战至午夜，阿奴所率的三万名叛军步兵至少已死伤过半。而索额图、明珠和费扬古等人也早歼灭了叛军骑兵，开始与康熙、萨布素一起，合围阿奴。到次日黎明，除数千叛军投降外，其余叛军全部被清军所歼。
昭莫多一役，虽然噶尔丹逃跑了，但是他的妻子阵亡，叛军主力基本上被清军歼灭。噶尔丹便再也没有力量举兵东犯或南犯了。
策妄阿拉布坦听说噶尔丹在昭莫多惨败后，马上就派人赴京城向清廷表示归顺之意，还将噶尔丹和阿奴的女儿钟齐海也押往京城，表明他与噶尔丹彻底决裂的立场。这样，噶尔丹最后的退路便被策妄阿拉布坦彻底地断了。
噶尔丹不能再回伊犁，万般无奈之下，噶尔丹只好把最后的希望寄托在沙俄政府身上，乞求沙俄政府的庇护。令噶尔丹大失所望的是，沙俄政府根本就不愿庇护他，甚至拒绝他进入俄罗斯境内。
既不能去伊犁，又不能去沙俄，噶尔丹只能带着残兵败将流窜于塔米尔河一带，成了一股名副其实的流匪、流寇。噶尔丹就像一条丧家之犬，带着他的残部，整年累月地在塔米尔河一带流窜，苟延残喘。
然而，在康熙的心目中，噶尔丹大逆不道，绝不能姑息。现在，策妄阿拉布坦已经正式归顺朝廷，沙俄政府见噶尔丹已无利用价值明确表示放弃，噶尔丹因为平日树敌太多、无路可走，只能流窜于塔米尔河流域。此是彻底剿灭噶尔丹叛匪的最佳时机，康熙决定，第三次亲征平叛。
公元1697年春天，康熙带着索额图、明珠并三万精锐清军，浩浩荡荡地开到了宁夏。然后，康熙领一万人驻扎在宁夏，而派索额图和明珠各率一万精兵向北，从东西两侧夹击噶尔丹残匪。以当时噶尔丹的力量，康熙带来如此大军，也真的有些杀鸡用牛刀的意味了。
康熙还下令，谁能取得噶尔丹的首级，就会重重有赏，这让索额图和明珠惦记在心，都想着要立下这头等功。
客观地讲，清军在塔米尔河流域并没有遇到过什么抵抗。噶尔丹身边本来是有四五千人，可闻知清军要来进剿，大部作鸟兽散，待清军开始从东西两路对塔米尔河流域进行扫荡时，噶尔丹的身边，只剩下数百名死心塌地的亲兵了。清军在塔米尔河流域整整搜寻了一天一夜，也没有发现噶尔丹的影踪。索额图和明珠都不禁大失所望地想：莫非，噶尔丹又逃跑了？或者，噶尔丹已经投河自尽？
噶尔丹确是自尽的，不过不是跳河而死，而是服毒自杀。他死后，他的亲兵依据他的遗嘱，将他的尸体埋在了河边的沙地里。但是，也许是噶尔丹的那几个亲兵太过匆忙，没能将噶尔丹的尸体埋得深些。所以，在清军到达塔米尔河流域的第二天上午，清军的骑兵在河边上跑来跑去的，马蹄子在沙滩上刨来刨去的，不知怎么，就把噶尔丹的尸体给刨了出来。这一下子可了不得了，索额图和明珠的手下，马上飞奔过去向各自的主子报告。
可以想像得出，索额图和明珠在听到发现噶尔丹的尸体后是何等的欣喜万分。两人就像是射出弓的箭一般，“嗖”的一声就几乎同时冲到了噶尔丹尸体的旁边。
明珠的岁数虽然比索额图大二三岁，但动作却似乎比索额图快捷。刚到噶尔丹的尸体旁，他就“呼”的一声跃下马来，仗剑便要去割噶尔丹的脑袋。但明珠的剑碰到的并不是噶尔丹的首级，而是索额图从对面伸过来的剑。显然，索额图的动作也不慢。
明珠似乎很是愕然地问道：“索大人，你这是何意？”
索额图冷冷地反问道：“明大人，你这又是何意？”
明珠哼道：“明某的手下发现了这叛贼的尸体，明某来取他首级，天经地义！”
索额图也哼道：“分明是索某的手下发现的这具尸体，明大人又何必强词夺理？”
明珠回头冲着自己的亲信们吼道：“你们说，究竟是谁先发现的这具尸体？”
那些亲信们齐声回道：“是属下首先发现的！”
明珠笑问索额图道：“索大人，你可曾听见？”
索额图不甘示弱地也回头冲着自己的亲信们喝道：“你们说，到底是谁先发现这具尸体的？”
那些亲信们同声应道：“是属下首先发现的！”
索额图笑问明珠道：“明大人，你可曾听见？”
明珠的剑动弹了一下：“索大人，你今日成心与我明某过不去啊！”
索额图的剑也动弹了一下：“明大人，是你成心跟我索某过不去！”
两边的亲信一个个都剑拔弩张。只要索额图或明珠再挥挥手，一场流血冲突便不可避免。清军中几个将领闻讯，慌忙一起跑过来，劝索额图和明珠千万要冷静。末了，几个将领在征得了索额图和明珠的同意后决定，由他们另派人手，将噶尔丹的尸体完整地抬回去，恭请皇上圣裁。
见了康熙，索额图和明珠各执一词，互不相让，都说是自己首先发现噶尔丹的尸体的，甚至，二人还当着康熙的面，大吵大闹起来。
康熙愕然问道：“两位爱卿，你们一个是朕的左臂，一个是朕的右膀，平日里情投意合、从不计较，为何今日，为了一个叛贼的首级而争得不可开交啊？”
索额图的脸上，满布委屈之色：“皇上，不是微臣想与明大人抢这份功劳，实是微臣首先发现的噶尔丹，当立头功啊！”
明珠立即言道：“皇上，索大人强抢功劳不说，还当着皇上的面冤枉微臣，微臣恳请皇上明察……”
索额图刚想说些什么，康熙制止了：“好了，两位爱卿，你们不要再争了。叛匪噶尔丹残部已经全部剿灭，这份功劳，朕给你们一人记上一半如何？”
康熙既如此说，索额图和明珠就是心中再有不满，也不便当面说。不过，从此以后，索额图和明珠之间的关系，就再也不像过去那般融洽了。
公元1697年的年底，在奏请了康熙皇帝的恩准后，明珠在京城为自己过了五十大寿。
明珠做寿，自然不是一件小事。说整个京城都被惊动了、轰动了，是一点也不夸张的。虽然明珠在向康熙奏请时言称：“微臣过寿，绝无声张之意。”但实际上，满朝文武，包括京畿一带的大小官员，哪个不得向他明珠送一份厚厚的寿礼？就是那些大大小小的皇阿哥，也不敢怠慢，或派人去明珠府上献礼，或亲自到明珠府中恭贺。这其中，以四阿哥胤禛给明珠的印象最深。这倒不是说，四阿哥胤禛给明珠送的寿礼有多么贵重，而是因为，在明珠做寿的日子里，胤禛为明珠鞍前马后、跑上跑下的，着实勤劳，也着实让明珠感动。不知情的人还会以为，胤禛不是什么皇子，而是明珠的一个仆役。这个“仆役”，今年刚交二十岁。
按常理，明珠的这个五十大寿，虽然“绝无声张之意”，但最终的结果，明珠应该是相当满意的。不说别的，就康熙皇帝所送的那件黄马褂，也足以让明珠有充分的理由感到风光和自豪了。然而，不知何故，五十大寿一过，明珠就显出闷闷不乐的神情来。
这一日，大概是明珠过了五十大寿后的第三天，晚上，明珠在几个侍从的搀扶下，醉醺醺地回府。黄昏时候，有几个亲信邀明珠上街喝酒，明珠因为心中有些不快，就多喝了几杯，喝成了一副醉眼朦胧、踉踉跄跄的模样。
快到府宅门口时，明珠突然打住了步。他对搀扶他的那几个侍从道：“你们快看，前面有一个人，鬼鬼祟祟的，莫不是……刺客？”
那几个侍从一听，赶紧将明珠护住，并四处地观瞧，可观来瞧去，除了不远处有一株枯瘦的老树外，并无任何人的影踪。
一侍从紧张兮兮地问明珠道：“大人，那刺客何在？”
明珠眨巴眨巴眼：“我刚刚分明看见那刺客就在前面，怎么这会儿……不见了？”
几个侍从紧急商量后，由三四个侍从护定明珠，另一个侍从蹑手蹑脚地朝明珠府宅的大门摸去，准备叫府内的侍卫出门来迎接。可那个侍从刚走到那株枯瘦的老树边，一个人影便从那树后走出，那个侍从一下子就吓瘫在了地上。那个人影，显然比那一株老树还要枯瘦。
护定明珠的那几个侍从一见，急忙颤抖着向明珠报告道：“大人，果然有刺客……”
因为是冬天，虽然明珠饮酒有些过量，但经大街上冷风这么一吹，他的大脑便多少有些清醒。只见他，推开几个侍从，一个箭步就向那株老树跃去，一边跃一边叫道：“大胆刺客，竟敢来行刺本大人，看本大人不好好地教训你！”
甭看明珠已经五十岁了，但手脚却异常地利索。要知道，在康熙年少时，明珠和索额图都是康熙身边数一数二的高手侍卫，为康熙生擒鳌拜立下了汗马功劳。只是此刻，因为酒喝多了，明珠的手脚虽仍很利索，但身形却未免有些飘忽，远远地看去，明珠就像是在打醉拳一般。
就在明珠的拳脚即将击中那人之前的一刹那，一个身影飞快地介入，硬是将明珠的拳脚隔开，并迅速地站在了明珠和那个人的中间。
明珠定睛这么一看，隔开他拳脚的不是别人，正是他府内的侍卫头目固里。许是固里听到了府外有动静，便迅速打开府门，冲到了明珠的身前。仅固里这一手快捷如飞的动作，便可以看出，在武功造诣方面，固里绝不是等闲之辈。
原来，一直躲在老树背后之人，正是康熙的皇四子胤禛。按常理，胤禛被明珠拳脚这么一惊一吓，至少应该有些慌乱，若不是固里及时拦阻，他恐怕就要一命呜呼了。然而，纵然现在是白天，也看不见胤禛的脸上有什么慌乱之色。这份处变不惊、镇定自若的功力，寻常人确实难以企及。
由固里引路，明珠相陪，胤禛笑容可掬地迈进了明珠的府宅。来到一间客厅，分宾主坐下，仆人敬上香茶之后，胤禛先是呷了一口茶，然后轻轻地反问明珠道：“明大人过完五十大寿后的这两天来，为何闷闷不乐？”
明珠闻言一怔，继而微微叹息道：“四阿哥，明某虽不才，但承蒙皇上和满朝文武错爱，明某的五十大寿过得倒也有模有样。尤其是四阿哥，为明某忙上忙下，明某实在感激不尽！可是，有那么一些人，对明某简直是不屑一顾。明某事前早就派人去邀请他们来参加寿宴，可他们根本置之不理，甚至连个招呼也不打。他们这样做，分明是瞧不起我明某啊！既有人瞧不起我明某，我明某又如何能开心起来？”
胤禛又呷了一口茶，然后问道：“明大人口中的他们，所指何人啊？”
明珠一脸的苦笑：“四阿哥，你这岂不是明知故问？明某的寿宴，自始至终你都在场。哪些人看不起我明某，四阿哥还不清清楚楚？”
胤禛淡淡一笑道：“明大人莫非说的是索大人和太子殿下？”
明珠深深地叹了口气，但没有言语。原来，明珠之所以在过完五十大寿后有些闷闷不乐，其原因，正是由于索额图和胤礽。明珠只知道索额图和胤礽对他的五十大寿不闻不问，却不知道索额图和胤礽这么做的原因。实际上，明珠只要仔细地想一想便会发现：连康熙皇上都给他明珠送礼了，索额图和胤礽又何必公开与他明珠过不去？
事实是，索额图和胤礽本来都是准备给明珠送礼的，甚至，索额图还准备去参加明珠的寿宴。只是后来有一个人既含蓄又巧妙地向索额图暗示：明珠不欢迎索额图和胤礽去祝寿。索额图想想自己与明珠之间的过节，觉得此话非常可靠，一气之下，便和胤礽取消了准备给明珠送寿礼的打算。
此刻，胤禛见明珠深深地叹了口气后不言不语，便很诚心诚意地问道：“明大人，既然索大人和太子殿下如此瞧你不起，你何不找他们好好地理论一番？在我看来，明大人是当朝的栋梁，为大清国立下了不朽的功勋，索大人和太子殿下应该是没有什么理由轻视明大人你的……”
胤禛所言，明珠大受感动：“四阿哥，明某何尝不想找他们好好地理论一番？可是，他们一个是当朝的太子，一个是太子的叔爷，又都同皇上有着非常密切的关系，明某纵然去找他们理论，又能理论出什么结果来？”
胤禛理解似的点了点头：“明大人所言，虽有些无奈，却也是实情。看来，我今夜在此，也纯属多余了……”
明珠赶紧问道：“四阿哥此话怎讲？”
胤禛低低地道：“因为，有一件事情涉及到索大人和太子殿下，而明大人对索大人和太子殿下……几乎毫无办法……”
明珠一震：“莫非，正是他们二人要伤害于我？”
胤禛顿了一下，煞有介事地道：“明大人，他们不是在背后说你的不是，而是在我的父皇面前公开说你的不是！”
明珠“啊呀”一声：“四阿哥，他们在皇上的面前，究竟如何说我？”
胤禛道：“他们在皇上的面前，主要说了你两点，一是说你太贪，是个大贪官，一是说你太奸，是个大奸臣……”
“这……”明珠满腔的酒气和怒气似乎都要从眼睛里和鼻孔里喷出来、冒出来，“他们，怎么敢在皇上的面前如此无中生有、造谣诽谤？他们如此做，岂不是想把我明某置于死地？”
自与胤禛“密谈”之后，明珠对索额图和太子胤礽一直耿耿于怀。
公元1698年的春天，春寒料峭的一天夜里。明珠在侍卫头目固里及一干侍从的簇拥下，摇摇晃晃地从大街上往自家转悠。今日是固里的大喜之日，固里的新娘便是明珠的一个贴身女侍。明珠特地在大街上包了一家上等饭庄，又特地邀请了数十位朝中大臣，为固里的喜宴增光添彩。席间，几个大臣向明珠谈起，说是当今皇上越来越倚重索额图了，甚至到了唯索额图之言是听的地步。明珠是越听越气，越气就越喝酒。至喜宴席散，明珠早已是头重脚轻了。
不过，明珠虽然喝得头重脚轻，却也还能行走。甚至，明珠的头脑还比较清醒。因为，他在走到一个宽大的巷口时，对身边的一干侍从吩咐道：“你们就在这里等我！”说着，便趔趔趄趄地走进了身边的那条宽大的巷道。
明珠为何要在这么一个春寒料峭的夜晚走进那条巷道？原来，明珠趁着酒劲儿，要去索额图的府宅“拜访”一下。索额图的府宅就在这条巷道之内。索宅和明宅，都是康熙皇上所赐。
明珠走到了那两扇红彤彤的大铁门近前，两只同样红彤彤的灯笼几乎把明珠映得一片红。一个家人识得明珠，赶忙趋前一步，冲着明珠躬身问道：“明大人是否要找我家大人？”
明珠没好气地道：“不错！你快把大门打开！”
那家人陪着笑脸道：“请明大人稍候，我家大人说了，任何人来此，都要先行通报一声……”
明珠哼道：“你家大人好大的架子！莫非，当今皇上来此，你也要先行通报一声？”
那家人慌忙言道：“明大人误会了……只是我家大人正在忙碌，小人先行通报一声的目的，是想让我家大人前来迎接明大人……”
明珠冷冷地道：“不必了！我明珠没有你家大人那么大的架子。你只需打开大门，领我去见你家大人便是。”
听到明珠如此说，那家人便不敢怠慢，忙着推开大铁门，领着明珠走进去。虽是夜晚，但索府的大院内却灯火通明、亮如白昼。尽管明珠对索府大院内的景致不感兴趣，但明珠却也看出，今晚索府内定有什么不寻常之事。因为，明珠看见，亮如白昼的索府大院内，几乎人来人往、络绎不绝，且多是索府的家人领着一二年轻女子在来回地走动。明珠看得真切，有些年轻女子的腮边，还分明挂着泪水。
明珠不由得暗自思忖道：“索额图一下子变得如此好色了？不然，索府内的这些年轻女子又来作什么？为何有些年轻女子的表情会那么痛苦？”
于是，明珠就催促那个领路的家人道：“快带我去见你家大人！”
那家人唯唯诺诺，几乎一溜小跑起来。明珠不顾，甩开大步，寸步不离地跟上。纵然如此，明珠还是嫌那家人走得太慢。
终于，那家人在一间屋子的门口止住了脚步，扯开嗓门吆喝道：“明珠明大人到！”
只见索额图，斜倚在一张太师椅上。他的对面，抖抖索索地站着两个年少的女子。听见那家人吆喝，索额图不觉一怔。可还没等索额图欠起身来，明珠就早跨进了屋内。
跨进屋内的明珠，先是瞟了一眼那两个女子，然后笑嘻嘻地问索额图道：“索大人，明某不期而至，该不会打搅你吧？”
索额图说道：“明大人，打搅倒谈不上，只是索某略有惊讶，你明大人酒气熏天的，跑到敝宅来有何贵干？”
明珠回道：“索大人许是太多虑了吧？明某只是路过，顺便到贵府来与索大人打个招呼，并无别样意图。”
索额图“嘿嘿”一笑道：“索某感谢明大人的这番盛情厚意。只是招呼已经打过，明大人应该打道回府了！”
索额图是在下逐客令。但明珠却一屁股坐在了一张椅子上，口中称道：“明某回去也无甚大事。倒是见贵府内仕女如云，想留下来看看热闹！”
索额图有些不耐烦了，更有些不高兴了：“明大人，莫非在你的眼里，我索宅只是一个看热闹的地方？”
明珠打了个“哈哈”道：“索大人误会了吧？明某的意思是，贵府今夜着实热闹，不然，何来的这么多年少美貌的女子？”
索额图懒洋洋地在太师椅上动了动身子，然后一指面前的那两个少女，斜视着明珠道：“明大人要看热闹，尽管看好了，索某决不会干涉！”
明珠啖啖眼，又揉了揉鼻尖，然后讪笑着问道：“索大人，今夜贵府来了这么多妙龄女子，莫非……都是索大人自己享用，原来索大人也是如此地好色啊？”
索额图的脸色顿时变得十分难看，声音也变得十分难听：“明大人说话可否多多地斟酌些？你适才究竟是在说谁好色？你就不怕闪了你明大人的舌头？”
听这话，明珠朦朦胧胧地意识到，索额图既然不是在为自己选美女，那就一定是在为别人选美女，而能让索额图为之选美女的人，当然不会是一般的人。莫非……
明珠不觉一惊。如果是当今皇上让索额图为之选美女而又不让他明珠知道，那就充分说明，在康熙的心目中，索额图远比明珠重要。或者说，康熙以为，索额图要比明珠值得信赖。
索额图见明珠默然不语，便笑哈哈地问道：“明大人，这热闹，你还看不看了？”
明珠勉力挤出一丝笑容：“索大人为皇上办事，明某岂敢耽误？明某这就告辞……”
明珠说罢，匆忙离座，就要往屋外走。索额图却道：“明大人，谁跟你说索某是在为皇上办事了，其他的人就不能挑选美女了吗？”
明珠马上便醒悟过来。索额图口中的“其他的人”，不会是别人，只能是太子胤礽。所以，明珠就“哈哈”一笑道：“索大人，闹了半天，原来你只是在为太子挑选美女啊，还如此地兴师动众！”
索额图当即喝道：“明大人，你说话休得狂妄。索某为当今太子挑选王妃，如何叫兴师动众？你明大人眼里，还有没有当朝太子？”
“索大人，”明珠重重地道，“太子挑选王妃，本来无可厚非，但此事宫中自有安排，又何劳索大人亲自过问？索大人如此做，岂不有小题大做，越俎代庖之嫌？”
索额图冷冷地问道：“明大人，你适才说，太子殿下挑选王妃，是小题大做之举？”
实际上，明珠只是说索额图为太子挑选王妃是小题大做，并未说太子挑选王妃一事本身。但明珠却顾不了那么多了，头一扬，脖子一梗，毫不拖泥带水地回道：“便这样说了又待怎的？就是面见皇上，明某也不惧！”
索额图厉声喝道：“明大人，难道你连当今皇上也不放在眼里吗？”
明珠毫不示弱地回道：“不把当今皇上放在眼里的人不是我明某，而正是你索大人。你索大人背着皇上在自己的家中偷偷摸摸地为太子挑选美女，岂是把皇上放在眼里的做法？如果皇上知道了这一切，会作何感想？又会如何处置你索大人？”
索额图颇有意味地问道：“这么说，明大人是想在皇上的面前告我索某一状了？”
明珠豪气十足地回道：“不错，明某正有此意！明某不仅要告你索大人一状，而且还要参太子一本！”
“哦？”索额图眉头一皱，“明大人的口气不小啊！你果真要在皇上的面前状告索某和太子殿下？”
明珠义正辞严地道：“明某身为朝中大臣，不能对今日之事视若无睹，更不能不闻不问！”
索额图一本正经地点了点头：“那好，明大人，如果索某现在把太子殿下请来，你可敢当面与他论说？”
