当吴全从宁远城赶到大凌河堡之后，吴三桂立即开始对破虏军的整编，将包括吴三辅带来的那五百家丁一起编入了破虏军中。
破虏军分为左翼熊罴营两千人，由吴双率领；右翼虎豹营两千人，由哈丹巴特尔率领；中军一千六百人由吴三桂亲自统带，下辖亲兵营和鹰扬营，其中五百家丁为亲兵，由吴全统带，鹰扬营一千一百人，由宋进计统带。
关于军职和军衔的问题，吴三桂暂时不想将前世的那一套什么士、尉、校、将、帅之类的东西拿过来用，因为这个东西虽然体系不错，但是在眼下这个世界却是完全生造，要让士兵们接受起来会非常困难，除非日后建立军校，从小培养军官，否则暂时不会使用这一套东西。
吴三桂觉得，其实就以明朝现在的把总、千总、守备、游击、参将、副将、副总兵和总兵来作为军职就可以了，至于军衔，就对照利用已经接近废弃边缘的卫所制军职就可以了，仍然以百户、千户、卫指挥使同知、卫指挥佥事、卫指挥使、都指挥使同知、都指挥使佥事和都指挥使来作为军衔，正好可以一一对应。
比如把总是军职，其军衔一般就是百户衔，千总是千户衔，守备是卫指挥使同知衔……总兵是都指挥使衔。
当然，这些东西现在还用不着，因为连他吴三桂自己也还只是一个小小游击将军，哪有资格去设计这些东西？但是他很有信心在未来的一两年的时间里，成为威震天下的一镇总兵，等到有资格开军镇、设幕府、称大帅的时候再去考虑这些就晚了。
完成整编之后，吴双、吴全和哈丹巴特尔就成为全职教官，一心一意的扑在对新兵的训练上。
吴双和吴全主要负责倭刀术和军阵的训练，军阵主要来源于戚继光的《纪效新书》。虽然吴三桂也曾经考虑过西班牙方阵，但是朝鲜的地形复杂多变，以丘陵为主，很少平原，大方阵恐怕施展不开手脚，还不如就用戚继光的鸳鸯阵之类的小方阵。
而哈丹巴特尔则主要负责箭术，不管怎么样，现在与建虏的骑兵作战的时候，弓箭仍然是利器。
虽然吴三桂也想装备火铳和鸟枪，但是他已经见识过明军的那些火铳和鸟枪了，威力实在太差，在马上作战的用途还不如弓箭。
吴三桂也不是没有想过将自己掌握的一些未来的先进技术用于制造更先进的火枪。但是，战争从冷兵器过渡到热兵器，绝非是可以一蹴而就的。
因为这光靠吴三桂有想法是没有用的，必须要有强大的科研队伍和生产能力才行，如今吴三桂的科研队伍和生产作坊就是赵亮他们那几个老家伙，他们充其量只是合格的工匠，吴三桂就是能将自己的理念和知识灌输给他们，也不可能造的出先进的火枪，况且有那工夫，还不如多花点心思在地雷的改进上。
所以，即使现在老赵他们真的能研制出成熟的火器，也绝不可能实现让破虏军完全装备。火枪要形成战斗力，器械的制造工艺达到一定水准，不能有太高的故障率，太容易炸膛的火枪就是战场上的灾难。
最重要的是，吴三桂如今还没有与火枪相辅助的的战术体系和大批适应该体系的中下级军官。
在吴三桂前世的历史上，热兵器时代早期的军事强国无一不是以冷兵器为主、热兵器为辅编成军队，比如西班牙的枪骑兵，一直到拿破仑时代，交战各国都还有相当数量的骑兵部队！哪怕是现代各国的军队，也还不能完全放弃部队中冷兵器的装备和实战的肉搏训练。
仅凭吴三桂自己一人之力，摇身一变，就拥有了完全近代化的军队，装备火枪、火炮，战争中一顿猛轰就解决战斗，这种想法实在是很幼稚，也很荒诞！吴三桂自认没有这样的可能性！
经历过与建虏的多次厮杀之后，吴三桂更是坚信，先进的武器并不是在战斗中取胜的唯一法宝，否则当年的解放军也不可能凭借手中的小米步枪打败拥有最新美式装备的****。
所以，用吴三桂的话来说，火枪火炮是一定要造的，但是现在还不具备这样的能力，只能留待以后，反正葡萄牙和西班牙的殖民者离的并不远！
然后就是军纪和军歌。
军纪方面，吴三桂自然不会想到什么西点军校的二十二条军规之类的东西，他能顺手拈来的就只有红色军团当年的三大纪律和八项注意了，只不过吴三桂给它改了一个名字叫做《破虏军军纪暂行条令》，内容自然也还是那几条，只不过有些地方换换名称罢了。
军歌除了那首“前进前进，让敌人的脏血灌溉我们的田地之外”，吴三桂还选择了一些前世听过的激昂斗志的红歌，甚至还有民国****的陆军军歌一起进行改编：
风云起，山河动，
破虏建军声势雄，
炎黄壮士矢精忠。
金戈铁马，百战沙场，
安内攘外作先锋。
纵横扫荡，复兴中华，
所向无敌，立大功。
旌旗耀，金鼓响，
龙腾虎跃军威壮，
忠诚精实风纪扬。
机动攻势，勇敢沉着，
奇袭主动智谋广。
肝胆相照，团结自强，
歼灭虏寇，凯歌唱。
这些歌曲一个人两个人唱起来还不觉得如何有气势，但是一旦是成千上万人一同合唱，那威势和带给人的震撼绝对不会比万马奔腾弱，吴三桂很期待有一天再和建虏对战的战场上，那些骤然听到这样气势磅礴的军歌时，建虏的士气会受到怎样的冲击。
眼下吴三桂手中的这支破虏军虽然还远远称不上是一支现代化的军队，但是至少已经有了现代化军队的模型，照着这个模式发展下去，相信有一天，这绝对是一支无敌天下的铁军。吴三桂对此充满了信心。
就在吴三桂一心一意的训练手中新军的时候，朝廷方面快马送出的嘉奖终于到大凌河堡了。
