连横曰：台湾为荒服之地，中古未入版图。草衣木食之民，自生自养，老死不相往来，固不知所谓政治也。及隋、唐之际，避遯之民，群聚澎湖，推年大者为长，畋渔为业，牧羊山谷间，各赡其食，毋相凭陵，故无讼狱之事，又不需所谓政治也。蒙古倔起，威震南邦，澎湖亦为所略。至元中，设巡检司，隶同安。澎湖之置吏始于此。然是时居人不及二千，且僻远不易治，寻废其官，而元亦遁归蒙古。明初，天下未平，无业之民，相为啸聚，侵掠闽、粤。洪武五年，信国公汤和经略海上，而墟其地。自是澎湖遂为海寇巢窟。嘉靖四十二年，都督俞大猷讨林道干，留师驻防，仍设巡检司；已复裁之，而澎湖遂为荷兰所略。荷人既据澎湖，复入台湾，筑城戍兵，布教抚番，设知事以治之，隶爪哇总督之下。西班牙亦据淡水，垦土殖民，以相抗衡。而台湾遂为二国所分矣。当是时，延平郡王奋起金、厦，经略中原，以光复旧业。金陵败后，穷蹙两岛，乃议取台湾。一鼓而下，荷人降伏，送之归国，而台湾复始为我族有也。夫台湾固我族开辟之土，延平既至，析疆行政，抚育元元，而我颠沛流离之民，乃得凭借威灵，安生乐业，此天之默相黄冑，而故留此海外乾坤，以存明朔也。
初，延平开府思明，军国大事，一日万几。分所部为七十二镇，令六官理国务，一时人才荟萃，庶绩咸熙。凡所便宜封拜，辄朝服北向，望永历帝座疏而焚之。克台之岁，改台湾为东都，置承天府，以杨朝栋为府尹，祝敬为天兴知县，庄之列为万年知县，设安抚司于澎湖。是为地方之制。又以周全斌总督承天府南北诸路，任官抚番，分管社事。纲纪振饬，制度修明，泱泱乎大国之风也。延平立法严，而爱民如子，劝之以忠，励之以勇，使之以义，绥之以和。闽、粤之民，闻风而至，拓地远及两鄙。台湾之人，以是大集。永历十六年，子经立。十八年，以咨议参军陈永华为勇卫，军国大事悉任之。永华为政儒雅，与民休息。改东都为东宁，天兴、万年为二州。二十年，圣庙成。三月，以永华为学院，弃亨为国子助教，教之、养之。台人自是始兴学。三十四年，永华卒。翌年，经薨，克塽幼，不能治国，以至于亡。
康熙二十二年，清人得台湾，议弃其地。靖海将军施琅疏陈不可，乃设府一、县三，隶福建。六十年，以朱一贵之变，特命巡视台湾满汉御史各一员，监察行政。时漳浦蓝鼎元从军在台，以北路地方辽阔，治理失宜，议于半线增建一县，其言甚切。雍正元年，乃划虎尾溪以北，设彰化县及淡防同知，领地至蛤仔难，而垦者亦日至焉。当是时，土地初辟，横绝大海，往来多险，仕宦惮之。康熙三十年，诏曰：『台湾各官，自道员以下，教职以上，俱照广西南宁等府之例，将品级相当现任官员内，拣选调补，三年俸满即升。如无品级相当堪调之员，仍归部选。着为令』。雍正七年，议准台湾道、府、同知、通判、知县到任二年，令该督抚于闽省内地拣选贤能之员，乘北风之时，令其到台，与旧员协办。半年之后，令旧员乘夏月南风之便，回至内地补用。政绩优著者准加级，称职者准加一级，以示鼓励。十二年，总督郝玉麟奏准，调台官员，年逾四十无子，准其挈眷赴任。
夫台湾既为海疆重地，而官吏俸禄甚轻。旧制：分巡道年六十二两四分四厘，知府同禄，台防同知四十二两五钱五分六厘，知县二十七两四钱九分，县丞二十四两三钱二厘，巡检十九两五钱二分，实不足以资衣食。乾隆八年，奉旨增加养廉。于是分巡道一千六百两，知府同禄，台防同知五百两，台湾知县一千两，他县八百两，县丞、巡检各四十两。然贪婪之吏，以宦为贾，舞弄文墨，剥民肌膏。三年报罢，满载而归。而台湾府、县之缺，遂为巧佞所争矣。
嘉庆十五年，设噶玛兰厅，自是颇多增置，而人民亦有二百数十万，盖已拓地至台东矣。牡丹之役既平，同治十三年十一月，钦差大臣沈葆桢奏请移福建巡抚于台湾，略曰：『台湾洋务稍松，即善后不容稍缓。唯此次之善后，与往时不同。台湾之所谓善后者，即台湾之所谓创始也。顾善后难，以创始为善后则尤难。臣等曩为海防孔亟，一面抚番，一面开路，以绝彼族觊觎之心，以消目前肘腋之患，固未遑为经久之谋。数月以来，南北诸路，缒幽凿险，斩棘披荆，虽各着成效，卑南、奇莱各处，虽分列军屯，祗有端倪，尚无纲纪。若不悉心筹划，详定规模，路非不已开也，谓一开之不复塞则不敢知，番非不已抚也，谓一抚之不复疑则不敢必。何也？台地廷袤千百余里，官吏所治祗海滨平原三分之一，余皆番社尔。国家养育番黎，但令薄输土贡，永禁侵凌，意至厚也。而奸民积匪，久已越界潜踪，驱番占地，而成巢窟；则有官未开而民先开者。入山既深，人迹罕到，野番穴处，涵育孳生；则有番已开而民未开者。迭谳外包，平埔中扩，鹿豕游窜，草木蒙茸，地广番稀，弃而弗处；则有民未开而番亦未开者。是但言开山，而山之不同已若此。生番种类数十，大概有三：牡丹等社恃其悍暴，劫杀为生，愍不畏死，若是曰凶番；卑南埔裹一带，居近汉民，略通人性，若是者曰良番；台北斗史等社，雕题鲸面，向不外通，屯聚无常，种落难悉，猎人如兽，虽社番亦惧之，若是者曰王字番。是但言抚番，而番之不同又若此。夫欲开山而不先抚番，则开山无从下手。欲抚番而不先开山，则抚番仍属空谈。今欲开山，则曰屯兵卫，曰刊林木，曰焚草莱，曰通水道，曰定壤则、曰招垦户，曰给牛种，曰立村堡，曰设隘碉，曰致工商，曰设官吏，曰建城郭，曰置邮驿，曰建廨署。此数者孰非开山之后必须递设者？今欲抚番，则曰设土目，曰查番户，曰定番业，曰通语言，曰禁仇杀，曰教耕稼，曰修道涂，曰给茶盐，曰易冠服，曰设番学，曰变风俗。此数者又孰非抚番之时必须并行者？虽然，此第言后山，其繁重已若此。前山之入版图也，百有余年，一切规制，何尝具备？就目前之积弊而论，班兵之惰窳也，蠹吏之盘踞也，土匪之横恣也，民俗之蹈淫也，海防陆守之俱虚也，械斗扎厝之迭见也；学术之不明，庠序以容豪猾；禁令之不守，烟赌以为饔飧。官斯土也，非无振作有为正已率属之员，始苦于事权之牵制，继苦于毁誉之混淆，救过不遑，计功何自？使不力加整顿，一洗浮浇，但以目下山前之规模，推而为山后之风气，虽多一新辟之区，适多一藏奸之薮。臣等窃以为未可也。尝综前后山之幅员计之，可建郡者三，可建县者十，固非一府所能辖。欲别建一省，又苦器局之未成。而闽省向需台米接济，台饷向由省城转输，彼此相依，不能离而为二。环海口岸，处处宜防，洋族教堂，渐渐分布。居民向有漳籍、泉籍、粤籍之分，番族又有生番、熟番、屯番之异。气类既殊，抚驭匪易。况以创始之事，为善后之谋，徒静镇之非宜，欲循例而无自。使臣持节，可暂而不可常。欲责效于崇朝，兵民有五日京兆之见。倘逾时而久驻，文武有两姑为妇之难。臣等再四思维，宜仿江苏巡抚分驻苏州之例，移福建巡抚驻台，而后一举而数善备。何以言之？重洋还隔，文报稽迟，率意径行，又嫌专擅。驻巡抚则有事可以立断，其便一。镇治兵，道治民，本两相辅，转两相妨。职分不相统摄，意见不免参差。上各有所疑，下各有所恃，不贤者以为推卸地步，其贤者亦时时存形迹于其间。驻巡抚则统属文武，权归一尊，镇道不敢不各修其职，其便二。镇道有节制文武之责，而无遴选武文之权。文官之贪廉，武弁之勇怯，督抚所闻，与镇道所见，时或互异。驻台则不待采访，而耳目能周，黜陟可以立定，其便三。城社之巨奸，民间之冤抑，睹闻亲切，法令昜行，公道速伸，人心帖服，其便四。台民烟瘾本多，台兵为甚；海疆官制久坏，台兵为尤。良以弁兵由督、抚、提标抽取而来，各有恃其本帅之心。镇将设法羁縻，祗求其不生意外之事。是以比户窝赌，如贾之于市，农之于田。有巡抚则考察无所瞻循，训练乃有实际，其便五。福建地瘠民贫，州县率多亏累，恒视台地为调济之区。不肖者骫法取盈，往往不免。有巡抚以临之，贪黩之风，得以渐戢，其便六。向来台员不得志于镇道，及其内渡，每造蜚语中伤之，镇道或时为所挟。有巡抚则此技悉穷，其便七。台民游惰可恶，而戆直实可怜。所以常闻蠢动者，始由官以吏役为爪牙，吏役以人民为鱼肉，继则人民以官吏为仇雠，词讼不清，而械斗扎厝之端起。奸宄得志，而竖旗聚众之势成。有巡抚则能豫拔乱本而塞祸源，其便八。况开山伊始，地势殊异，成法难拘，可以因心裁酌，其便九。新建郡邑，骤立营堡，无地不需人才，丞倅将领，可以随时札调，其便十。设官分邑，有宜远久者，有属权宜者，随时增革，不至廪食之虚縻，其便十有一。开煤炼铁，有第资民力者，有宜参用洋机者，就近察勘，可以择地而兴利，其便十有二。夫以台地向称饶沃，久为他族所垂涎。今虽外患暂平，旁人仍耽耽相视，未雨绸缪之计，正在斯时。而山前山后，其当变革者，其当创建者，非数十年不能成功。而化番为民，尤当渐积优柔，不能浑然无间。与其苟且仓皇，徒滋流弊，不如先得一主持大局者，事事得以纲举目张，为我国家亿万年之计。况年来洋务日密，偏重东南；而台湾孤悬海外，七省以为门户、关系非轻。欲固地险，在得民心；欲得民心，先修吏治营制。而整理吏治营制之权，操于督抚。总督兼辖浙江，移驻不如巡抚之便。臣等明知地属封疆，事关更制，非部民属吏所应越陈；而夙夜深思，为台民计，为闽省计，为沿海筹防计，有不得不出于此者。敢不据实上闻，以为蒭荛之献』。旨下福建督抚议奏。总督李鹤年、巡抚王凯泰奏言：『福、台关联甚巨，彼此相依，未可遽分为二。请以福建巡抚冬春驻台，夏秋驻省』。诏可。于是葆桢奏建台北府，改淡防厅为新竹，噶玛兰厅为宜兰，新设恒春、淡水两县，置台东、基隆两厅，而移北路抚民理番同知于埔里社，改为中路。大事更张，以革新吏治。营制亦稍整饬，而台湾之规模渐大矣。
光绪二年六月，江南道御史林拱枢奏言：『琅囗〈王乔〉之役，沈葆桢暂任其事，议移巡抚驻扎台湾，俾善其后。以现在情形而论，区处台湾，非善后之谋，实创始之事』。十二月，刑部左侍郎袁葆恒亦奏言：『台湾之地，虽僻海滨，而物产丰富，各国垂涎。倘为外人盘踞，则南北洋各处，出没窥伺，防不胜防。加以民番杂处，区画尤难，非专驻大臣，镇以重兵，举其地之民风、吏治、营制、乡团，事事实力整顿，洽以德意，孚以威信，未易为功。查直隶、四川、甘肃各省，皆以总督兼办巡抚。可否改福建巡抚为台湾巡抚，常川驻守，经理全台。其福建全省事宜，专归总督办理。事任各有攸司，责成即有所属，似于台湾目前情形，不无裨益』。而巡抚丁日昌亦以分驻两地，往来不便，奏请简驻重臣，督办数年，而后建省。部议不可。
七年春，巡抚岑毓英巡视台湾。以台湾孤悬海外，幅员辽阔，筹备防务，必须南北声气相通，方易措手。查彰化县治居南北之中，应将台湾道、府二缺，权其轻重难易，移一于此，俾可居中控制。兵备道刘璈以彰化之下桥仔头庄可为都会之地，议移道缺；而以埔裹社之中路同知为台湾直隶州，与巡道北路副将均移于此。划大肚、八卦两山之地，归州管辖。移彰化县于鹿港，改为州属，而猫雾捒巡检为州吏目，南投县丞为州判，驻埔裹社。分凤山县学官一员为州学正。改台湾府为台南府，专辖台、凤、嘉、恒四县，以与台北对立。毓英以为可。将入奏，会越南事起，视师广东，台湾亦戒严，诏以直隶陆路提督刘铭传驻台治军。及平，以铭传为福建巡抚。十一年五月，奏请专驻台湾，办理要政，又陈设防、练兵、清赋、抚番四事。七月，钦差大臣左宗棠奏言：『今日之事势，以海防为要图；而闽省之筹防，以台湾为重地。台虽设有镇、道，一切政事，必禀承督，洋悬隔，文报往来，平时且不免稽迟，有事则更虞梗塞。如前次法人之变，海道不通，诸多阻碍，其已事也。臣查同、光之交，前办理台防大臣沈葆桢躬历全台，深维利害，曾有移驻巡抚十二便之疏，比经吏部议准在案。嗣与督臣李鹤年、巡抚王凯泰仍以巡抚兼顾两地覆奏。光绪二年，侍郎袁葆恒请将福建巡抚改为台湾巡抚，其福建全省事宜，专归总督办理。部议以沈葆桢原奏，台湾别建一省，苦于器局未成，彼此相依，不能离而为二，未克奉旨允行。厥后抚臣丁日昌以冬春驻台、夏秋驻省，往来不便，因有专简重臣督办数年之请。臣合观前后奏折，督抚大臣谋虑虽周，未免各存意见。盖王凯泰因该地瘴疠时行，心怀畏却，故沈葆桢循其意而改为分驻之议。丁日昌所请重臣督办，亦非久远之图。皆不如袁葆恒事外旁观，识议较为切当。夫台湾虽系岛屿，绵亘亦一千余里。旧制设官之地，祗海滨三分之一。每年物产关税，较之广西、贵州等省，有盈无绌。倘抚番之政，果能切实推行，自然之利，不为因循废弃，居然海外一大都会也。且以形势言，孤峙大洋，为七省门户，关系全局，甚非浅鲜。其中如讲求军备、整顿吏治、培养风气、疏浚利源，在在均关紧要，非有重臣以专驻之，则办理必有棘手。以臣愚见，惟有如袁葆恒所请，将福建巡抚改为台湾巡抚，所有台、澎一切应办事宜概归该抚经理，庶事有专责，于台防善后大有裨益。至该地产米甚富，内地本属相需。若协济饷项，各省尚通有无，亦万无不为筹解之理。委用官员，请照江苏成例。各官到闽之后，量缺多少，签分发往。学政事宜，并归巡抚兼管。勘转命案，即归台湾道就近办理。其余一切建置分隶各部之政，从前巳有成议，毋庸更张。专候谕旨定案，即饬次第举行』。当是时，内外臣工条陈台湾善后者几十数起。而贵州按察使司李元度亦请以福建巡抚专驻台湾，兼理学政。且言「军中所需军火炮械，均须在台设局，制造存储，不得如前仰给福建，致有隔绝之患。夫日本距台甚迩，日本疆圉略如台湾，而历朝以来，倔强自立，近且并琉球、乱朝鲜，改从西洋制度，俨然自居于列强之间。夫日本之财力，皆取之国中，非别有转输也，而游刃有余，可以富庶。台湾地大物博，百利未兴，若能经理得人，需以岁月，何遽不如日本哉？夫强弱无异民，不善用之则弱，能善用之则强。应请简任巡抚、镇道，久任而责成之，辟土地，课农桑，征赋税，修武备，则七省之藩篱永固，而台湾可无害矣』。旨下军机大臣、总理各国事务王大臣、六部、九卿会同各省督抚议奏。九月初五日，军机大臣臣醇亲王奕譞、总理各国事务大臣臣******奕劻、大学士臣世铎、臣额抑和布、臣阎敬铭、臣张之万、北洋通商大臣臣李鸿章等奏言：『臣等查台湾为南洋枢要，延袤千余里，民物繁富。通商以后，今昔情形迥然不同，宜有大员驻扎控制。若以福建巡抚改为台湾巡抚，以专责成，似属相宜。恭候钦定。如蒙俞允，所有一切事宜，应由该督抚详细酌议，奏明办理』。诏曰可。于是设台湾巡抚，建省会于下桥仔头庄，以控制南北。设台湾府，领县四，附郭曰台湾，新设云林、苗栗二县，改台湾府为台南府，台湾县为安平县，升台东厅为直隶州。凡三府、一州、三厅、十一县。以铭传为巡抚。廷议以台湾南北袤延甚远，拟设台北道以分管理，铭传奏复添设台北道，不如添设藩司。诏曰可。于是以沈应奎为台湾布政使。而兵备道仍兼按察使。又以澎湖为闽、台门户，非设重镇，不足以资控制，诏以澎湖副将与海坛镇对调，台湾镇总兵销去「挂印」二字，均归巡抚节制。十二年，设督办台湾抚垦大臣，以在籍太仆寺正卿林维源为帮办，兼团练大臣。铭传具干才，大兴新政，筑铁路，通航运，办清赋，辟山林，建学堂，讨军实，开矿产，振工商，计日度月，次第举行，将置台湾于富强之域。而士夫不谂其意，政府亦多掣肘，遂称病以去。继之者邵友濂，文吏也，诸皆废止。二十一年，日本据辽东，诏割台湾以和，下旨撤回官吏。五月，台人自立为民主国，举前巡抚唐景崧为大总统，以李秉瑞为军务大臣，俞明震为内务大臣，陈季同为外务大臣，姚文栋为游说使，余如旧。而府县多缄印去。已而大总统亦逃，遂至于亡。
