刘秀到河内，而鲍永探知更始帝已亡，便发丧志哀，释放使者，遣散将士、宾客，独自奉诏也来到河内。
刘秀见到鲍永，问他：“闻卿拥有重兵，何故只见卿一人？”鲍永闻言，当即叩首回道：“臣侍更始，不能保全主公，已属惭愧。若今再率众幸富贵，更觉愧疚，故而已悉数罢去。”
刘秀一听，当下便沉下脸，沉声而道：“卿言未免自大。”言罢，拂袖而去，却并没有为难鲍永，一切皆妥善安排。当时，其实有人建议刘秀处斩了鲍永，然而刘秀虽妻鲍永所为，但却不昏聩，鲍永虽直，却罪不致死。后来，这事被鲍永知道了，鲍永多刘秀感激之余亦心存敬意，由此心服刘秀。
刘秀派将士攻打怀邑，怀邑的守吏是更始的亲将，负隅顽抗，刘秀的将士屡攻不下。正犯愁时，刘秀想起了鲍永，便召其前来，对他说：“朕攻怀三日而兵不下。关东畏服卿。卿可否以故人之情请往，说其归附？”鲍永接受了，刘秀遂拜鲍永为谏议大夫，前往怀邑。
鲍永不负刘秀所托，说服了关东河内太守开城来降。刘秀为此很是高兴，要赐予鲍永洛阳商里宅但是遭到了鲍永固辞不受，刘秀知其性，便没有勉强。于是设佳肴，与鲍永对食，以示敬重。
二年(公元26年)春正月初一，日蚀。大司马吴汉率九位将军在邺东进攻檀乡寇贼，大败檀乡贼军，迫使他们投降。十七日，刘秀把功臣都分封为列侯，大的封国四县，其余多少不一。诏令说：“人之欲满后，最恐放荡不羁，只求一时之快，忘却慎于刑罚之道。念及诸位将军功业远大，若确想代代相传，应如临深潭边、于薄冰上行走那般，战战兢兢，每日更谨。有显绩，尚未得酬，名未扬、官未封之人，大鸿胪需速报，朕将分别录用。”
博士丁恭对此提议说“：古之帝王封诸侯地不过百里，以‘利建侯’、‘雷震百里’为准则，中强大，地弱小，此乃用以治国之方。今封诸侯大至四县，不合法制。”
刘秀却说：“前朝灭亡，皆由于国君无道，尚未听过功臣封地大而遭灭亡者。”于是派谒者马上授予列侯印绶，策书上说：“在上而不骄，虽高亦不危；节制谨守法度，虽满亦不漫。敬肃戒慎，传予尔等子孙后代，永为汉家之藩属。”
十九日，更始复汉将军邓晔、辅汉将军于匡投降，刘秀都恢复了他们原来的爵位。壬子，修高帝庙堂，建社稷坛于洛陽，立郊兆坛于城南，开始明确汉主火德，崇尚赤色。
同月，赤眉烧长安宫室，挖掘帝王园陵，寇掠关中。大司徒邓禹进长安，派府掾捧着十一帝的神主，供于高庙。随着高庙、稷祠的建起，立后也提上了议程。刘秀以阴丽华“雅性宽仁，有母仪之美“，希望能够立原配阴丽华为后。其实，一开始，刘秀就有心立阴丽华为后，只是不能操之过急，但他自有为之谋划，在阴丽华与郭圣通同封为贵人之时，刘秀又更封阴丽华其兄阴识为阴乡侯，使阴丽华的娘家在建武政权的爵位高于郭圣通娘家。
然而，跟随刘秀建功立业的大多是来自河北，他们向来只是知道郭圣通的存在，并且这一年多以来，郭圣通所为深得人心，加上郭圣通又诞下了皇子，于皇室有功，他们自是认同郭圣通，希望立郭圣通为后，而只有少数人支持阴丽华的。
就在立后成为热题的时候，前有彭宠不满，隗嚣怀异心，今又得知真定王刘扬、临邑侯刘让不甘而起了谋反之意。外忧未除，再起内乱，东汉的政权就会飘摇欲坠，真让刘秀忧心不已。
刘秀为了避免内部起祸端，便决计让它消灭在萌芽中，为此遣出前将军耿纯持节行赦令，出巡幽州、翼州两地，以劳慰王侯为名，实则让耿纯查实刘扬谋反之事，斩杀刘扬。
耿纯带着吏士百骑，与陈副、邓隆相会，一起到新定，留宿于驿舍，奉命暗中查实了刘扬谋反之图，正要谋划如何收捕刘扬时，刘扬便送上门来。
刘扬猜到耿纯此行许是为他而来，然而因为耿纯的母亲出自真定刘氏宗族，他便自以为耿纯不敢为难于他，根本就没把耿纯放在眼里，遣出使者送书给耿纯，约定王府见面。
耿纯答复使者说：“奉帝命拜见王侯牧守，不得擅自先行。如要会面，只宜在驿舍。”
刘扬听了使者的复述，决意前往驿舍见耿纯，他想着自己的弟弟刘让及从兄六细，各拥兵马以万计，何惧驿舍人数寥寥的耿纯。于是，刘扬自持众强，遂带兄弟二人以及王府官属，昂然前往驿舍，拜见耿纯。
耿纯出舍相迎，延请入内，礼节周到恭敬。刘扬兄弟为此认为耿纯这是惧怕自己，戒备之意顿时消去，留下轻兵将士在外面，自己则随耿纯进去。
驿舍里，耿纯与刘扬兄弟几人谈笑风生，然而，待几重门关闭后，耿纯幡然变色，立即下令将刘扬兄弟几人逮捕，后当众数其谋反罪，当场斩杀，举首示众。真定闻此莫不震恐，无人敢动。
刘秀见刘扬、刘让谋反并未酿成大祸，念其征讨王郎有功，便封其子刘德为真定王，使他承宗祀。罪不及妻孥宗族，为政柔和，真定的人心从此开始渐渐地得以归服。
耿纯还报朝廷，经此番事宜，他向刘秀请命说：“臣本吏家子孙，幸得大汉复兴，圣帝受命，备位列将，爵为通侯。天下略定，臣无所用志，愿试治一郡，尽力自效。”
刘秀闻言，大笑道：“卿既治武，复欲修文么？这正是朕心中所想，只可叹天下未定。”遂拜耿纯为东郡太守。
东郡靠近帝都洛阳，境内未平。耿纯到任治理数月，盗贼俱伏罪，政通人和，当然，此乃后话。
