寺庙里敲钟的规矩都是一样的，正像宋朝诗人陆游说的那样：百年鼎鼎世共悲，晨钟暮鼓无时休。所谓晨钟暮鼓，并不是很多人以为的那样，早上敲钟晚上敲鼓，而是不论早晚，都既要敲钟又要击鼓。
早晨和晚上所不同的是，早晨是先敲钟后击鼓，晚上是先击鼓后敲钟。早晨在卯时敲钟，也就是早晨五点到七点间，太阳升起的时候；晚上在酉时敲钟，也就是下午五点时至七点间，太阳下山的时候。
敲钟的方法是紧敲十八下，慢敲十八下，不紧不慢再敲十八下。如此反复两遍，共一百零八下。为何要定为一百零八下呢？一种说法是一年有十二个月、二十四个节气、七十二个候（五天为一候），合为一百零八。钟鸣一百零八响，象征一年轮回，天长地久。另一种说法是，人有一百零八种烦恼，钟鸣一百零八响，以尽除人间烦恼。
除此之外，金山寺里的钟还有另外一个敲法，只敲两长两短四下。这是在寺中有大事发生时，通知全寺僧人集合用的。此时已是深夜，金山寺内钟声骤然响起。当僧人们听到两长两短的四声钟响时，便知道寺中有大事发生。众僧顾不得深夜，连忙起身穿衣，来到大雄宝殿集合。
大雄宝殿是金山寺的主体建筑，建于明朝时期。大殿歇山重檐，雕梁画栋，黄墙红柱，金色琉璃屋面，白石柱础栏杆，气势雄伟庄严。大殿为正方形，殿高和殿深都是八丈一尺，殿内三十六根子柱擎立。金山寺的大雄宝殿既有北方宫廷雄浑富丽气势，又有南方园林精美雅致的风格，大殿外墙书“庄严国土，利乐有情”八字。
殿内正中供奉的是释迦牟尼佛，阿弥陀佛和药师佛分立两侧，再两旁为十八罗汉。背面为南海观音像，两旁站立善财童子、龙女。中有金山寺德云比丘，金山寺海岛图也在其中，特别引人。大殿上方四周，圈棚列出五十六尊罗汉。日本兵来到殿中，顿时感觉到庄严的佛教气息，身上的煞气立刻弱了很多。
不一会儿功夫，方丈看僧人到齐，清了清嗓子说：“这么晚叫大家起来，因为刚刚有一个逃犯藏到了寺中，这是皇军亲眼所见。大家安心在殿中念一会儿经，待皇军搜查完毕之后，再回去歇息吧！”
说完，住持自己在大殿正中的蒲团上盘膝坐下，开始专心诵经。寺中僧人一听，立刻交头接耳的议论起来，大殿中顿时响起嗡嗡的议论之声。
方丈用力敲了敲木鱼，高声说：“别吵了，都赶快坐下诵经吧！”一个执事僧站出来说：“方丈师兄！我等睡下之前，并未见寺中有人进入，睡下后也没听到任何动静。方才我问了知客僧，他说从未开过寺门，怎么会有贼人进入寺中呢？”方丈重重敲了敲木鱼，严肃的说：“不要说了！就让皇军去搜一搜，大家都坐下念经吧！”众僧只好依言坐下。
日军小队长满意的点了点头，带着十个手下离开了大雄宝殿，开始在寺中搜查起来。待日军离开大雄宝殿之后，方丈这才叹了口气，语气沉重的对众僧说：“你们别看日本人表面上客客气气，其实那只是他们敬畏我佛，并不是因为咱们这些僧人。如果不顺着他们，恐怕会为寺院惹来祸端的！虽说日本人追捕的，肯定是抗日志士。但我们没看他来到寺中，更不知道他藏身何处，实在无从遮掩啊！”
日军宪兵小队失去了军犬，无法再靠狗鼻子追踪，现在也只能靠人眼了。小队长无奈的吩咐道：“大家分头搜吧，三个人一组，小心那人的偷袭。我和副队长在院中盯着，防止他趁机溜走！”
九个宪兵分成了三组，一间房一间屋，仔细的搜索起来。寺中僧人都已经到大雄宝殿集合，所有的房间里都是空无一人，他们搜了一会儿毫无发现。金山寺房屋并不多，日本兵很快就搜完了所有的僧舍，只剩下一座慈寿塔没搜了。
慈寿塔又名金山塔，建于一千四百年前的南朝齐。唐宋时期本有双塔，叫“荐慈塔”、“荐寿塔”。1472年，日本画家雪舟等杨曾经登游金山，绘制了《大唐扬子江心金山龙游禅寺之图》，图上有南北相向的两座宝塔。慈寿双塔后毁于火，双塔倒坍后，明代重建一塔，取名慈寿塔，到清代咸丰年间此塔又毁。
光绪二十年，金山寺住持隐儒和尚誓建此塔，去北京向清廷呼吁，慈禧命他自行募捐修建。他奔走南北，沿门托钵，多方募化，并得到两江总督刘坤一的支持。历时五年，终于募银二万九千六百两，重建后仍名慈寿塔。此塔玲珑、秀丽、挺拔，矗立于金山之巅，和整个金山及金山寺配合得恰到好处，仿佛把金山都拔高了。
慈寿塔外的花墙上，刻有“天地同庚”四个大字。这四个大字写于清代光绪年间，是湖南一位八岁儿童李远安所书。相传，当年塔建成之时，正逢慈禧太后六十岁寿辰。为了贺寿，两江总督刘坤一特地进京朝见慈禧，献媚道：“老佛爷六十大寿，臣没有什么厚礼。只是在江南镇江金山上造了一座宝塔，取名慈寿塔，祝您长寿万岁。”
慈禧心想，这宝塔标上她的名字，兀立在江南名山之巅，实在是非同一般寿礼，不由渐露喜色。便问刘坤一：“你祝我长寿，我很高兴啊！万岁是不可能了，那你来说说，我能活到多少岁啊？”
刘坤一听了慈禧太后的话，立时张口结舌，无言以对。他心想，无论说多说少，都不合适。说多了是欺君之罪，说少了是咒慈禧短命，都会招来杀头之罪。正在他左右为难的时候，有一小孩从身后很敏捷地递给他一张纸条，他一看如获至宝，迅速呈上。
慈禧接过纸条一看，原来是“天地同庚”四个大字，便喜笑颜开，大大奖赏了刘坤一。这个小孩正是李远安，是刘坤一的侍童，小小年纪就写的一手好字。后来刘坤一回到江南，既是感念李远安的机灵，也是为了恭维慈禧太后，便命人将这四字刻于慈寿塔下。
日军小队长望着巍峨的高塔，心中一阵慨叹。日本虽然近年来国力突飞猛进，但钱都花在了军队和工业上，文化和底蕴与中国相比还是相差太远。感慨了一会儿，小队长刚要带人进去搜查，住持匆匆赶来了。
住持气喘吁吁的说：“施主，这塔搜不得啊！塔中供着两颗千年舍利子，乃是佛家重宝，施主万万不可冒犯啊！再说这座塔只有一个门，藏身其中如同瓮中之鳖，就算你们要搜的人真在寺中，也不可能蠢笨到如此地步吧。”
小队长摇了摇头说：“大师，这塔我们是一定要搜的！不过，你滴放心，我们是不会冒犯舍利子的。”说完，他命令两名士兵守住门口，亲自带人入塔搜查。人为刀俎我为鱼肉，住持也无可奈何，只好回大雄宝殿继续念经去了。
