研成果的基础上完善到极致，从而应用于人类的各项生产生活的领域中。但他认为如果将无限量的物质封存于决斗怪兽卡内，就可以展现出决斗怪物真实生命体征的端倪从而穿梭于宇宙空间的引发无限的可能性，将他们的研究引导世界的进入一个新的次元。为了实现其自身内心的夙愿而致力于扩张「实体影像技术」在次元之间所构建的「虚拟空间」的研究，并执着于进一步实现将大量物质通过「虚拟空间」进行次元之间的转移过程。
在研究所中一张卡中接受大量质量，他疯狂看着卡牌承受力的不断的加强相信一定成功的。
在其时间里研究所外里来了一位穿着黑白交叉风衣，脸上是留着一金色条纹白面具的男子让人引起注目的是左手饰带着看似最新型决斗盘和一头烈焰般黑中带红、刘海金黄的三色头发，前额带着一撮闪电形状的刘海让他变得神秘起来。看着建筑物缓缓的举起右手指着，四周飘浮的能量向手头聚集形成一个整体灰暗色，棱边金黄色透露着一股古埃及风格的立方体。
随着立方体的出现，能量开始也暴动起来涌向研究所。男子低沉沙哑开始说道。“吾之愿望在今终于完成，向世人展示的你的力量吧!「量子立方」Energy liberation~”
天空扭曲起来散发一股邪恶恐惧。周围的建筑物崩塌，大地撕裂，人们疯狂犹如世界末日一般。除那名已经疯狂的研究人员，他死死盯着台上一张诡异的卡，喃喃自语道：“出来吧!出来吧!”与无惧跑来的一男一女。
男子的头发与男子相以，但穿着似乎是学校校服的深蓝色服装，呈现出风衣的形状。女的同款校服为粉红色上衣加蓝色领结，蓝色裙子，一头长到了肩部头发为深棕色，眼睛为蓝色。
“这是命运中宿命啊!你来了决斗王!”
“你把他干了什么，暗面!”
“我本是我，他本是他、我本是他，他本是我。”
“又是你这个宿命说，那让我们用决斗来说明吧!”
称为“暗面”的男子将右手的量子立方放置在左手的决斗盘上，解体向其中注入能量。决斗盘前方形成红边黑色如同的龙翅般的卡域，衣服出现深蓝色条纹散发黑色粒子，道：“次元领域开启!”
“决斗!”
女子看着两个人的担心起来，握住手中的决斗盘。
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【暗面LP4000：异发男子LP4000】
“那我们二人的命运由我开始吧!我的回合~”暗面由平淡嘶哑的声音透露着一丝兴奋，“我随机将额外卡组的一张卡里侧表示除外发动，连接地狱入口，不被命运女神眷顾的地方，一切任随天命的地方啊!连接魔法卡【湮灭之井】［↖↑↗］。这张卡发动后继续留在场上，用对方回合计算的里侧表示除外的连接标记数目的回合后的对方结束阶段破坏，除外的是连接4。这张卡在场上可使用额外区域，被送去墓地时破坏场上的额外怪兽。”
异发男子看到一对全新种类的卡，回想之前发生的事件，惊讶道：“难道是你……”
“从手牌中将刻度4的【霸王眷龙暗黑亚龙】设置灵摆刻度，发动灵摆效果1回合1次，自己场上没有怪兽存在的场合才能发动。从卡组选1只「霸王门」灵摆怪兽在自己的灵摆区域放置。这个效果的发动后，直到回合结束时自己不是暗属性怪兽不能灵摆召唤，我选择的是刻度13的【霸王门无限】设置在灵摆区域，这样我就可以同时召唤手牌与额外卡组中表侧存在的等级5到等级12的怪兽，摇摆吧，魂之灵摆，在神话与科学描绘出光的弧线！灵摆召唤!现身吧!吾的仆人~世界虚假与心外无物的三贤者，等级10的【神科学因子卡斯帕】（ATK0）、【神科学因子梅尔基奥尔】（ATK0）、【神科学因子巴尔塔萨】（ATK0）。”
三体因量子力学的观测者之眼和佛教的唯识种子反复扭曲的伯利恒之星，带来新的世界。
“【神科学因子卡斯帕】效果:一回合一次，这张卡的等级下降2星，这张卡以外的自己场上的全部表侧表示怪兽的等级变成1星，我对等级1的「梅尔基奥尔」和「巴尔塔萨」用等级8的调整怪兽「卡斯帕」调星!聚集的祈愿，将打开全新时空间的大门迎接将来受难死亡的象征的降临!〔8＋1＋1〕同调召唤~等级10【时械神祖武加大】（ATK 0）。
“还没完!【神科学因子巴尔塔萨】效果：一回合一次，这张卡作为同调召唤的同调素材的场合，支付一半基本分才能发动。那次同调召唤使用过的一组同调素材怪兽全部从自己墓地特殊召唤。接着发动【神科学因子梅尔基奥尔】的效果一回合一次，这张卡可以作为融合怪兽的一体素材使用，且可不使用「融合」魔法卡进行融合召唤，我将等级10的「梅尔基奥尔」「巴尔塔萨」「卡斯帕」融合!三股力量合而一体时，将来自时空的王权的象征的复苏，融合召唤~【幻魔帝三联电子人】（ATK4000）。［LP 4000→2000］
“再次发动【神科学因子巴尔塔萨】效果：一回合一次，这张卡作为融合召唤的融合素材的场合，支付一半基本分才能发动。那次融合召唤使用过的一组融合素材怪兽全部从自己墓地特殊召唤。我将等级10的「梅尔基奥尔」「巴尔塔萨」「卡斯帕」叠放!用三体怪兽构筑叠放网络，现身吧！神性与混沌的象征的暗之使者，XYZ召唤~阶级10【No.XX 无限之达克霍普】〔ORU3〕（ATK4000）。”［LP 2000→1000］
异发男子看着同调的「时械神」!融合的「幻魔帝」!超量的「No.」!无论那一个都是决斗怪兽的巅峰，他的血在沸腾、他的心在燃烧。
“【No.XX 无限之达克霍普】效果1回合1次，以自己场上1只特殊召唤的怪兽为对象才能发动。这个回合的结束阶段，自己回复那只怪兽的攻击力数值的基本分，我选择「无限之达克霍普」，”暗面抚摸着这个陪伴自己的决斗盘和卡组，说道“终于要到这个时刻了吗?那么来吧命运!”［LP1000→5000］
“如果这就是你的宿命吗，那么就由我来冲破!我的回合!”异发男子坚定的信念由眼神发出，在将准备抽卡时被一道机械声音打破。
“乱入惩罚2000点。”
在一旁女子突然闯入来，她的眼里不再有迷惘只有超乎一切凡人的坚定，说道：“我不会让你们决斗的!我们不是伙伴吗？”［LP2000］
“我的回合!抽卡~我发动魔法卡【流转的生命力】手卡全部送入墓地，从墓地中的「花上」、「鸟间」、「风中」、「月下」盖伏在场上，之后连接发动被丢弃的怪兽卡【抛弃的复仇者】效果：这张被送去墓地时支持一半基本分才能发动，双方基本分差每有500，双方从额外卡组丢弃一张。因此你我丢弃10张。”［LP1000］
暗面平淡地把额外卡组挥洒空中，看中了一张说道：“【不屈的复仇者】效果:这张卡被送去墓地时可以把灵摆区域的卡全部破坏，之后支付2000基本分把卡组里两张灵摆卡放置进行灵摆召唤，我选择的是刻度0的【降神之魔术师】与刻度13的【降魔之魔术师】设置在灵摆区域，这样我就可以同时召唤手牌与额外卡组中表侧存在的等级1到等级12的怪兽，摇摆吧，魂之灵摆，在神与魔下描绘出光的弧线！灵摆召唤!同时发动灵摆区域【降魔之魔术师】灵摆效果:另一边的自己的灵摆区存在「降神之魔术师」场合，灵摆召唤时控制者可放弃特殊召唤手牌与额外卡组变成把卡组与墓地的等级10到等级12的怪兽无视条件特殊召唤!现身吧!吾的仆人~赋予人世希望与绝望的时空，等级10【创世终焉龙】~以那深远的力量，叠加吾之愿望，等级12【霸王龙扎克】~同时【降神之魔术师】效果：另一边的自己的灵摆区存在「降魔之魔术师」场合，灵摆召唤成功时控制者场上等级10到等级12的怪兽属性变为神，不受陷阱与怪兽效果的效果影响，而魔法的效果也只能影响一个回合。如果你想打破这命运，那么来吧!”［LP3000］
女子在心中坚持下毫不担怯，说道：“我会阻止你的，发动刚盖伏的集聚大地母亲气息的永续魔法卡【花上】，在墓地里存在三只XYZ怪兽以上时并且在【花上】发动之时可以发动集聚跃动生命气息的永续魔法卡的【鸟间】效果：场上?墓地的XYZ怪兽以及除外的XYZ怪兽当作通常怪兽使用，那个效果无效化。在墓地里存在三只同调怪兽以上时并且在【鸟间】发动之时可以发动集聚吹拂之风气息的永续魔法卡【风中】效果：场上?墓地的同调怪兽以及除外的同调怪兽当作通常怪兽使用，那个效果无效化。在墓地里存在三只融合怪兽以上时并且在【风中】发动之时可以发动集聚深远宇宙气息永续魔法卡【月下】效果：场上?墓地的融合怪兽以及除外的融合怪兽当作通常怪兽使用，那个效果无效化。”
五体怪兽随着自然之力消失自身的煞气，在场的人惊讶看着天空恢复起来。但研究所里也因为效果变得不稳定。
“不可能的~”
“回来吧!”女子温情又坚定的举起右手中闪烁的四个手镯发出五颜六色，说道：“我因【花上】的效果将场上所有怪兽的效果无效，并且每有一只送去墓地的怪兽就给予其控制者600点伤害，将一切力量返回大自然，变回那纯粹的你!”
“这是不可能的，我突破这命运!”暗面因其力量的剥削半跪，他不想认输、不想回归黯黑世界。他取出在决斗盘的量子立方将其捏碎。
“四天之龙啊~将吾之宿命继承下去，吾等终将合为一体~
“始源与终极的命运!崛起之时终将指引神洗净世间罪恶之魂，此即为制裁世界的「G?O?D」赋予于吾最后的希冀，同时将一切引导至绝望吧!”
暗面说完便黯然神伤，化为粒子回到大自然。［LP0］
女子的四分为一与四天之龙同时穿越到四个命运之子上，等待再一次宿命的轮回。
「G?O?D」来到研究所的卡上，并且引发被后人称之为「世界幻影」的灾害。
