当美利坚合众国与法兰西共和国完成路易斯安那的交接后，密西西比河流域和密苏里河流域，差不多都是美国的领土，其实，殖民和探险是相辅相成的，美国在此之前就开始偷偷地在密西比河及密苏里河进行探险，由此可见，美国对密西西比河以西广大地区的野心。
在交接完后，美国就开始进行布置，向西探险，现在，在这一地区进行探险不再涉及外交问题。在1803年7初，美国在杰斐逊总统的主持下，组成了一支由刘易斯和克拉克组成的探险队，由25名士兵、考察人员、翻译、印第安人向导共51我组成，随即开赴伊利诺伊殖民地，密西西比河沿岸的一个城市路易斯，进行细致的准备工作，并在那里度过了冬天。
其实，早在1801年，美国杰斐逊当选为总统后，就开始物色人选，他邀请了一个叫刘易斯的年青人担任他的秘书，这是一个对美国探险进入太平洋沿岸的重人物。刘易斯曾在杰斐逊家里就读过一年，杰斐逊对他颇为赏识。刘易斯参过军，曾在肯塔基和西弗吉利亚同印第安人作过战，了解边疆的情况，在1800年底就获得上尉军衔。在刘易斯给杰斐逊总统当秘书的时候，两人了解更加深入。杰斐逊总统非常欣赏是易斯的勇气和好学，并且有意识的引导他去学习同探险有关的自然科学。
在1802年，杰斐逊和刘易斯就阅读过加拿大人亚历山大&麦肯齐关于发现太平洋的一本书。在书中亚历山大&麦肯齐记载了他为西北公司寻找从蒙特利尔到太平洋沿岸通道的经历。加拿大的地形，山脉和河流的分布同美国北部颇为相似。麦肯齐的记载对美国在密西西比河及密苏里河这一地区的探险是很有用处的，在杰斐逊总统派门罗去法国就开始着手准备，从这看出，美国对密西西比河以西地区的野心，并就西部探险的准备工作，作了更为具体的阶段性的准备。刘易斯在此间段不仅阅读了大量有关探险的资料，而且去了蒙特塞罗学习植物学方面的知识。后来杰斐逊还让刘易斯到费城，接受了几位著名学者的指导。1803年的初夏，刘易斯在当时美国杰出的专家。卡斯珀&威斯塔和本杰明&拉什等专家的帮助下，潜心攻读自然史。专家们还向他提供了一份向沿途可能遇见的印第安人和其他人进行调查的问题清单和搜集材料的方法。刘易斯还在杰斐逊的图书馆里和圣路易斯查阅了西班牙人绘制的地图，并找来了一位名叫约翰&埃文斯，和一位名叫詹姆斯&麦基的人，让他们帮助绘制了密苏里河流域图。刘易斯还购置了各种测绘仪器，准备绘制沿途的地形图。
而总统杰斐逊也为这次探险申请经费。早在1802年12月时，他就在总统咨文中就提出了从密西西比河到太平洋沿岸的探查预算。这笔费用在第二年的1月，便获得了参众两院的通过。随后杰斐逊正式任命28岁的刘易斯和32岁的克拉克担任探险队的正副队长。
杰斐逊总统向两人详细的说明了此次探险的具体任务。归纳起来大致有四个方面的内容，第一，沿密西西比河、密苏里河和哥伦比亚河找出一条“最能直通的和适用的穿越大陆的商用水路”；第二，通过天文观察来确定地理位置，以便绘制地区图；第三，了解沿途印第安部落的分部情况、人数、语言、服饰、居住条件、生活状况、生活习惯和部落间的关系；第四，了解沿途各地的气候、水土、地貌、动植物种类、矿产，并做出必要的记录。
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在美国进行紧锣密鼓的向西探险时，而被卡斯卡斯基亚人和美国印第安纳殖民地军的夹击下，失败的波托瓦托米人在战败后，酋长招集长老和一些没有受重伤和牺牲的军事小酋长们开了一个简短的会，就失败的情况和村庄可能会受到攻击的情况进行了商议。
在会上，长老们对卡斯卡斯基亚人勾结美国白人很气愤，可也很无赖，部落经过这一仗，损失很大，除了一些武器的损失，最主要的是部落的青壮人口的牺牲，让部落元气大伤，没有十几二十年的时间，部落别想恢以前的人口和实力，这还是要在和平的环境下才有的可能，可现在的情况，除了仇敌波插瓦米人会向部落攻击，还有实力雄厚的美国白人，另外还可能还有其它的一些部落会进行窥视。
在会上酋长说到：“这次冲突，没想到卡斯卡斯基亚人竟然联合白人攻击我们，我们这次损失太大，为了我们部落所有人的生存，我们要对今后的情部商量出个办法。”
一位长老带着一丝悲伤的语气说到：“这次的失败，我们损失了近三分之二的青壮人口，这让我们部落的老人、妇女和孩子们怎么办，这么多人的损失，保卫老人、妇女和孩子都难，我们部落的领地肯定要失去很多，现在美国白人又插入进来，可能我们领地能不能保住都是问题。”
另一位长老更是悲痛其眼含着落水，他的儿子一位军小酋长在这次的战斗中在突围后，掩部落战士转移时，被波瓦托米人打死。：“我们现在要作转移准备，要是波托瓦米人带着美国白人来，那我们部落就会有灭顶之灾，要让老人、妇女和孩子转移到安全的地方去。”
一位手上带着轻伤的军事小尊长带着失望的心情说到：“我们现在能去哪里，我们的领地一点都不安全。特别是白人对我们的领地虎视眈眈。”
“我们部落的人要想生存，还有一个，就是投靠别的部落。”一位长老说到。
“可我们能投靠谁，附近各个部落，各自的领地只能养活那么多人，我们部落投靠，其他部落也不会接收。”另一位军事小酋长丧气地说到。
“说到投靠，我倒想起一起战斗过的天鹰酋长，自从上次战争过后，他们搬到伊利湖沿岸，这些年，传来的一些消息，说他的部落在伊利湖畔是最强大的一支部落，还收留了不少小部落，我看去投靠他也不为是一个办法。”酋长想了想说到。
最后波托瓦托米人部落作出决，整个部落向北迁移，去投靠天鹰部落
