1947年1月23日，梅加瓦蒂在一个风雨交加的夜晚呱呱坠地，成为印尼建国之父——苏加诺的长女。苏加诺在给爱女取名时也许已经预感到自己的女儿日后将大有作为，便给她取名梅梅加瓦蒂像加瓦蒂。“梅加”在印尼文中是“云彩”或“巨大”的意思，“瓦蒂”则是“女子”的意思。这个名字正好应和了中国的一句古语：“云起龙骧，化为侯王”。梅加瓦蒂两岁时被带进雅加达的总统宫殿里，从那时起在总统宫殿里开始了她的童年和少年岁月，享尽第一家庭的荣华富贵。梅加瓦蒂是在父亲的熏陶下长大的，在她的记忆里，当年父亲执政时，在会见要员结束后，他都会向自己介绍刚才与客人谈论的话题；国内外发生了值得关注的事情时，苏加诺也会向女儿交代事情的来龙去脉。这时候，父亲从不把梅加瓦蒂看作一个孩子。总统府的生活环境不断向梅加瓦蒂脑海里灌输着政治理念。在总统府度过了难忘的童年和青年时光。1954年至1963年，她在雅加达读小学和中学。1965年至1967年在西爪哇万隆的一所大学读农业专业。然而1965年10月，17岁的梅加瓦蒂遭遇了生活的重大变故。
以苏哈托为首的印尼陆军“将领委员会”发动颠覆苏加诺政府的政变。尚未成人的梅加瓦蒂经历了苏加诺的随从遭到手榴弹袭击等恐怖事件，更加亲眼目睹了自己的父亲被苏哈托强逼下台、直至在软禁中抑郁离开人世的惨剧。梅加瓦蒂不得不辍学在家照顾病弱的父亲。1970年苏加诺死于肾病，梅加瓦蒂于同年进入雅加达的印尼大学攻读心理学，但没有完成学业。从此，在苏哈托的高压打击下，梅加瓦蒂和她的7个兄弟姐妹的生活马上发生了翻天覆地的变化，他们成了社会上“不可接触的贱民”。这些悲惨而震撼心灵的遭遇并没有把梅加瓦蒂压垮，相反，她在磨难中迅速成长。这使得她在日后的政治斗争中变得无比坚强，最终成为影响印尼政坛的一位重要人物。苏加诺家的保姆芝特罗回忆说，梅加瓦蒂小时候就不爱说话，老是微笑、表现出慈母般的温柔。但是，了解梅加瓦蒂的人都知道，在这样一个慈善可亲的外表下，隐藏着一颗坚强果敢的心。她的原则性很强，有时甚至到了固执的地步。她一直致力于在1945年宪法的基础上实现民主。梅加瓦蒂的态度遭到那些不愿严格按照宪法办事的人的反对，但却得到了老百姓的支持。当时有人就把梅加瓦蒂形容成印尼民主党中“沉默的狮子”，具有冲破任何困难险阻的能力。
