明智军陷入了苦战，军心开始浮动，见此情景，光秀赶忙派部队强攻天王山，希望能以此鼓舞士气，然而，吉继在天王山山顶据险设防，再加上羽柴军源源不断的增援，明智军好几拨的强攻都被打退。
“看来，我军败局已定了。”光秀绝望地说。
很快，明智军全线溃败，死伤不计其数，光秀引败兵700余人退守山城国胜龙寺城。
秀吉当然不会给光秀一丝一毫喘息的机会，下令全军继续追击，顺势攻打胜龙寺城。
孝高献计：“主公，不才以为，明智军此时已穷途末路，我军四面围城，敌军退无可退，必定死战到底。不如全力攻打东西南三面，专门留出北面城门，让他们从这里逃走，这样明智军的士气与战心就彻底瓦解了。”
秀吉采用了孝高的计谋。果然，明智军士气一下子涣散了，败兵们丢盔弃甲，纷纷从北门逃出城去，光秀哪里喝止得住。
见胜龙寺城朝不保夕，为图东山再起，光秀趁着夜色率五，六个随从化妆后逃离胜龙寺城，往原居城坂本城撤离。
第二天一早，羽柴军攻下了胜龙寺城。秀吉首先便问光秀下落。
“主公，全城都搜遍了，没有找到光秀，据俘虏交代，他早就已经逃出城了。”行长道。
“那还不赶快去追，留着等他将来反攻吗？”
“主公，交给我吧。”清正主动请缨。
“好，活要见人死要见尸。”
“不，还是让属下去吧，主公。”
“你抢老子的功吗？哼，真是狗改不了吃屎！出身商家就是骨子里喜欢算计。”
“你说什么！”行长大怒，拔剑就要和清正火并。
秀吉喝到：“住手，你们想干什么！想造反吗？弥九郎，快去出榜安民。”
“可是，主公……”
“退下！”
行长诺诺而退，清正正待开口，秀吉又喝道：“杵在这儿等死吗，还不赶快去找！”
“是，是。”
另一边，逃出城的光秀经过伏见山小粟栖。
“唉，我明智十兵卫光秀纵横半生，没想到到头居然来输给了那只猴子。”
“留着青山在不怕没柴烧，请主公宽心。”一个侍从道。
这时，前面一群土民撞见，见光秀等人是一群落魄的武士，土民们拿起镰刀锄头攻击他们，趁火打劫。
“干什么！你们这帮刁民！”光秀喝道。
由于疲惫不堪，光秀身边的侍从一个个都被土民打死了，光秀也身受重伤，最终力战而亡，抢光他们身上值钱物事后，土民们一哄而散。
光秀临终前，心有不甘地说：“我……居然死在这种鬼地方，为什么就不能给我一次东山再起的机会呢！”
不久，清正率兵追至，发现了光秀的尸体，于是割下光秀的首级，将光秀的日本刀一并带回去给秀吉检视。秀吉得报大喜，重赏了清正。
虽然光秀孤注一掷发动了兵变，但是最终还是为此付出了惨重的代价。从“本能寺之变”到天王山战败，光秀掌权天下的时间很短暂，被后人称为“三日天下”。自此，明智家势力彻底败亡，秀吉顺利地替信长报了仇，在织田家有了举足轻重的地位，也正式开始他的称霸天下之路。
