罗德里戈-鲍吉亚是由叔叔、教皇卡利特斯三世引上神职之路的，后者任命他为红衣主教兼教堂副主管；后来罗德里戈一直登上了教皇宝座，成为教皇亚历山大六世；然后他又任命自己的私生长子吉奥瓦尼为公爵兼红衣主教，其私生次子恺撒为大教主；传说其女儿卢克西娅第一个孩子的父亲不是罗德里戈就是恺撒。在当时罗马世俗政权沦入腐败贫困之时，梵蒂冈罗马教廷就成为了暂时的权力中枢。
后来，吉奥瓦尼死于暗杀，很可能就是被恺撒杀死的。当其父去世之后，恺撒就被新教皇流放并关押，很快也死于非命。
为了对被谋杀的吉奥瓦尼有所补偿，他的儿子胡安-鲍吉亚于1671年被封为“圣徒”———圣弗朗西斯-鲍吉亚。
15世纪的鲍吉亚家族堪称最早的黑手党家族。他们和如今所有黑手党家族一样只顾自己的利益，用不义之财铺路，而且杀人不眨眼。但在宗教方面，他们却摆出伪善的样子，他们家的暴徒几乎从来都没有错过一次弥撒。罗德里戈-鲍吉亚当上了教皇亚历山大六世，他的统治期以谋杀、贪婪和****闻名于天下，而他是历史上最为声名狼藉的教皇之一。他崛起的过程，造就了他波澜壮阔的职业生涯中最令人毛骨悚然的一章。
罗德里戈-鲍吉亚早就声明自己具有成为文艺复兴时期伟大教皇的素质。据说他第一次杀人时才12岁，那次他用刀子捅死了一个同龄的男孩。他的叔叔，教皇卡利斯图斯三世在罗德里戈25岁的时候任命他为红衣主教，并给他谋了个教廷副大法官的职位，让他在教廷中初步确立了地位。托他叔叔的福，罗德里戈的腰包很快地鼓了起来。
当时有人写道："他非常富有，而且他对各国国王和君主都具有很大的影响力。他已经在圣安杰洛桥和菲奥里中心广场之间的地段盖起了一座美丽舒适的宫殿。他的巨额收入来自教廷的职位、他在意大利和西班牙拥有的修道院，以及他的3个教区瓦伦西亚、波图斯和卡塔赫纳……他的碗碟镶着金饰，他的衣物都由绣花丝绸做成，他的藏书特别符合帝王或教皇的身份。我就不再赘述他那些豪华的床饰、马具和其他的金银珠宝、绫罗绸缎了，更不必说他拥有的大量金币了。"
罗德里戈-鲍吉亚的财产为他日后购买教皇职位的行动大开方便之门。同时，他把自己当做教廷的统治者，和情妇瓦诺扎-德-卡塔内（Vannozza de Catanei）过起了骄奢淫逸的生活。他先前的艳史已经给他留下了不少孩子，而瓦诺扎在此后的20年里又给他添了4个私生宝贝。其中的切撒尔-鲍吉亚（Cesare Borgia）和卢克利齐娅-鲍吉亚（Lucrezia Borgia）和他们的父亲一样成为了闻名遐迩的小黑手党。
虽然罗德里戈对瓦诺扎情深意切，但他对一夫一妻制还是退避三舍，一如他对禁欲主义的态度。他的叔叔卡利斯图斯三世对他的丑事睁一只眼闭一只眼，但在卡利斯图斯三世1458年去世以后，下任教皇庇护二世就觉得看不过去了。虽然庇护二世本人也在床上勤为耕种，并生了两个孩子，但他仍然为红衣主教鲍吉亚的行为感到震惊。
庇护二世在听说了鲍吉亚某晚的纵欲狂欢之后提笔给他写了封信："孩子，我们闻悉4天以前有几个锡耶纳的女人聚集在乔万尼-迪-比齐斯（Giovanni di Bichis）的花园里。她们简直是人间放荡的极品，而你则忘了自己的身份与地位，和她们从下午一直厮混到晚上。像你这般年岁的神职人员应该时刻把自己的尊严和职责铭记在心。我还听说那天艳舞不断，****声声，而你对这一切则相当驾轻就熟。提到这些事情都让我觉得羞耻，不但因为这种行为本身性质恶劣，而且它和你的地位极为不相称。你为了满足自己的****，把那些女子的丈夫、父亲、兄弟和其他亲戚拦在了门外……整个锡耶纳城都在谈论那个荒唐之夜……我的不快已经无法用语言形容……红衣主教应该是洁白无瑕的。"
红衣主教鲍吉亚在频繁混乱的狂欢间歇中，继续大把捞钱。他收受别人的钱财并免去他们的罪责，有的时候他甚至会放过最凶狠的罪行。他曾经用受贿的方式放过了一个杀死了自己女儿的父亲。当别人对此颇有微词时，他反驳道："上帝的旨意并不是让罪人去死，而是让他们活着并为自己的罪孽付出代价！"
鲍吉亚的财产除了可以为自己搞到教皇的职位之外还绰绰有余。虽然教皇不再由罗马的望族或天主教国家的君主们提拔上任了，但选举教皇的主教们会收取大量贿赂。在1484年西克斯图斯四世去世以后举行的教皇选举会议上，鲍吉亚败给了著名的巫师杀手英诺森八世。然而，1492年英诺森八世作古以后，鲍吉亚卷土重来，这次他说什么也不想再和世界上最有权威的皇位擦肩而过了。结果这次参选差点儿让他破产。
竞争十分激烈，但鲍吉亚财大气粗。他曾吹牛说他家的金子能堆满整个西斯廷大教堂。虽然他是个不讨人喜欢的外国佬（鲍吉亚和他的叔叔卡利斯图斯三世都是西班牙人），但是他开出的价格却让不少冷酷的罗马主教们感觉良好。
可是他也碰上了一个十分顽固的对手。红衣主教阿斯卡利奥-斯福尔扎（Ascario Sforza）同样家财万贯，而且他来自米兰公国的统治家族，所以他的靠山更硬。鲍吉亚把斯福尔扎叫到一旁，直白地问他需要多少钱才愿意退出。斯福尔扎最后同意在教廷担任副大法官，并接受一笔巨款。第二天，满载金条的骡子队一路向斯福尔扎的豪宅进发。现在鲍吉亚还需要一张选票，不过这一张他也从威尼斯主教手中买到了。虽然威尼斯主教拿的钱和鲍吉亚付给别人的比起来不过是个零头，但对那个96岁的老主教来说，他这辈子也没几天可以享乐了，所以他也挺知足。
选举如期进行，罗德里戈-鲍吉亚不出所料地获得了胜利。新当选的教皇亚历山大六世无法抑制内心的喜悦，他在法衣加身的时候激动地喊着："我是教皇啦！我是教皇啦！"乔万尼-迪-美第奇（Giovanni di Medici）（后来的教皇利奥十世）曾评论道："我们被世界上最野蛮的恶狼抓住了，我们或者逃跑，或者被他生吞活剥。"
亚历山大六世以贿选得任。力图扩张教皇国势力，控制全意大利政权，为此常采取贿赂，暗杀等手段。1493年颁发通谕，为葡萄牙和西班牙划定了扩张殖民势力的分界线，即“教皇子午线”。
1492年，红衣主教罗德里戈-鲍吉亚当选为教皇亚历山大六世，此时的卢克利齐娅已经12岁了，她受到精心呵护，低调而快乐的生活走到了尽头，她和她的亲人都被推上了政治舞台。
