(1914年—1931年)
1914年(民国3年)，冯玉祥32岁
春，冯随北洋政府任命的“剿匪”督办陆建章(冯之岳父)由河南入陕，镇压白朗领导反对袁世凯的农民起义军。时冯任警卫军左翼第一旅旅长兼第一团团长。
5月末，冯部又奉命改编为警卫军第十四旅，冯仍为旅长。
6月初，冯率部经河南渑池、陕州入潼关，进至陕西临潼。
当时白朗讨袁义军已到达甘肃，涉过渭河，占据天水以西各地。冯奉命会同警卫军第八师和赵倜的毅军“协剿”白朗起义军。冯将至甘肃泾川，白朗义军折而东进，复回攻陕西，一时长安震动。遂急调冯部回援，未曾到达长安，白朗义军已由子午谷入山，并出荆紫关再转战豫西一带。6月末，冯部经临潼、灵宝循原路回驻陕州。
8月，白朗在其家乡河南宝丰战死，起义军溃散。时陆建章已代张凤翔接任陕西督军，冯部又奉调开赴长安，分驻关中各县。
10月，冯部改编为第十六混成旅，冯为旅长，蒋鸿遇为参谋长，归北洋政府直接指挥。冯成立模范连，开始对部队施以严格的正规教育。同年，冯玉祥接受牧师刘芳的洗礼皈依基督教，被称为“基督将军”。
11月，四川发生兵变，为免波及陕南，冯奉命率部进驻勉县、褒城，担任陕南镇守使。冯仍留一营驻长安，一营驻风翔。
冯驻陕南时，大力练兵，并编写《精神书》，以传统道德、基督教义和爱国精神教化官兵，以维系部队的团结和提高战斗力。
1915年(民国4年)，冯玉祥33岁
是年，袁世凯积极筹备帝制。1月18日，日本利用袁称帝心切的心理，向袁提出了企图灭亡中国的“二十一条”，以此作为支持其称帝的交换条件。
2月，袁世凯为控制四川，派心腹将领陈宦取代胡景伊为四川督军。陈宦率李炳之的第一混成旅及汪祥祯的中央第四混成旅入川。袁世凯又令冯玉祥的第十六混成旅进驻川北。
陆建章为保留陕西地盘，令冯入川，但留两团人马驻勉县、长安、凤翔一带。
6月，冯在四川阆中时，连续收到陕西和成都方面来电拥护袁世凯称帝。冯断然拒绝“北洋三杰”之一的王士珍领衔的北洋军官通电上签字。这个通电是拥护袁世凯称帝的，除冯外，整个北洋系统少将以上的军人统统列名。
12月25日，蔡锷在云南组织护国军，举兵讨袁。冯玉祥经与部下张之江、蒋鸿遇、李鸣钟协商后，与蔡锷取得联系。
1916年(民国5年)，冯玉祥34岁
袁世凯公然恢复帝制，激起全国人民的无比愤怒和强烈反对，不仅蔡锷军在云南举起讨袁大旗，而且贵、桂、湘、川等省也纷纷响应。5月22日，冯玉祥逼迫陈宦宣布四川独立，改编部队为护国军第五师，挫败了袁称帝的阴谋。6月6日，在全国人民的唾骂声中，袁世凯忧病而死。
7月，冯玉祥为避免所部被长期分隔于川、陕两地的危险，在未经皖系中央同意的情况下，毅然由四川剑阁北上，率部抵达汉中。到汉中后，冯玉祥招集留陕的旧部回到十六混成旅序列。
9月，冯率部离汉中取道汉水，经襄阳、樊城到汉口，又转乘火车北上廊坊，从而结束了驻陕入川的3年历史。
1921年(民国10年)冯玉祥39岁
北洋政府派冯玉祥率领第十六混成旅协助新任陕西督军阎相文入陕，并驱逐皖系原督军陈树藩离陕。
6月，冯部入长安。
7月，冯部进驻咸阳，陈树藩逃往汉中。
8月，奉北洋政府令，第十六混成旅扩编为陆军第十一师，冯任师长。冯按阎督军手令，在西安讲武堂诱杀原陕西靖国军第一路司令郭坚。
8月23日夜半，陕督阎相文服毒自杀。8月25日，冯被北洋政府任命为陕西督军，为统一全省军令，整顿陕局，减轻人民负担，将原陕西靖国军中实力较强、军纪较严的第四路胡景翼部改编为暂编陕西陆军第一师，开出关外，驻防京汉路顺德、彰德一带。并宣布吴新田为陕南镇守使，率部开往汉中，肃清陈树藩残部。
冯在任陕督时，深感原督军署建筑带有较浓的封建气息，且与军队驻地相距太远，与民众更其隔阂。于是选择荒无人烟的旧皇城(明代秦王府)为驻兵之地，冯亲率卫队营士兵即在此地修建新督署。
冯任陕督时，有两个外国人在陕境内自行打猎，经冯严厉指责，并行处罚，扫了洋人之威风。
冯玉祥与省长刘镇华会衔颁布治陕大纲十条。冯还下令筹设陕西图书馆，并委任郭希仁为馆长。
冯积极倡导建筑道路，在西安城内，发动军队修了一条连接东、西城20里的大道。并以西安为中心，修建四条大道，并在“西潼大路两旁，栽植杨柳，每隔二丈一株，每五里处设堡，由民团驻守，每造房三、五间，既便利往来行旅，又能保护路旁树木”。
12月初，冯部消灭了盘踞陕南的陈树藩残部。
1922年(民国11年)，冯玉祥40岁为整顿各县小学并补助办学经费颁布命令。
4月，督、省两署会衔通令：不准强拉车辆，影响民生。
冯在西安南院门广场，建造五间大厅，题为“自省堂”，每周在此作礼拜，讲道查经，及作临时集会用。
4月，奉系张作霖在日本支持下，取得北京政权。冯奉令统率所部出关参加第一次直奉战争，这正是冯所希望向外发展的机会，接电后三小时内即将部队调度完毕。4月19日，冯率部第十一师陕西督卫队团及中央第四旅、陕西暂编陆军师第一师、陆军第一、三混成旅，由陕出发，向洛阳方面集中。
陕西治安交给省长刘镇华主持。出潼关时，每个官兵臂章上都写有“害民贼，瞄准打”的醒目字样。
10月，奉大总统令，冯加陆军上将衔。
1925年(民国14年)冯玉祥43岁
1月，冯被段祺瑞政府任命为西北边防督办，所属部队称西北边防军。冯举荐在西北回族中颇有声望的绥远都统甘籍将领马福祥为会办。甘肃督军陆洪涛因病辞职，北京政府委冯玉祥兼甘肃督军。
3月，孙中山卧病北京协和医院，冯玉祥让夫人李德全前往探视。孙中山当即以《三民主义》、《建国大纲》和《建国方略》相赠，冯嘱手下官兵必读此书。
马福祥也于北京谒见孙中山，表示愿接受中山先生的领导。
3月12日，孙中山病逝北京。冯下令所属部队持服七日，以示哀悼。
7月—8月，冯玉祥遣国民军二师师长刘郁芬部入甘，马福祥请冯收编其子侄的部队。马鸿逵由原驻地磴口移防于石嘴山，并任国民军新编第七师师长。
10月，代理甘肃督军刘郁芬在兰州诱杀反对国民军入甘的原陆洪涛所部旅长李长清、团长包玉祥，并拉拢李部参谋长魏鸿发改编李部。
1926年(民国15年)，冯玉祥44岁
2月，刘镇华率10万镇嵩军围攻西安，在国民军二军李虎臣、三军杨虎城统率下，西安军民坚守城内。
9月15日，冯在考察苏联三个月后回国。同行的有苏联顾问乌斯马诺夫和中共党员刘伯坚以及李兴中、任右民、何其巩等人。
9月17日，冯玉祥行至五原，召集旧部，率领全军誓师，就任国民军联军总司令，并接受中共北方区委负责人李大钊的建议：“固甘援陕，联晋图豫”。准备进军陕西，解西安之围后，再出潼关，策应武汉北伐之师。
同月，冯玉祥组建总司令部，并决定由以下人员组成：
鹿钟麟为总参谋长，何其巩为秘书长；
李兴中为参谋处长，陈连富为副官处长；
徐廷瑗为军务处长，宋式颜为军械处长；
过之瀚为军需处长，张吉庸为军法处长；
张允荣为内防处长，薛笃弼为财政委员长；
石敬亭为政治部长，刘伯坚为政治部副部长。
另外，冯还从中共党员中选拔政工人员分赴各军师成立政治处，负责人包括宣侠父、钱崝泉、邓小平等。
10月，冯玉祥部分十路大军，由甘、宁、陕等地进军西安。
11月27日，国民军联军先头部队攻进西安，刘镇华部溃退，西安城解围。
冯玉祥任命原靖国军总司令于右任为国民军联军驻陕总司令，邓宝珊为副总司令。
1927年(民国16年)，冯玉祥45岁
1月，冯率总司令部全体人员往平凉入西安，命令部队将守城期间死难军民聚葬于西安东北隅空地，分为东、西两大冢，称之为万人冢。冯召开隆重的追悼会，后将其地辟为“革命公园”，勒石纪念。
冯在西安成立西北军政学校，命名为中山学院，培养人才。该校中中共党员史可轩、续范亭等先后任校长；邓希贤(小平)、唐澍、许权中、高克林均在该校任领导职务，刘志丹、高岗等任教官。
对隐居陕西富平的杨虎城，冯特派姚维蕃持亲笔函赴三原劝驾，请其出山，杨为冯感动，令到即行。
2月，冯电各将领，委刘郁芬为国民军联军驻甘总司令。
3月，武汉国民政府特派简又文、郭春涛、邓飞黄、黄少谷等为西北军政治工作委员会委员，先后到西安。冯委任简又文为总司令部交际处处长，郭春涛为政治部副部长，邓飞黄为政工人员训练班主任。
同年春，冯派简又文收回由英人纽满主持的陕西邮政管理权。邮局改悬青天白日旗，所有业务统归国民军联军总司令部管辖。
2月—3月，冯公布各军政长官十条通令和告诫高级军官十条，以洗刷军阀制度恶习，具有重要意义。
5月1日，国际劳动节之际，冯就任国民革命军第二集团军总司令，在西城墙开一缺口，命名为“玉祥门”。
7月，中共党员宣侠父来甘，主持改组国民党甘肃省党部事宜，成立新的国民党甘肃临时党部，并组建中共甘肃特别支部。由宣侠父、钱崝泉、张一悟负责。
8月，兰州发生国民党左派与右派争夺临时党部权的“皖江会馆”事件。宣侠父赴甘南，解决拉卜愣寺问题。
5月6日，冯部由西安进驻潼关。
冯在潼关督师后，适逢李大钊等20名中共党员被奉系军阀张作霖杀害于北京，噩耗传来，冯命全军带孝三日，在潼关召开隆重的追悼大会。会后，冯执笔写下了悼李大钊长诗，并勒石于潼关。
6月，武汉政府和国民党中央任命冯玉祥为豫陕甘三省政治委员会主席。
同月，冯玉祥和汪精卫、蒋介石先后通过“郑州会议”和“徐州会议”达成协议，冯促成宁汉合流，并决定在所属军政人员中进行“清党”活动。
8月，开始在其辖区进行“清共”，除电陕西石敬亭、李兴中并通饬各县彻底取缔共产党外，首先把军中之共产党员集中于开封，送出武胜关了事。
同年冬，冯军在豫东与奉系军阀激战，冯特任命杨虎城为归德镇守使。
年底，冯玉祥发通电，公布治理豫、陕、甘三省施政要点七项。
1928年(民国17年)，冯玉祥46岁
2月，奉军张作霖在退回关外时，被日本关东军炸死于沈阳皇姑屯车站。
8月，国民党在南京召开二届五中全会，声称全国由“军政时期”进入“训政时期”。
10月，冯向南京国民政府提出甘、宁、青分治建议，年底三省分治，成立省政府。
1929年(民国18年)，冯玉祥47岁
3月下旬，冯为抵制编遣会议，避居华山，邵力子、贺耀祖先后赴华山谒冯，冯佯称出兵13万相助，以韩复榘为总指挥，进行军事部署，实际上是先作壁上观，待蒋桂一败一伤，再收“卞庄之虎”之利。
4月，杨虎城在南京面见蒋，并将所部改编为国民革命军暂编十四师，离冯附蒋。
5月19日，冯在陕西华阴召开军事会议，列举蒋四大罪状。通电讨蒋，以“护党救国”为旗号，自任“护党救国军西北路总司令”，指挥所属各部。
6月，冯部下韩复榘、石友三叛冯拥蒋。
冬，马鸿宾被任命为“护党救国军”第四方面军第七军军长。马福祥受蒋派遣赴华山游说冯，被冯扣押。
1930年(民国十九年)，冯玉祥48岁
1月，冯以宁夏地方不靖，委马鸿宾为宁夏省主席。
3月30日，冯玉祥由山西回潼关，就任中华民国陆军副总司令。中原大战开始。
1931年(民国二十年)，冯玉祥49岁
8月，马鸿宾就任甘肃省主席，冯玉祥策动原部下旅长雷中田扣押马，演出“雷马事变”，后雷失败。冯想回到甘肃的愿望落空。
